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Name : RPM_03480 (RPM_03480) Accession : YP_005288904.1 Strain : Rickettsia rickettsii Hauke Genome accession: NC_016911 Putative virulence/resistance : Unknown Product : succinate-semialdehyde dehydrogenase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 609253 - 610680 bp Length : 1428 bp Strand : + Note : COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases DNA sequence : ATGAACTTACTTAAAAACATTACGGGAAAGAATTATATAAACGGTGAATTTATAGAGTTCGGTAAGCAAATATCCGTTAT TAATCCTGCGACCTTAAAAGAAATTGCTACAGTTCCGAATTTAGGATTATCTGAGATTAATTCAGCGATTAATAATACGG TGACTAGTTTTGCTTTATGGTCACAAAGTTCATTTGAAGCGAGAATAGCGATTCTTAGAAGATGGTATAATTTAGTAATC GAAAATATTGAGGAGTTAAGTCATATATTAACCCTAGAGCAGGGTAAAGTACTTGCTGAATCAAAAAAAGAAATTTTATA TGGAGCCTCTTTTATTGATTGGTATACATATGCTATACATAATATTCATTCGACTATCAAACCCGGTAATAGTAACACTC ATAAAATTGTTACGCAATATGAGCCTGTAGGACCGTCTGCTGCTATAACTCCTTGGAATTTTCCAAATGCAATGATTGCT CGCAAGGTAGTACCTGCAATAGCTGCGGGTTGCAGCGTTATATTAAAACCGTCAAGTCTTACGCCTCTATCAGCTTTAGT ACTTGCGAAATTTGCAAGCGATGCCGGTTTGCCTTCCGGAGTATTTAATGTAATTACAGGTAGTTCAGATATTATAGGTA AGGCTTTTTGTGAAGATTTTAGGCTTCGGAAATTATCATTTACCGGCGCTACAAATGTCGGTAAAATTCTATATCAAAAT GCCGCAAATACTCTAAAACGTTTATCTTTGGAACTTGGCGGCAATGCTCCTTTCATTATAACGGCAGATAATAATTTAGA GAAAGTAGTAAGTGATTTAGTAATCGCTAAAACTAGAAATAGTGGACAGTCTTGTACTTCACCTAACAGAATATTTATAG AAGAATCTATATATGAAAAATTTATAGAAATTCTAAAGGCTAAATTTACTAAGCTTAAAGCTGGTGACGGATTTGATAAG GAATCGGATGTAGGTCCGTTAATTAATTCTGCTGCCATAGAAAAAATACAAAAGTTACTCGCTGATGCACAAAGTAAAGG AGCTAAATTAATTTGCGGCGGTAAAACTGTTGATAATTTTATTGAGCCTACTATTATTATTGACTGTTTGGATAATATGG ATATCTTTAGAATAGAAATATTCGGTCCGGTAGTTGCTTGTTATAAATTCAAAGATTTGGATGAAGTAATAGAACATGCA AATAATACCGAATACGGCTTGCAAGGATATGTATATTCAAATAATATATCCGTGGCACAAATGATAGCGTCTAAGCTTGA TTTTGGTATGGTATCGATTAATGACCCGTTACCTGCAAATGCAAAAGCACCTTTTGCAGGACGTAAAGCTTCAGGTTTTG GAGTGGAAGGCTCATTTGAAGGGATATTTGAATATCTAAATACGAAATATATAAATTTACAGAATTAA Protein sequence : MNLLKNITGKNYINGEFIEFGKQISVINPATLKEIATVPNLGLSEINSAINNTVTSFALWSQSSFEARIAILRRWYNLVI ENIEELSHILTLEQGKVLAESKKEILYGASFIDWYTYAIHNIHSTIKPGNSNTHKIVTQYEPVGPSAAITPWNFPNAMIA RKVVPAIAAGCSVILKPSSLTPLSALVLAKFASDAGLPSGVFNVITGSSDIIGKAFCEDFRLRKLSFTGATNVGKILYQN AANTLKRLSLELGGNAPFIITADNNLEKVVSDLVIAKTRNSGQSCTSPNRIFIEESIYEKFIEILKAKFTKLKAGDGFDK ESDVGPLINSAAIEKIQKLLADAQSKGAKLICGGKTVDNFIEPTIIIDCLDNMDIFRIEIFGPVVACYKFKDLDEVIEHA NNTEYGLQGYVYSNNISVAQMIASKLDFGMVSINDPLPANAKAPFAGRKASGFGVEGSFEGIFEYLNTKYINLQN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf17 | AAO17183.1 | Orf17 | Not tested | tcd island | Protein | 2e-94 | 47 |
