Gene Information

Name : RSA_03070 (RSA_03070)
Accession : YP_005300646.1
Strain : Rickettsia philipii 364D
Genome accession: NC_016930
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : cytochrome c oxidase polypeptide I
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 547849 - 549450 bp
Length : 1602 bp
Strand : -
Note : COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1

DNA sequence :
ATGGATATAACTACTACCGAAATTTATCACGATAGCCACCACACCCCACACGGTTGGAGGCGATGGCTTTTTTCTACCAA
TCACAAAGATATCGGCATTATGTATATCATATTTGCCGTTTTTGCCGGAATTGTCGGAGGTTTGTTCTCACTGCTTTTTA
GGTTAGAGCTTGCAATGCCCGGCGGCACTTTCTTAAATCATGATTTCCAGCTATATAACGTACTTATCACAGCACATGCG
GTTATTATGGTATTCTTTATGATTATGCCGGCTTTGTTCGGTGGCTTTGGTAACTATTTCGTACCTCTATTAATAGGGGC
TCCCGATATGGCATTTCCACGCCTTAACAATATCAGTTTTTGGCTACTAGTGCCTGCTTTTCTTTTACTTATGGGATCAG
CTTTTGTTGACGGTGGGCCAGGAACGGGCTGGACACTCTACCCTCCTTTAAGTAATTTAAGCGGTCACCCCGGTGCAGCC
GTTGATATGGCTATTTTCAGTTTACATTTAACCGGTCTATCGTCAATCCTTGGATCAATTAACTTAATCGTTACTATCTT
TAATATGAGAGCTCCGGGAATGGGACTTTTCAAGATGCCGTTATTCGTTTGGTCTATTTTAGTTACCGCATTTCTAATAA
TTCTTGCGATGCCGGTACTTGGTGGAGCTATTACTATGCTACTTACAGATCGTAATTTTGGAACTACTTTCTTTAAGCCT
GACGGCGGCGGTGATCCTGTATTATTTCAGCATCTATTTTGGTTTTTCGGTCATCCTGAAGTATATATCGTAATACTTCC
AGGCTTTGGTATAGTAAGTCAAGTTATTTCAACTTTTTCACGCAAACCTATATTCGGCTATCAAGGTATGATCGGGGCTA
TGGTGATCATAGGCTTTGTTGGATTTATCGTATGGGCTCACCATATGTTTACTGTTGGGCTTTCTTATAATGCACTTATA
TATTTCACTGCCGGAACGATGATTATAGCAGTTCCGACGGGTATTAAAATATTTAGCTGGATAGCGACTATGTGGGGTGG
TTCGATTACATTTCCAACTCCTATGCTATTTGCGATAGGATTTATTATATTATTCACGATCGGCGGCGTAACCGGCATAA
TCCTATCAAATTCGGCACTTGATAGAGTTCTGCACGATACATATTATGTTGTTGCACATTTCCATTATACGATGTCGCTC
GGTGCTTTATTTACGGCATTTGCAGGCTTTTATTATTGGTTTGGCAAAATATCTGGTAAACAATATTCGGACATTTTAGG
CAAAATTCATTTTTGGATTACCTTTATAGGCGTTAATTTAACTTTCTTCCCGCAGCATTTCTTAGGTCTTGCGGGCATGC
CAAGAAGAATACCGGACTACCCTGAAGCTTTCACCGGCTGGAATATGGTTTCGTCGATAGGAGCAGGTATTTCTATGTTT
GCTGCCCTTTATTTTGTATTTATCGTTTTCTATACGCTAAAATACGGCAAAGATTGTCCAAACAATCCTTGGGGAGAAGG
AGCAGACACATTAGAGTGGACACTTACCTCACCACCGCCGTTCCATACTTTTGAAACACCACCGCATATTGAGGGGTCAT
AG

Protein sequence :
MDITTTEIYHDSHHTPHGWRRWLFSTNHKDIGIMYIIFAVFAGIVGGLFSLLFRLELAMPGGTFLNHDFQLYNVLITAHA
VIMVFFMIMPALFGGFGNYFVPLLIGAPDMAFPRLNNISFWLLVPAFLLLMGSAFVDGGPGTGWTLYPPLSNLSGHPGAA
VDMAIFSLHLTGLSSILGSINLIVTIFNMRAPGMGLFKMPLFVWSILVTAFLIILAMPVLGGAITMLLTDRNFGTTFFKP
DGGGDPVLFQHLFWFFGHPEVYIVILPGFGIVSQVISTFSRKPIFGYQGMIGAMVIIGFVGFIVWAHHMFTVGLSYNALI
YFTAGTMIIAVPTGIKIFSWIATMWGGSITFPTPMLFAIGFIILFTIGGVTGIILSNSALDRVLHDTYYVVAHFHYTMSL
GALFTAFAGFYYWFGKISGKQYSDILGKIHFWITFIGVNLTFFPQHFLGLAGMPRRIPDYPEAFTGWNMVSSIGAGISMF
AALYFVFIVFYTLKYGKDCPNNPWGEGADTLEWTLTSPPPFHTFETPPHIEGS

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cur_1478 YP_001800872.1 cytochrome c oxidase subunit I Not tested Not named Protein 2e-95 47