Gene Information

Name : RSA_03450 (RSA_03450)
Accession : YP_005300716.1
Strain : Rickettsia philipii 364D
Genome accession: NC_016930
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : succinate-semialdehyde dehydrogenase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 607908 - 609335 bp
Length : 1428 bp
Strand : +
Note : COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases

DNA sequence :
ATGAACTTACTTAAAAACATTACGGGAAAGAATTATATAAACGGTGAATTTATAGAGTTCGGGAAGCAAATATCCGTTAT
TAATCCTGCGACCTTAAAAGAAATTGCTACAGTTCCGAATTTAGGATTATCTGAGATTAATTCAGCGATTAATAATACGG
TGACTAGTTTTGCTTTATGGTCACAAAGTTCATTTGAAGCGAGAATAGCGATTCTTAGAAGATGGTATAATTTAGTAATC
GAAAATATTGAGGAGTTAAGTCATATATTAACCCTAGAGCAGGGTAAAGTACTTGCTGAATCAAAAAAAGAAATTTTATA
TGGAGCCTCTTTTATTGATTGGTATACATATGCTATACATAATATTCATTCGACTATCAAACCCGGTAATAGTAACACTC
ATAAAATTGTTACGCAATATGAGCCTGTAGGACCGTCTGCTGCTATAACTCCTTGGAATTTTCCAAATGCAATGATTGCT
CGCAAGGTAGTACCTGCAATAGCTGCGGGTTGCAGCGTTATATTAAAACCGTCAAGTCTTACGCCTCTATCAGCTTTAGT
ACTTGCGAAATTTGCAAGCGATGCCGGTTTGCCTGCCGGAGTATTTAATGTAATTACAGGTAGTTCAGATATTATAGGTA
AGGCTTTTTGTGAAGATTTTAGGCTTCGGAAATTATCATTTACCGGCGCTACAAATGTCGGTAAAATTCTATATCAAAAT
GCCGCAAATACTCTAAAACGTTTATCTTTGGAACTTGGCGGCAATGCTCCTTTCATTATAACGGCAGATAATAATTTAGA
GAAAGTAGTAAGTGATTTAGTAATCGCTAAAACTAGAAATAGTGGACAGTCTTGTACTTCACCTAACAGAATATTTATAG
AAGAATCTATATATGAAAAATTTATAGAAATTCTAAAGGCTAAATTTACTAAGCTTAAAGCTGGTGACGGATTTGATAAG
GAATCGGATGTAGGTCCGTTAATTAATTCTGCTGCCATAGAAAAAATACAAAAGTTACTCGCTGATGCACAAAGTAAAGG
AGCTAAATTAATTTGCGGCGGTAAAACTGTTGATAATTTTATTGAGCCTACTATTATTATTGACTGTTTGGATAATATGG
ATATCTTTAGAATAGAAATATTCGGTCCGGTAGTTGCTTGTTATAAATTCAAAGATTTGGATGAAGTAATAGAACATGCA
AATAATACCGAATACGGCTTGCAAGGATATGTATATTCAAATAATATATCCGTGGCACAAATGATAGCGTCTAAGCTTGA
TTTTGGTATGGTATCGATTAACGACCCGTTACCTGCAAATGCAAAAGCACCTTTTGCAGGACGTAAAGCTTCAGGTTTTG
GAGTGGAAGGCTCATTTGAAGGGATATTTGAATATCTAAATACGAAATATATAAATTTACAGAATTAA

Protein sequence :
MNLLKNITGKNYINGEFIEFGKQISVINPATLKEIATVPNLGLSEINSAINNTVTSFALWSQSSFEARIAILRRWYNLVI
ENIEELSHILTLEQGKVLAESKKEILYGASFIDWYTYAIHNIHSTIKPGNSNTHKIVTQYEPVGPSAAITPWNFPNAMIA
RKVVPAIAAGCSVILKPSSLTPLSALVLAKFASDAGLPAGVFNVITGSSDIIGKAFCEDFRLRKLSFTGATNVGKILYQN
AANTLKRLSLELGGNAPFIITADNNLEKVVSDLVIAKTRNSGQSCTSPNRIFIEESIYEKFIEILKAKFTKLKAGDGFDK
ESDVGPLINSAAIEKIQKLLADAQSKGAKLICGGKTVDNFIEPTIIIDCLDNMDIFRIEIFGPVVACYKFKDLDEVIEHA
NNTEYGLQGYVYSNNISVAQMIASKLDFGMVSINDPLPANAKAPFAGRKASGFGVEGSFEGIFEYLNTKYINLQN

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
orf17 AAO17183.1 Orf17 Not tested tcd island Protein 2e-94 47