Gene Information

Name : SAMSHR1132_11870 (SAMSHR1132_11870)
Accession : YP_005325708.1
Strain : Staphylococcus aureus MSHR1132
Genome accession: NC_016941
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : transketolase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 2.2.1.1
Position : 1318897 - 1320885 bp
Length : 1989 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGTTTAATGAAAAAGATCAATTAGCTGTTGATACGTTACGTGCTTTAAGTATCGACACAATCGAAAAAGCAAATTCTGG
TCATCCAGGACTACCAATGGGAGCTGCCCCAATGGCTTATACTTTGTGGACGCGTCACTTAAATTTCAACCCACAATCAA
AAGATTACTTTAACAGAGACCGTTTCGTACTATCAGCTGGGCATGGTTCAGCATTATTGTATAGTTTGTTACACGTTTCA
GGAAGTTTAGAATTAGAAGAATTAAAACAATTTAGACAATGGGGTTCTAAGACACCAGGTCATCCTGAATACAGACATAC
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TGAATTAGGACATAGCGGTGCATCTCGTGCTGACTCTGGAGCAATCATTCAAGCTATTAGTAAAACTGTCCCTTCATTCT
TTGGAGGATCAGCAGACCTTGCTGGTTCTAATAAATCAAATGTAAATAATGCAATTGACTATAGTTCTGAAACACCGGAA
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TCCATATGGAGCAACTTTCTTCGTATTTAGTGATTATTTAAAACCGGCATTGCGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATG
CAACATTTATCTTTACACACGACTCAATTGCAGTTGGTGAAGATGGACCTACACATGAACCTATTGAACAATTAGCTGGG
TTAAGAGCTATTCCTAATATGAATGTTATCCGTCCTGCAGATGGAAATGAAACTAGAGTAGCTTGGGAAGTTGCTTTAGA
ATCAGAATCAACTCCAACTTCATTAGTATTAACACGCCAAAATTTACCAGTGTTAGATGTACCTGAAAATGTAGTTGAAG
AAGGTGTGCGTAAAGGTGCATATACAGTTTATGGCACTGAAGAAACGCCAGAATTCTTATTATTAGCATCTGGTTCGGAA
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CTTCACCACTTGGATGGCATATATATGTAGGTACTGCTGGTAAAGTTATCGCTATTGATGGCTTTGGTGCAAGTGCGCCT
GGCGATTTAGTCGTTGAAAAATATGGATTTACTAAAGAAAATATTTTAAATCAAGTAATGAGCTTATAA

Protein sequence :
MFNEKDQLAVDTLRALSIDTIEKANSGHPGLPMGAAPMAYTLWTRHLNFNPQSKDYFNRDRFVLSAGHGSALLYSLLHVS
GSLELEELKQFRQWGSKTPGHPEYRHTDGVEVTTGPLGQGFAMSVGLALAEDHLAGKFNKDGYNVVDHYTYVLASDGDLM
EGISHEAASFAGHNKLSKLVVLYDSNDISLDGELNKAFSENTKERFEAYGWNYLLVKDGNDLEEIDQAITKAKSQEGPTI
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YPELAEEFKLAVSGKLPNNYKDELPRFELGHSGASRADSGAIIQAISKTVPSFFGGSADLAGSNKSNVNNAIDYSSETPE
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VSLAIEAAKDLEKQGKSVRVVSMPNWNAFEQQSDEYKESVIPSSVTKRVAIEMASPLGWHIYVGTAGKVIAIDGFGASAP
GDLVVEKYGFTKENILNQVMSL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
APECO1_2641 YP_859417.1 transketolase Not tested Not named Protein 1e-143 46
tktA AAO17218.1 TktA Not tested tcd island Protein 3e-132 45