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Name : RCA_02785 (RCA_02785) Accession : YP_005299606.1 Strain : Rickettsia canadensis CA410 Genome accession: NC_016929 Putative virulence/resistance : Unknown Product : succinate semialdehyde dehydrogenase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 634142 - 635554 bp Length : 1413 bp Strand : - Note : COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases DNA sequence : ATGAATTTACTTAAAAACATTACAGGAAAGAATTATATAAACGGTGAATTTGTAGAATTCAGGAAACAAATATCCGTTAT TAATCCTTCGACTTTAAAAGAAATTGCTACAGTTTCAAATTTAGAATTATATGAAATTAATTCTGTAATAGATAACACAG TTCAGGCTTTTCCTGCATGGTCACAAAGTGCATTTGAAGAAAGAATAGTGATTCTTAGAAGATGGTATAACTTAGTACTT ACAAATATTGATGAGTTAAGTCATATGTTAACCTTAGAGCAGGGGAAGATATTTGCCAAATCAAAAAAAGAAATTCTCTA CGGAGCATCTTTTATTGATTGGTATACATATGCTATACATAATATTCATTCGACTATCAAACCTGGGAATAATAAAGCTC ATAAAATTATTACGCAATATGAACCGGTATGGCCTTCTGCCGCTATAACTCCTTGGAATTTTCCAAATGCAATGATTACA CGCAAGGTAGTTCCTGCAATAGCAGCTGGTTGCAGTGTTATATTAAAACCGTCAAGTCTTACGCCTCTATCAGCTTTAGT ACTTGCAAAATTTGCAAGTGATGCCGGTTTGCCTGCCGGAGTATTTAATGTAATTACAGGTAATTCGGATATTATAGGTA AGGCTTTTTGTGAATATTTTAGGCTTCGGAAATTATCATTTACTGGTTCTACAGATGTAGGTAAAATTCTATATAAAATT GCCGCAAATACTATAAAGCGTTTATCTTTGGAACTTGGTGGCAATGCGCCTTTCATTATAACGGCAGAGAATGATTTAGA AAAAGTAGCAGGTGATTTAGTAATCGCTAAAACTAGAAATAGTGGTCAGTCTTGTACTTCCCCTAACAGAATATTTATAG AAGAATCTATATATAAAAAATTTATAGAAATTCTGAAGGCTAAATTTACTAAAATAAAAGCTGGTGACGGATTCGATAAA ACATCAGATATAGGTCCATTAATTAATGGGGCGGCTATAGAAAAAATACAAAAGCTTTTAATAGATGGACAAAATAAAGG AGCTAAATTAATTTGTGGCGGTAAAGCTGTTGATAATTTTATTGAACCGACTATTATTACTGATTGTTTAGATAATATGG ATATCTTTAAAACGGAAATATTCGGTCCGGTAATTGCGTGCTATAGATTTAAAGGTTTAGATGAAGTAATAGAGCGTGCT AATAATACCGAATATGGCTTGCAAGGAAATGTATATTCAAATAATATATCCGTGGCACAAATGATAGCTGATAAGCTTGA TTGGGTATGGTATCGATTAATGACCCGTTACCTGCAAATGCCAAAGCACCTTTTGCAGGGCGTAAAGCTTCAGGTTTTGG AATTGAAGGCTCATTTGAAGGTATATTTGAATATCAAAATACTAAATATATAA Protein sequence : MNLLKNITGKNYINGEFVEFRKQISVINPSTLKEIATVSNLELYEINSVIDNTVQAFPAWSQSAFEERIVILRRWYNLVL TNIDELSHMLTLEQGKIFAKSKKEILYGASFIDWYTYAIHNIHSTIKPGNNKAHKIITQYEPVWPSAAITPWNFPNAMIT RKVVPAIAAGCSVILKPSSLTPLSALVLAKFASDAGLPAGVFNVITGNSDIIGKAFCEYFRLRKLSFTGSTDVGKILYKI AANTIKRLSLELGGNAPFIITAENDLEKVAGDLVIAKTRNSGQSCTSPNRIFIEESIYKKFIEILKAKFTKIKAGDGFDK TSDIGPLINGAAIEKIQKLLIDGQNKGAKLICGGKAVDNFIEPTIITDCLDNMDIFKTEIFGPVIACYRFKGLDEVIERA NNTEYGLQGNVYSNNISVAQMIADKLDWVWYRLMTRYLQMPKHLLQGVKLQVLELKAHLKVYLNIKILNI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf17 | AAO17183.1 | Orf17 | Not tested | tcd island | Protein | 5e-78 | 44 |
