Name : SAMSHR1132_11870 (SAMSHR1132_11870) Accession : YP_005325708.1 Strain : Staphylococcus aureus MSHR1132 Genome accession: NC_016941 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.2.1.1 Position : 1318897 - 1320885 bp Length : 1989 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTTTAATGAAAAAGATCAATTAGCTGTTGATACGTTACGTGCTTTAAGTATCGACACAATCGAAAAAGCAAATTCTGG TCATCCAGGACTACCAATGGGAGCTGCCCCAATGGCTTATACTTTGTGGACGCGTCACTTAAATTTCAACCCACAATCAA AAGATTACTTTAACAGAGACCGTTTCGTACTATCAGCTGGGCATGGTTCAGCATTATTGTATAGTTTGTTACACGTTTCA GGAAGTTTAGAATTAGAAGAATTAAAACAATTTAGACAATGGGGTTCTAAGACACCAGGTCATCCTGAATACAGACATAC TGATGGTGTAGAAGTTACAACTGGTCCACTTGGACAAGGATTTGCTATGTCAGTTGGTTTGGCATTAGCCGAAGATCATT TAGCTGGTAAATTCAACAAAGATGGATACAATGTTGTAGATCACTACACATATGTATTAGCTTCTGATGGTGATTTAATG GAAGGTATCTCACATGAAGCTGCTTCATTTGCTGGTCATAATAAACTAAGTAAATTAGTCGTACTATATGATTCAAATGA TATTTCACTTGATGGTGAATTGAATAAAGCATTTTCAGAAAATACTAAAGAACGTTTTGAAGCATATGGTTGGAACTATC TATTAGTTAAAGATGGCAATGATTTAGAAGAGATTGATCAAGCTATTACTAAAGCTAAATCTCAAGAAGGTCCGACTATT ATTGAAGTTAAAACAACAATTGGCTTTGGTTCTCCAAATAAAGCAGGTACTAATGGTGTTCATGGTGCGCCTTTAGGTGA AGACGAAAGAAAATTAACTTTTGAAAATTATGGTTTAGATCCTGAAAAACGTTTCAATGTTTCTGAGGAAGTTTATGAAA TTTTCCAAAGTACAATGTTACAACGCGCTAATGAAGATGAGTCTAAATGGAATGCATTATTAGAAAAATATGCTGAAGCT TATCCTGAATTAGCAGAAGAATTTAAATTAGCAGTTAGTGGAAAACTACCTAATAATTATAAAGATGAATTACCTCGCTT TGAATTAGGACATAGCGGTGCATCTCGTGCTGACTCTGGAGCAATCATTCAAGCTATTAGTAAAACTGTCCCTTCATTCT TTGGAGGATCAGCAGACCTTGCTGGTTCTAATAAATCAAATGTAAATAATGCAATTGACTATAGTTCTGAAACACCGGAA GGTAAAAATGTATGGTTTGGTGTACGTGAATTTGCAATGGGAGCTGCTGTTAATGGTATGGCTGCTCATGGAGGTTTACA TCCATATGGAGCAACTTTCTTCGTATTTAGTGATTATTTAAAACCGGCATTGCGTTTATCATCAATTATGGGATTAAATG CAACATTTATCTTTACACACGACTCAATTGCAGTTGGTGAAGATGGACCTACACATGAACCTATTGAACAATTAGCTGGG TTAAGAGCTATTCCTAATATGAATGTTATCCGTCCTGCAGATGGAAATGAAACTAGAGTAGCTTGGGAAGTTGCTTTAGA ATCAGAATCAACTCCAACTTCATTAGTATTAACACGCCAAAATTTACCAGTGTTAGATGTACCTGAAAATGTAGTTGAAG AAGGTGTGCGTAAAGGTGCATATACAGTTTATGGCACTGAAGAAACGCCAGAATTCTTATTATTAGCATCTGGTTCGGAA GTTAGCTTAGCAATTGAAGCTGCAAAAGATCTTGAAAAACAAGGTAAATCTGTACGCGTAGTTTCTATGCCTAACTGGAA TGCATTTGAACAACAATCTGATGAATATAAAGAATCAGTTATTCCATCAAGTGTAACTAAACGTGTTGCTATAGAAATGG CTTCACCACTTGGATGGCATATATATGTAGGTACTGCTGGTAAAGTTATCGCTATTGATGGCTTTGGTGCAAGTGCGCCT GGCGATTTAGTCGTTGAAAAATATGGATTTACTAAAGAAAATATTTTAAATCAAGTAATGAGCTTATAA Protein sequence : MFNEKDQLAVDTLRALSIDTIEKANSGHPGLPMGAAPMAYTLWTRHLNFNPQSKDYFNRDRFVLSAGHGSALLYSLLHVS GSLELEELKQFRQWGSKTPGHPEYRHTDGVEVTTGPLGQGFAMSVGLALAEDHLAGKFNKDGYNVVDHYTYVLASDGDLM EGISHEAASFAGHNKLSKLVVLYDSNDISLDGELNKAFSENTKERFEAYGWNYLLVKDGNDLEEIDQAITKAKSQEGPTI IEVKTTIGFGSPNKAGTNGVHGAPLGEDERKLTFENYGLDPEKRFNVSEEVYEIFQSTMLQRANEDESKWNALLEKYAEA YPELAEEFKLAVSGKLPNNYKDELPRFELGHSGASRADSGAIIQAISKTVPSFFGGSADLAGSNKSNVNNAIDYSSETPE GKNVWFGVREFAMGAAVNGMAAHGGLHPYGATFFVFSDYLKPALRLSSIMGLNATFIFTHDSIAVGEDGPTHEPIEQLAG LRAIPNMNVIRPADGNETRVAWEVALESESTPTSLVLTRQNLPVLDVPENVVEEGVRKGAYTVYGTEETPEFLLLASGSE VSLAIEAAKDLEKQGKSVRVVSMPNWNAFEQQSDEYKESVIPSSVTKRVAIEMASPLGWHIYVGTAGKVIAIDGFGASAP GDLVVEKYGFTKENILNQVMSL |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 1e-143 | 46 |
tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 3e-132 | 45 |