Name : SAMSHR1132_18490 (SAMSHR1132_18490) Accession : YP_005326353.1 Strain : Staphylococcus aureus MSHR1132 Genome accession: NC_016941 Putative virulence/resistance : Unknown Product : succinyl-diaminopimelate desuccinylase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 3.5.1.18 Position : 2015903 - 2017126 bp Length : 1224 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGACAACTTTTAGCGAGAAGGAAAAAATTCAATTATTAGCAGATATTGTTGAACTTCAAACAGAGAATAATAATGAAAT TGAAGTTTGTGAATATTTAAAAGGTTTATTAGCCAAATACAATATCGACTCTAAAATTTTAAATGTTAATGATCAAAGAG CTAATATCGTTGCAGAAATTGGAACTGGTTCTCCTGTACTAGCATTGAGTGGTCATATGGACGTTGTTGATGCTGGAAAT AGTGATAACTGGACATACCCTCCTTTTAAATTGACAGAAAAAGAAGGCAAGCTATATGGAAGAGGTACAACTGATATGAA AGGCGGTCTTATGGCTTTGGTCATATCATTCATCGAATTAAAGGAACAAAATCGATTACCTCAAGGAACACTTCGATTGC TTGCTACAGCAGGTGAAGAAAAGGAACAAGAAGGTGCAAAATTATTTGCAAAAGAAGGATATTTAGATGATGTAGACGGT TTAATTATTGCTGAACCAACTGGCTCTGGCATATTTTATGCGCATAAAGGATCAATGTCATGTAAAGTTACTGCTACTGG TAAAGCTGTACATAGTTCAATCCCTTTTATTGGAGATAATGCTATCGACACATTGTTAGAATTTTATAATCAGTTTAAAG AAAAATATACAGATCTTAAAAAATATGATACAGAACATCAACTTGATGTCGCACCTATGTTTAAGTCATTTATCGGCAAT GCTATTTCTGAAGAAGAAGCAAATTATGCTTCTGGACTTACGGCAGTTTGTTCAATTGCACGCGGTGGAAAACAATTTAA TTCAGTACCTGATGAAGCGTCACTAGAATTTAATGTTAGACCTGTTCCAGAATATGATAATGATTTTGTTGAAAAGTTCT TTCAAGATATTATTAATGATGTAAATAAAAATAAACTTAACCTTGAAATTCCTAGCAATCATCGACCTGTAACAAGCGAT AAAAATAGTAAATTAGTAACTACGTTAAAAGAAATTGTTTCTAACTATGTGAATAAAGATGATATATTTATCGCTGCTCA TGTAGGTGCTACGGATGCTTCCAGCTTCTTAGGAGATAATAAGAATAATGTGGACTTAGCTATTTTCGGCCCAGGTAATC CTATAATGGCACATCAAATTGATGAATTTATTGAAAAAGATATGTATCTTAAATATATTGATATTTATGAAGAAGCAATC ATTAAATATTTAAAAGAAAAATAA Protein sequence : MTTFSEKEKIQLLADIVELQTENNNEIEVCEYLKGLLAKYNIDSKILNVNDQRANIVAEIGTGSPVLALSGHMDVVDAGN SDNWTYPPFKLTEKEGKLYGRGTTDMKGGLMALVISFIELKEQNRLPQGTLRLLATAGEEKEQEGAKLFAKEGYLDDVDG LIIAEPTGSGIFYAHKGSMSCKVTATGKAVHSSIPFIGDNAIDTLLEFYNQFKEKYTDLKKYDTEHQLDVAPMFKSFIGN AISEEEANYASGLTAVCSIARGGKQFNSVPDEASLEFNVRPVPEYDNDFVEKFFQDIINDVNKNKLNLEIPSNHRPVTSD KNSKLVTTLKEIVSNYVNKDDIFIAAHVGATDASSFLGDNKNNVDLAIFGPGNPIMAHQIDEFIEKDMYLKYIDIYEEAI IKYLKEK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
unnamed | CAC20637.1 | - | Not tested | Internalin | Protein | 3e-63 | 43 |
dapE | CAA07459.1 | succinyl-diaminopimelate desuccinylase | Not tested | Internalin | Protein | 8e-64 | 43 |