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Name : RPN_03800 (RPN_03800) Accession : YP_005292731.1 Strain : Rickettsia rickettsii Brazil Genome accession: NC_016913 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase polypeptide I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 618356 - 619957 bp Length : 1602 bp Strand : + Note : COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1 DNA sequence : ATGGATATAACTACTACCGAAATTTATCACGATAGCCACCACACCCCACACGGTTGGAGGCGATGGCTTTTTTCTACCAA TCACAAAGATATCGGCATTATGTATATCATATTTGCCGTTTTTGCCGGAATTGTCGGAGGTTTGTTCTCACTGCTTTTTA GGTTAGAGCTTGCAATGCCCGGCGGCACTTTCTTAAATCATGATTCCCAGCTATATAACGTACTTATCACAGCACATGCG GTTATTATGGTATTCTTTATGATTATGCCGGCTTTGTTCGGTGGCTTTGGTAACTATTTCGTACCTCTATTAATAGGGGC TCCCGATATGGCATTTCCACGCCTTAACAATATCAGTTTTTGGCTACTAGTGCCTGCTTTTCTTTTACTTATGGGATCAG CTTTTGTTGACGGTGGGCCAGGAACGGGCTGGACACTCTACCCTCCTTTAAGTAATTTAAGCGGTCACCCCGGTGCAGCC GTTGATATGGCTATTTTCAGTTTACATTTAACCGGTCTATCGTCAATCCTTGGATCAATTAACTTAATCGTTACTATCTT TAATATGAGAGCTCCGGGAATGGGACTTTTCAAGATGCCGTTATTCGTTTGGTCTATTTTAGTTACCGCATTTCTAATAA TTCTTGCGATGCCGGTACTTGGTGGAGCTATTACTATGCTACTTACAGATCGTAATTTTGGAACTACTTTCTTTAAGCCT GACGGCGGCGGTGATCCTGTATTATTTCAGCATCTATTTTGGTTTTTCGGTCATCCTGAAGTATATATCGTAATACTTCC AGGCTTTGGTATAGTAAGTCAAGTTATTTCAACTTTTTCACGCAAACCTATATTCGGCTATCAAGGTATGATCGGGGCTA TGGTGATCATAGGCTTTGTTGGATTTATCGTATGGGCTCACCATATGTTTACTGTTGGGCTTTCTTATAATGCACTTATA TATTTCACTGCCGGAACGATGATTATAGCAGTTCCGACGGGTATTAAAATATTTAGCTGGATAGCGACTATGTGGGGTGG TTCGATTACATTCCCAACTCCTATGCTATTTGCGATAGGATTTATTATATTATTCACGATCGGCGGCGTAACCGGCATAA TCCTATCAAATTCGGCACTTGATAGAGTTCTGCACGATACATATTATGTTGTTGCACATTTCCATTATACGATGTCGCTG GGTGCTTTATTTACGGCATTTGCAGGCTTTTATTATTGGTTTGGCAAAATATCTGGTAAACAATATCCGGACATTTTAGG CAAAATTCATTTTTGGATTACCTTTATAGGCGTTAATTTAACTTTCTTCCCGCAGCATTTCTTAGGTCTTGCGGGCATGC CAAGAAGAATACCGGACTACCCTGAAGCTTTCACCGGCTGGAATATGGTTTCGTCGATAGGAGCAGGTATTTCTATGTTT GCTGCCCTTTATTTTGTATTTATCGTTTTCTATACGCTAAAATACGGCAAAGATTGTCCAAACAATCCTTGGGGAGAAGG AGCAGACACATTAGAGTGGACACTTACCTCACCACCGCCGTTCCATACTTTTGAAACACCACCGCATATTGAGGGGTCAT AG Protein sequence : MDITTTEIYHDSHHTPHGWRRWLFSTNHKDIGIMYIIFAVFAGIVGGLFSLLFRLELAMPGGTFLNHDSQLYNVLITAHA VIMVFFMIMPALFGGFGNYFVPLLIGAPDMAFPRLNNISFWLLVPAFLLLMGSAFVDGGPGTGWTLYPPLSNLSGHPGAA VDMAIFSLHLTGLSSILGSINLIVTIFNMRAPGMGLFKMPLFVWSILVTAFLIILAMPVLGGAITMLLTDRNFGTTFFKP DGGGDPVLFQHLFWFFGHPEVYIVILPGFGIVSQVISTFSRKPIFGYQGMIGAMVIIGFVGFIVWAHHMFTVGLSYNALI YFTAGTMIIAVPTGIKIFSWIATMWGGSITFPTPMLFAIGFIILFTIGGVTGIILSNSALDRVLHDTYYVVAHFHYTMSL GALFTAFAGFYYWFGKISGKQYPDILGKIHFWITFIGVNLTFFPQHFLGLAGMPRRIPDYPEAFTGWNMVSSIGAGISMF AALYFVFIVFYTLKYGKDCPNNPWGEGADTLEWTLTSPPPFHTFETPPHIEGS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 1e-95 | 47 |
