Gene Information

Name : SAMSHR1132_18490 (SAMSHR1132_18490)
Accession : YP_005326353.1
Strain : Staphylococcus aureus MSHR1132
Genome accession: NC_016941
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : succinyl-diaminopimelate desuccinylase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 3.5.1.18
Position : 2015903 - 2017126 bp
Length : 1224 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGACAACTTTTAGCGAGAAGGAAAAAATTCAATTATTAGCAGATATTGTTGAACTTCAAACAGAGAATAATAATGAAAT
TGAAGTTTGTGAATATTTAAAAGGTTTATTAGCCAAATACAATATCGACTCTAAAATTTTAAATGTTAATGATCAAAGAG
CTAATATCGTTGCAGAAATTGGAACTGGTTCTCCTGTACTAGCATTGAGTGGTCATATGGACGTTGTTGATGCTGGAAAT
AGTGATAACTGGACATACCCTCCTTTTAAATTGACAGAAAAAGAAGGCAAGCTATATGGAAGAGGTACAACTGATATGAA
AGGCGGTCTTATGGCTTTGGTCATATCATTCATCGAATTAAAGGAACAAAATCGATTACCTCAAGGAACACTTCGATTGC
TTGCTACAGCAGGTGAAGAAAAGGAACAAGAAGGTGCAAAATTATTTGCAAAAGAAGGATATTTAGATGATGTAGACGGT
TTAATTATTGCTGAACCAACTGGCTCTGGCATATTTTATGCGCATAAAGGATCAATGTCATGTAAAGTTACTGCTACTGG
TAAAGCTGTACATAGTTCAATCCCTTTTATTGGAGATAATGCTATCGACACATTGTTAGAATTTTATAATCAGTTTAAAG
AAAAATATACAGATCTTAAAAAATATGATACAGAACATCAACTTGATGTCGCACCTATGTTTAAGTCATTTATCGGCAAT
GCTATTTCTGAAGAAGAAGCAAATTATGCTTCTGGACTTACGGCAGTTTGTTCAATTGCACGCGGTGGAAAACAATTTAA
TTCAGTACCTGATGAAGCGTCACTAGAATTTAATGTTAGACCTGTTCCAGAATATGATAATGATTTTGTTGAAAAGTTCT
TTCAAGATATTATTAATGATGTAAATAAAAATAAACTTAACCTTGAAATTCCTAGCAATCATCGACCTGTAACAAGCGAT
AAAAATAGTAAATTAGTAACTACGTTAAAAGAAATTGTTTCTAACTATGTGAATAAAGATGATATATTTATCGCTGCTCA
TGTAGGTGCTACGGATGCTTCCAGCTTCTTAGGAGATAATAAGAATAATGTGGACTTAGCTATTTTCGGCCCAGGTAATC
CTATAATGGCACATCAAATTGATGAATTTATTGAAAAAGATATGTATCTTAAATATATTGATATTTATGAAGAAGCAATC
ATTAAATATTTAAAAGAAAAATAA

Protein sequence :
MTTFSEKEKIQLLADIVELQTENNNEIEVCEYLKGLLAKYNIDSKILNVNDQRANIVAEIGTGSPVLALSGHMDVVDAGN
SDNWTYPPFKLTEKEGKLYGRGTTDMKGGLMALVISFIELKEQNRLPQGTLRLLATAGEEKEQEGAKLFAKEGYLDDVDG
LIIAEPTGSGIFYAHKGSMSCKVTATGKAVHSSIPFIGDNAIDTLLEFYNQFKEKYTDLKKYDTEHQLDVAPMFKSFIGN
AISEEEANYASGLTAVCSIARGGKQFNSVPDEASLEFNVRPVPEYDNDFVEKFFQDIINDVNKNKLNLEIPSNHRPVTSD
KNSKLVTTLKEIVSNYVNKDDIFIAAHVGATDASSFLGDNKNNVDLAIFGPGNPIMAHQIDEFIEKDMYLKYIDIYEEAI
IKYLKEK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
unnamed CAC20637.1 - Not tested Internalin Protein 3e-63 43
dapE CAA07459.1 succinyl-diaminopimelate desuccinylase Not tested Internalin Protein 8e-64 43