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Name : RMB_05245 (RMB_05245) Accession : YP_005302270.1 Strain : Rickettsia massiliae AZT80 Genome accession: NC_016931 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase polypeptide I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 909050 - 910648 bp Length : 1599 bp Strand : + Note : COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1 DNA sequence : ATGGATATAACTACTACCGAAATTTATCACGCTGACCACCACACCCCACACGGTTGGAGGCGATGGCTTTTTTCTACCAA TCACAAAGATATCGGCATTATGTATATCATATTTGCCGTTTTTGCTGGAATTGTCGGAGGTTTGTTCTCACTGCTTTTTA GGTTAGAGCTTGCAATGCCCGGCGGCACTTTCTTAAATCATGATTTCCAGCTATATAACGTGCTTATCACAGCACATGCG GTTATTATGGTATTCTTTATGATTATGCCGGCTTTGTTCGGTGGCTTTGGTAACTATTTCGTACCTCTGTTAATAGGGGC TCCCGATATGGCATTTCCACGCCTTAACAATATCAGTTTTTGGCTACTAGTTCCTGCTTTTCTTTTACTTATGGGATCAG CTTTTGTTGATGGTGGGCCGGGAACGGGCTGGACGCTCTACCCTCCTTTAAGTAATTTAAGTGGTCACCCCGGTGCAGCC GTTGATATGGCTATTTTCAGTTTACATTTAACCGGTTTATCCTCAATCCTTGGATCAATTAACTTAATCGTTACTATCTT TAATATGAGAGCTCCGGGAATGGGGCTTTTCAAGATGCCGTTATTCGTTTGGTCTATTTTAGTTACCGCATTTCTAATAA TTCTTGCTATGCCGGTACTTGGTGGAGCTATTACTATGCTACTTACAGATCGTAATTTTGGAACTACTTTCTTTAAGCCT GACGGCGGCGGTGATCCTGTATTATTTCAGCATCTATTTTGGTTTTTTGGTCATCCTGAAGTATATATCGTAATACTTCC AGGCTTTGGTATAGTAAGTCAAGTTATTTCAACTTTTTCACGCAAACCTATATTCGGCTATCAAGGTATGGTCGGGGCTA TGGTGATAATAGGCTTTGTTGGATTTATCGTATGGGCTCACCATATGTTTACTGTTGGGCTTTCTTATAATGCACTTATA TATTTCACTGCCGGAACGATGATTATAGCAGTTCCGACGGGTATTAAAATATTTAGCTGGATAGCGACTATGTGGGGTGG TTCGATTACATTCCCAACTCCTATGCTATTTTCGATAGGATTTATTATATTATTCACGATCGGCGGCGTAACCGGCATAA TCCTATCAAATTCGGCACTTGATAGAGTTCTGCACGATACATATTATGTTGTTGCACATTTCCATTATACGATGTCGCTC GGTGCTTTATTTACGGCATTTGCAGGCTTTTATTATTGGTTTGGCAAAATATCCGGTAAACAATATCCGGACATTTTAGG CAAAATTCATTTTTGGATTACCTTTATAGGCGTTACTTTAACTTTCTTCCCGCAGCATTTCTTAGGTCTTGCGGGTATGC CAAGAAGAATACCGGACTACCCTGAAGCTTTCGCCGGCTGGAATATGGTTTCGTCGATAGGAGCAGGTATTTCTATGTTT GCTGCCCTTTATTTTGTATTTATCGTTTTCTATACGCTAAAATACGGCAAAGATTGTCCAAACAATCCTTGGGGAGAAGG AGCAGACACATTAGAGTGGACACTTACCTCACCACCGTCGTTCCATACTTTTGAAACACCACCGCATATTGAGGGGTAA Protein sequence : MDITTTEIYHADHHTPHGWRRWLFSTNHKDIGIMYIIFAVFAGIVGGLFSLLFRLELAMPGGTFLNHDFQLYNVLITAHA VIMVFFMIMPALFGGFGNYFVPLLIGAPDMAFPRLNNISFWLLVPAFLLLMGSAFVDGGPGTGWTLYPPLSNLSGHPGAA VDMAIFSLHLTGLSSILGSINLIVTIFNMRAPGMGLFKMPLFVWSILVTAFLIILAMPVLGGAITMLLTDRNFGTTFFKP DGGGDPVLFQHLFWFFGHPEVYIVILPGFGIVSQVISTFSRKPIFGYQGMVGAMVIIGFVGFIVWAHHMFTVGLSYNALI YFTAGTMIIAVPTGIKIFSWIATMWGGSITFPTPMLFSIGFIILFTIGGVTGIILSNSALDRVLHDTYYVVAHFHYTMSL GALFTAFAGFYYWFGKISGKQYPDILGKIHFWITFIGVTLTFFPQHFLGLAGMPRRIPDYPEAFAGWNMVSSIGAGISMF AALYFVFIVFYTLKYGKDCPNNPWGEGADTLEWTLTSPPSFHTFETPPHIEG |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 4e-98 | 47 |
