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Name : hslU (RCA_03585) Accession : YP_005299758.1 Strain : Rickettsia canadensis CA410 Genome accession: NC_016929 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 792992 - 794344 bp Length : 1353 bp Strand : - Note : COG1220 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), ATPase subunit DNA sequence : ATGAAAGCTACTAAAATTACTTATAAAAAAGACCCTATGGGTCTTACCCCTGCTCAAATAGTTAATGAACTTAATAGATT TATCGTAGGTCAAGAAAAGGCCAAAAAAGCTGTTGCTATTGCACTGAGAAATCGTTGTCGTCGTAAAAGAGTAGAAGGTA ATTTGCGTAATGAAATAGTACCGAAAAATATTTTAATGATCGGTTCAACTGGAGTTGGTAAAACGGAAATAGCTAGAAGG CTTGCAAAGCTCACTAATTCTCCTTTCTATAAGATAGAGGCAACTAAATTTACTGAAGTTGGGTATGTAGGGCGTGATGT AGAATCAATAATTCGTGATTTAGTTGAAATAGCCGTTAATACTGAAAAAACTTTAGCAAAAACAGAAGTAGATATTAATG CCCGTGAAAAAGCAATAGAGAGAATATTAGATAGTTTGGTAGGTAAAACTTCTAGTAGTGAGACTCGAGAAAAGTTCAAA GAAAAAGTCTTAAACGGTGAACTTAACGATACGGAAATCGAAATTAGCGTCGCTGATACTGCACCTATTGGTGGCGGAAG TTTTGAAATACCGGGCATGCCTGGATCATCAATGGGTGTGCTTAATCTTGGCGATATGATCGGACGAGCGCTTGGCAGCA GTAAGACTAAAACAAAAAAAATGCTAGTTAAAGAGGCTATGGCTATTATTATATCTGAGGAATTAGAAAAATTAATAGAC CAAGAAAAAATTATTCAGCAAGCTATCACTTTAGCTGAAAATGATGGTATAGTTTTTATTGATGAAATTGATAAAATAGC TTCTGCTCCTAGTTCCGGTGCAAAAAATGCCGAAATAAGTAGAGAGGGAGTGCAAAGAGATTTATTACCTTTGATAGAAG GGACGACAGTTAATACTAAGTATGGACAGGTTAAAACCGATCATATATTATTTATTGCTTCCGGTGCTTTTCATATTGCC AAACCTTCTGATTTATTACCAGAGTTACAAGGCAGGTTACCGATTAGAGTAGAATTAAATTCGTTAACTAAAGATGATAT GATTAAGATATTGCTTGAACCTGAAACTAGTTTAATAAAGCAATATTCGGCGTTAATAGGTACTGAAGACGTGCATCTTG AATTTACTGCTTCTGCTATTGAGAAGATAGCGGATTATGCTATTACCGTTAATTTAGAAGTTGAAGATATAGGGGCTAGA AGACTGCATACTATACTTGAGAATTTGCTTGAAGATATAAGCTTTGAAGCTAGCGAAATGAAAGGCAAAAAAATAACTAT CGATGATCAATTCGTAGAAAATCAATTATCAAAAATAATAACTAATCTTGACCTAGCTAAGTTTATTTTATAA Protein sequence : MKATKITYKKDPMGLTPAQIVNELNRFIVGQEKAKKAVAIALRNRCRRKRVEGNLRNEIVPKNILMIGSTGVGKTEIARR LAKLTNSPFYKIEATKFTEVGYVGRDVESIIRDLVEIAVNTEKTLAKTEVDINAREKAIERILDSLVGKTSSSETREKFK EKVLNGELNDTEIEISVADTAPIGGGSFEIPGMPGSSMGVLNLGDMIGRALGSSKTKTKKMLVKEAMAIIISEELEKLID QEKIIQQAITLAENDGIVFIDEIDKIASAPSSGAKNAEISREGVQRDLLPLIEGTTVNTKYGQVKTDHILFIASGAFHIA KPSDLLPELQGRLPIRVELNSLTKDDMIKILLEPETSLIKQYSALIGTEDVHLEFTASAIEKIADYAITVNLEVEDIGAR RLHTILENLLEDISFEASEMKGKKITIDDQFVENQLSKIITNLDLAKFIL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| hslU | YP_003728753.1 | heat shock protein HslU | Not tested | cag PAI | Protein | 3e-90 | 47 |
