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Name : RCA_00155 (RCA_00155) Accession : YP_005299096.1 Strain : Rickettsia canadensis CA410 Genome accession: NC_016929 Putative virulence/resistance : Virulence Product : clpB protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 37617 - 40193 bp Length : 2577 bp Strand : + Note : COG0542 ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit DNA sequence : ATGAACATTGATAAATTTACTGCACATGCTAAATTAGTGATAGCTAGTAGTCAATCGCTTGCTGCTAAAAACGATCATCA GCAAATATTATCTTTACATTTATTATCTAGTCTTTTAAGTGAAGAAACAGGCATTATCAGGAGTATTATTAATAATGTCG GTAGTGATTTAAATATAATACACACTCAAGTCAAAACAGAGCTAAATAAAATACCGCAAGTACAAGTTGCAGGTGGAGGA CAAGTTTATTCTTCTGCTGAAGCTCTTAAAGCTTTAGAAAAAGCAAGCAGCCTTGCTAAAGATAGTGGTGATAGTTTTGT AACCATAGAGCGTATACTTGAAGCATTAACTTATGATAATACGATAGCCGGTAAAATTTTAACGAATAACGGAGTTAGTA GTAAAAAAGTAGCAGCTAGTATTTTGCAGATTCGCAAAGGTAAAAAAGCTGATACCGTATCGGCAGAGAATAGCTATGAT GCTCTAAAAAAATACGGCAGAGATGTAACAGAGCTTGCAGAAAGGTGCACGCTTGATCCAATAATCGGGCGTGATGAAGA AATAAGAAGAACCGTGCAGGTACTATCACGACGTATGAAAAATAATCCTGTATTGATTGGTGAGCCTGGAGTTGGTAAAA CTGCTATAATTGAAGGTTTAGCTCAAAGAATTTTTAGCAAAGATGTACCTGAATCGCTTATGAACTGCCGTATTATTGAG CTTGATATGGGAGCATTAATAGCAGGAGCTAAATATCGAGGCGAATTTGAGGAGCGTCTTAAAGCAGTACTTAGTGAAAT CAAAGAATCAAGCGGTGAGATTATTTTATTTATTGATGAATTGCATCTATTAGTCGGTACCGGTAAAACCGACGGTGCTA TGGATGCATCAAATTTACTAAAGCCGATGCTTGCTCGTGGCGAGCTACACTGCATCGGTGCTACTACTTTAGATGAATAT CGTAAATATATCGAGAAAGATGCAGCACTTGCCCGCCGTTTCCAGCCTGTTTACGTGAGTGAGCCGACGGTTGAGGATAC TATATCAATACTTAGAGGAATTAAAGAAAAATATGAGCTACATCATGCCGTGCAAATTTCTGACAGTGCAATAGTTGCAG CAGCTATGCTTTCAAATCGTTATATTACCGATCGTTATTTACCTGATAAAGCTATTGATTTGATTGATGAAGCTTGCAGT CGTATGAAAATAGAATTGTCAAGTAAACCTGAAGAGCTTGATGAATTAGATCGTCGTATTATTCAGATAAAGATTGAGCT TGCAGCACTTAAAAAGGAAAATGAAGATCATTCTAAAAAGAAAATTACCCATTTAACAGAAGAACTCAAAAAGTTAGAAT CTAAATCATATGATATGAATGCTAAATGGCAGGCAGAAAAGTCTAAACTACAGCAAGCCCAAAAACTCAAAGAAGAGTTA GAACGAGCAAGAATCGATCTAGAGCGTGCCGAGCGTGATGCTAATCTTGCTAAAGCTAGTGAGCTAAAATACGGAATTAT ACCTGAGATTATGAAAAAGATTCAGGAAGCTGAAAGTATGGATAATAAAGGGTTGTTAAAAGAAATTGTATCGGACAGTG ATATAGCAAGTATTATCTCTCGTATTACCGGAATTCCGATTGATACTATGCTGTCAAGTGAGCGTGAGCGTTTGCTTGTA ATGGAGCAGAAATTACGAGAATCAGTTATAGGTCAGGATAAAGCTATTAAAAGCGTTAGTGATGCGGTTAGAAGATCACG TGCAGGTATTCAGGATATTAACCGCCCTCTTGGTTCGTTCTTATTCTTAGGACCTACCGGAGTCGGTAAAACTGAGCTTA CCAAAGCCTTAGCCGCTTTTCTTTTTGATGATCGTAATGCAATACTTCGTGTAGATATGTCGGAATATATGGAAAAACAT ACTATTTCTCGTCTGATAGGAGCTCCTCCGGGCTATATTGGGTATGATCAGGGCGGGATACTAACAGAAGCAGTAAGACG CCGTCCTTATCAGGTAATATTATTTGATGAAGTGGAAAAAGCACATACTGATATTTTTAATATTATGCTGCAAATACTTG ATGAGGGAAGATTAACTGATAGTCAAGGTATAACGGTTGATTTTAAAAATACTATTATAGTTTTAACATCTAATTTAGGT GCAGAAATACTTGTTAACCAAAAAGAAGGTGAAGATAGTGATAAAGTTAAGGATGAGGTTATGGAGTATGTTAGAGCAGT ATTTAAACCTGAGTTTTTAAATAGGCTAGATGAGATTATATTATTCCATCGCCTAAGTCGTAACAATATCCACGACATTG TTAAGATACAACTTGAAAGTTTAAAGAAAATTTTACTAGCACAAAATATTACTCTTGAATTTGAAGAATCTGCATTAAAT TATTTAGCTGAAAAAGGCTATGATCCAAGCTTTGGAGCTAGACCCTTAAAACGCCTTATTCAGCGAGAAATACAAAATAA TTTAGCTAAGCTGATTTTAGCAGGCGCAATAAGTAGCGGTAAAACAGTTAAAATAAGTAGAGAAAAAGAAGAGCTAAGGA TAAAGCTTGTGAACTAG Protein sequence : MNIDKFTAHAKLVIASSQSLAAKNDHQQILSLHLLSSLLSEETGIIRSIINNVGSDLNIIHTQVKTELNKIPQVQVAGGG QVYSSAEALKALEKASSLAKDSGDSFVTIERILEALTYDNTIAGKILTNNGVSSKKVAASILQIRKGKKADTVSAENSYD ALKKYGRDVTELAERCTLDPIIGRDEEIRRTVQVLSRRMKNNPVLIGEPGVGKTAIIEGLAQRIFSKDVPESLMNCRIIE LDMGALIAGAKYRGEFEERLKAVLSEIKESSGEIILFIDELHLLVGTGKTDGAMDASNLLKPMLARGELHCIGATTLDEY RKYIEKDAALARRFQPVYVSEPTVEDTISILRGIKEKYELHHAVQISDSAIVAAAMLSNRYITDRYLPDKAIDLIDEACS RMKIELSSKPEELDELDRRIIQIKIELAALKKENEDHSKKKITHLTEELKKLESKSYDMNAKWQAEKSKLQQAQKLKEEL ERARIDLERAERDANLAKASELKYGIIPEIMKKIQEAESMDNKGLLKEIVSDSDIASIISRITGIPIDTMLSSERERLLV MEQKLRESVIGQDKAIKSVSDAVRRSRAGIQDINRPLGSFLFLGPTGVGKTELTKALAAFLFDDRNAILRVDMSEYMEKH TISRLIGAPPGYIGYDQGGILTEAVRRRPYQVILFDEVEKAHTDIFNIMLQILDEGRLTDSQGITVDFKNTIIVLTSNLG AEILVNQKEGEDSDKVKDEVMEYVRAVFKPEFLNRLDEIILFHRLSRNNIHDIVKIQLESLKKILLAQNITLEFEESALN YLAEKGYDPSFGARPLKRLIQREIQNNLAKLILAGAISSGKTVKISREKEELRIKLVN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| clpC | YP_005163377.1 | ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit | Not tested | Not named | Protein | 9e-156 | 47 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| RCA_00155 | YP_005299096.1 | clpB protein | VFG0079 | Protein | 2e-162 | 46 |
