|
Name : M013TW_2392 (M013TW_2392) Accession : YP_005298759.1 Strain : Staphylococcus aureus M013 Genome accession: NC_016928 Putative virulence/resistance : Resistance Product : ABC transporter ATP-binding protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2453916 - 2455628 bp Length : 1713 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAACAATCAGACAAATTGGATAAAGATACTCAGCGGATTTGCTTCTGATAGTAAATGGAAAATTATGTTATCAATTTT GTTGTCTATCATCAGTGTCTTTTCTGGATTAGTTCCATATTGGGCAGTCTTTAAAATTATTTTAATGATGATTAACAATG CATATACGATTAATTCGATTATGGTTTATATCTTTATTGCTTTAATCGCTTATATTTCACAAGTGTGTTGTTTTGGAGCG TCAACGATGCTATCACATATTACGGCATATGAAATTTTATCTGAAATTCGTAAAAAATTAGCTCAAAAATTAATGCGTCT CCCTTTAGGCGTAGTGGAATCTAAGAAAATAGGTGAATTAAAAAATATATTTGTCGATAAGGTTGAAACAATAGAATTAC CTTTAGCACATATGATTCCTGAAGTTATAGGAAACTTACTTTTGTCAGCTGCTATCTTTTTATACATAATGCTCATTGAT TGGCGTATGGCTAGTGCCTTATTAGTAACGATACCAATTTCAATTTTCGCTTTTAAAAAAGTTATGTCTGGATTTAATGA GACATATGCTGAACAAATGAAATCGAATAATTATATGAATAGCGCCATTGTTGAATATATTGAAGGTATTGAGGTAATTA AAACATTTAATCAATCTCAAAGCTCGTATAAAAAATATCAAGATGCAGTAGATAATTATAAAATACATACTTTAAATTGG TTTAAAAATACATGGGGCTATATGAATTTAGGTGCAAGTGTACTACCTTCGACGTTTTTAGGGATTCTACCTGTTGGCAT GTACTTGATATCTATCAACCAATTAAATTATGCAGAATTTTTTATTTGTATTGTATTATCTCTCGGTGTCGTAGCACCGA TTAAGAATTTTACTAATTATGTGAATCATTTAAAATCAATCCAATATGCGTTAACTGAAGTAAATCAAATATTAATCTTA GAAGAGTTAGCATTGTCATCACGATTTATGGAACCTCAAAGTTATGAAATTGCTTTTAATAATGTGGGTTTTTCATATAC AAATGATAAGGACGAAAGAGTCTTTAAGAATCTATCATTTACGGTACCAGAAAATCATTTTACGGCGATTGTTGGGGAAT CTGGTAGCGGTAAGTCAACTATAGCTAAGCTCATATCAAGGTACTGGGATGTAACGACTGGAGAAATCACGATTGGTAAT GTAAACATAAAAAATATAGAACAAAAGCAACTTAACGAATTAGTTGGTTATGTAGGACAAGATAACTTTTTATTAAATCT TACTTTTAAAGAAAATATTAAACTTGGCAATCCAGAAGCTACGGATGAGGCAGTTGAAAAAGCTGCCAAGTTAGCACAAT GTCATGAATTTATTGAAAAGTTGCCAGATGGATATGATACGAATGTTGGTACAGTGGGAGATAAATTGTCTGGTGGTGAA AAACAACGAGTCACTATTGCAAGAATGATATTAAAAGATGCGCCTATCATTGTATTAGATGAAGCGACTGCTTACGTTGA TCCAGATAGTGAACAAAAAATCCAAGAAGCACTAAATGTGTTGACACGCAATAAAACGCTTATAGTTATTGCACATCGTT TATCTACTATTCAACATGCAGATCAAATTATTGTATTAGGTAATCAACAAATTTTGGAGAAAGGCTCACATCAATTGTTG CTAAAATTAGAAGCTCATTACAAAAATATGTGA Protein sequence : MNNQTNWIKILSGFASDSKWKIMLSILLSIISVFSGLVPYWAVFKIILMMINNAYTINSIMVYIFIALIAYISQVCCFGA STMLSHITAYEILSEIRKKLAQKLMRLPLGVVESKKIGELKNIFVDKVETIELPLAHMIPEVIGNLLLSAAIFLYIMLID WRMASALLVTIPISIFAFKKVMSGFNETYAEQMKSNNYMNSAIVEYIEGIEVIKTFNQSQSSYKKYQDAVDNYKIHTLNW FKNTWGYMNLGASVLPSTFLGILPVGMYLISINQLNYAEFFICIVLSLGVVAPIKNFTNYVNHLKSIQYALTEVNQILIL EELALSSRFMEPQSYEIAFNNVGFSYTNDKDERVFKNLSFTVPENHFTAIVGESGSGKSTIAKLISRYWDVTTGEITIGN VNIKNIEQKQLNELVGYVGQDNFLLNLTFKENIKLGNPEATDEAVEKAAKLAQCHEFIEKLPDGYDTNVGTVGDKLSGGE KQRVTIARMILKDAPIIVLDEATAYVDPDSEQKIQEALNVLTRNKTLIVIAHRLSTIQHADQIIVLGNQQILEKGSHQLL LKLEAHYKNM |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| smi_1698 | YP_003446800.1 | multidrug ABC transporter ATPase/permease | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 4e-77 | 41 |
