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Name : RCA_03050 (RCA_03050) Accession : YP_005299659.1 Strain : Rickettsia canadensis CA410 Genome accession: NC_016929 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase polypeptide I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 686447 - 688045 bp Length : 1599 bp Strand : + Note : COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1 DNA sequence : ATGGATATAACTACTAGCGACATTAATCACGATGACTACCATACCCCTCACGGTTGGAGGCGATGGCTTTTTTCTACTAA TCACAAAGATATCGGCATTATGTATATCATATTTGCCGTTTTTGCTGGAATTGTCGGCGGGTTATTTTCTCTTCTCTTTA GATTAGAACTTGCAATGCCCGGCGGAACATTCCTTAATCATGATTTCCAGCTATATAACGTGCTTATCACAGCACATGCA GTTATTATGGTATTCTTTATGATTATGCCGGCTTTATTCGGCGGATTCGGTAATTACTTTGTACCTCTATTAATAGGGGC ACCTGATATGGCATTTCCACGCCTTAACAATATAAGTTTTTGGCTGTTAGTTCCTGCTTTTATCTTACTTATAGGATCAG CTTTTGTTGATGGCGGACCAGGAACAGGCTGGACACTCTACCCGCCTTTAAGTAATTTGAGCGGTCACCCGGGAGCAGCA GTCGATATGGCTATTTTCAGCTTACATTTAACGGGTCTTTCATCAATCCTCGGATCAATTAACTTAATCGTTACTATCTT TAATATGAGAGCACCAGGAATGGGGTTGTTTAAAATGCCATTATTTGTTTGGTCTATTTTAGTAACTGCATTCCTCATAA TTCTAGCAATGCCGGTACTTGGTGGAGCTATCACTATGCTACTTACCGATCGTAACTTTGGCACTACTTTCTTTAAACCT GAAGGCGGCGGTGATCCGGTATTATTTCAGCATTTATTTTGGTTTTTCGGTCATCCTGAAGTATATATAGTAATACTTCC GGGTTTTGGTATAGTAAGTCAGATTATCTCAACTTTTTCACGCAAACCTATATTCGGCTATCAAGGTATGGTTGGAGCTA TGGTGATAATAGGCTTTGTCGGGTTTATTGTATGGGCTCACCATATGTTTACAGTTGGGCTTTCTTATAATGCACTTATA TATTTCACTGCCGGAACAATGATTATAGCAGTGCCGACAGGTATCAAAATATTTAGCTGGATAGCAACTATGTGGGGTGG TTCTATTACGTTCCTAACACCTATGCTATTTTCAATAGGATTTATCATATTATTCACGATCGGCGGCGTAACTGGCATAA TTCTATCAAATTCAGCACTTGATAGAGTACTGCATGATACATATTACGTTGTTGCTCATTTCCATTATACGATGTCGCTC GGTGCTTTATTTACAGCATTTGCAGGATTTTATTATTGGTTTGGTAAAATGTCAGGCAAACAATATCCAGAAGTTTTAGG TAAAATTCATTTTTGGATTACCTTTATAGGCGTTAATTTAACTTTCTTCCCACAGCATTTCTTAGGTCTTGCGGGCATGC CAAGAAGAATACCGGATTACCCTAAGGCTTTCACCGGCTGGAATATGGTTTCATCGATAGGAGCAGGTATCTCTATGTTG GCTGCTCTTTATTTTGTATTTATCGTTTTTTATACTTTAAAATACGGCAAAGATTGTCCAACCAATCCTTGGGGTGACGG TGCTGATACGCTTGAGTGGACACTTACCTCTCCACCGCCATTTCATACATTTGAAACACCACCGTGTATTGAAGAGTAA Protein sequence : MDITTSDINHDDYHTPHGWRRWLFSTNHKDIGIMYIIFAVFAGIVGGLFSLLFRLELAMPGGTFLNHDFQLYNVLITAHA VIMVFFMIMPALFGGFGNYFVPLLIGAPDMAFPRLNNISFWLLVPAFILLIGSAFVDGGPGTGWTLYPPLSNLSGHPGAA VDMAIFSLHLTGLSSILGSINLIVTIFNMRAPGMGLFKMPLFVWSILVTAFLIILAMPVLGGAITMLLTDRNFGTTFFKP EGGGDPVLFQHLFWFFGHPEVYIVILPGFGIVSQIISTFSRKPIFGYQGMVGAMVIIGFVGFIVWAHHMFTVGLSYNALI YFTAGTMIIAVPTGIKIFSWIATMWGGSITFLTPMLFSIGFIILFTIGGVTGIILSNSALDRVLHDTYYVVAHFHYTMSL GALFTAFAGFYYWFGKMSGKQYPEVLGKIHFWITFIGVNLTFFPQHFLGLAGMPRRIPDYPKAFTGWNMVSSIGAGISML AALYFVFIVFYTLKYGKDCPTNPWGDGADTLEWTLTSPPPFHTFETPPCIEE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 1e-98 | 47 |
