|
Name : polA (Awo_c21360) Accession : YP_005269800.1 Strain : Acetobacterium woodii DSM 1030 Genome accession: NC_016894 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.7.7.7 Position : 2517082 - 2519661 bp Length : 2580 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGTCTAATTCAAAAGGGGTACCAACTAATGCCATTTATGGTTTTGTCAACATATTAGTAAAAATACAAGAAGAATATCA ACCGGACTATCTGGGGGTCGCTTTTGATTTAAAAGGACCAACGTTTAGACATTTAGCTTATGAAGATTATAAGGGTGGGC GCCAAAAAATGCCAGAACTTTTGGCGGAACAGTTTTTGCTATTAAAAGAACTCTTAAAAAAAATGGATATCGCCATAATT GAACTGGAAGGATTTGAAGCTGATGATATCATTGGCACCCTGGCAACAATTGGTTCGGAAAAAGGCATTCAAACAGAGAT CATTACTGGTGATCGCGATGCTTTCCAATTAGTTGGACCTAATATAAAGGTACTTTATACAAAAAAAGGCATCTCTCAAT TGGAAGAGGTGGATGAAGCATGGATCAATACGCAATATGGCCTTACGCCCAAAGATCTCATTGATTTAAAAGCTTTAATG GGGGATAAATCAGACAATATTCCCGGGATTGCCGGAATTGGTGAAAAAACAGCGATTAAACTTTTGCAGCAGTATGGAAC CCTGGAAAAGATTTATGAAAACATTGAAGAACAAAAGGGTAAACAAAAGGAAAAAATCATTGCCGGAAAAGATGATGCTT TTTTGAGTCGGATGTTAGGGACCATTAAACGGGATGTTCCTTGGGAAGGCGATTATAAAGAGCTGGCTTTTCATAATATC TTTAATCCCGAAAGCATTGAGTTACTTAAAGAATTAGAATTTAATACCCTCTTATCAAAAATAAATGCTGCTGAAGTGGT GGAAACCATTGAAAAGTCAGTATCGTGTCATAAGATTAAAACAAGTATAGAGATGGATCATTTATTTGCGATTCTTGAAC AGACCAAAGAAATTGTTATTTATTATCGTCAGGAAGAAACGAAAATTTATTTGGCGCTGGGAATAGAAAAGGAGTTTTAT TATTTAAACCCCGAAGTTGTTGATGGGTTGAAATTTTTCGAGCGACTAAGGAACCTACCGACGATTGGAACATTGTCTAT TGCTAGTCAGGATCTTAAAAACCTGATTCATATTTTTCATAAAAATGAGATCCAGGTAATCAATGAAGGGTTTGATACCT ATATTGCGACTTATCTTTTGAGCCCAGGGGATCAACGTTATGATTTAAAAACGGCAGCATATAAATATTTGGATCGTAAT ATTTTGGACGATGAAGAGATGTTTGGAAAAGGCAAAAAAATGGTTGCAGCAGAAAGTCTGGATGAACAGCTTTTAGCCGA TTATTTTGTTAAGAATTGTGAAACGATCCGCGATTTAAAAACCGTTTTGGAAAAAGAACTCAACAAGACGGAAATGATGA CCTTATTTAAAACCATTGAAATGCCATTATTAGAAGTGATGGCAGAGATGGAGGAGTTAGGGTTTAAAATTGATTTGAGC CAATTGGAAGTCCTTTCAAAAGAATTTGAAAATAAACTGACAGATTTAACCCGCGAAATCTATGAATTAGCTGAAACAGA TGAATTTAATATTAATTCGCCCAAACAATTGGGTGAAATTATTTTTGAACAACTGAAATTGCCAGTGGTGAAAAAGACTA AAACGGGATATTCTACCAACATTGATGTGTTAGAGCAATTGATTCATTTTCATCCGATTATTGAAAAAATCATTGATTAC CGCATGTTATCAAAGTTAGATTCGACTTATGGCCGGGGGTTGATCGCATTTGTTGAACCCGAAACCCATAAGATTTATTC AACCTTTAATCAAACGGTGGCAGCAACCGGACGACTCAGCAGTTCAAACCCGAATTTACAAAATATACCGGTAAAAACTG AGATTGGTCGAGAAATTCGCCGGGTTTTTGTACCATCTACGCCAGATCGTATTTTGGTAGGTGCCGATTATTCACAAATT GAACTTCGGGTTTTAGCACATCTTTCAGGGGATGAAAATTTGATTGATGCCTTTAAAAAAGAACAGGATATTCACACCAG AACTGCTTCAGAAATTTTTGGCGTAGCACTTGATGCGGTTACTCGAATTCAACGAGGGCAGGCAAAAGCAATTAATTTTG GGTTGATTTATGGGAAACAGGCCTTTAGTTTGGGAAAAGATTTAGGAATTTCCAGAAATGAAGCACAGGATTATATTAAC CTTTATTTTGCCCGATATCCAAAGGTTCAGGTATATATGGAAAATGTCAAACGGCAAGCAAAAGAAGAGGGTTACGTCAC GACGATTTGGGGAAGACGACGATATATCCCGGAAATGAATTCCCGTAACGGTATGCTTGTTCAGGCCGGTGAGCGGATGG CCTTAAATACGCCGATCCAAGGGAGTGCTGCGGATATTATTAAGTTAGCGATGATTAAAGTATACAACCGGCTTAACGAT GAAAATCTGAAGGCTGAATTAATTCTTCAAGTCCATGATGAGCTAATTATCGATACGCCCAAAAATGAACAAACGCAGGT GGAGCGCCTGATTAAAGAAGAAATGGAAGGGGCCGCAAGCTTGAGTGTGCCGATGACGGTTGACGTTAATAGTGGAACAT CCTGGTTTGATTTAAAATAA Protein sequence : MSNSKGVPTNAIYGFVNILVKIQEEYQPDYLGVAFDLKGPTFRHLAYEDYKGGRQKMPELLAEQFLLLKELLKKMDIAII ELEGFEADDIIGTLATIGSEKGIQTEIITGDRDAFQLVGPNIKVLYTKKGISQLEEVDEAWINTQYGLTPKDLIDLKALM GDKSDNIPGIAGIGEKTAIKLLQQYGTLEKIYENIEEQKGKQKEKIIAGKDDAFLSRMLGTIKRDVPWEGDYKELAFHNI FNPESIELLKELEFNTLLSKINAAEVVETIEKSVSCHKIKTSIEMDHLFAILEQTKEIVIYYRQEETKIYLALGIEKEFY YLNPEVVDGLKFFERLRNLPTIGTLSIASQDLKNLIHIFHKNEIQVINEGFDTYIATYLLSPGDQRYDLKTAAYKYLDRN ILDDEEMFGKGKKMVAAESLDEQLLADYFVKNCETIRDLKTVLEKELNKTEMMTLFKTIEMPLLEVMAEMEELGFKIDLS QLEVLSKEFENKLTDLTREIYELAETDEFNINSPKQLGEIIFEQLKLPVVKKTKTGYSTNIDVLEQLIHFHPIIEKIIDY RMLSKLDSTYGRGLIAFVEPETHKIYSTFNQTVAATGRLSSSNPNLQNIPVKTEIGREIRRVFVPSTPDRILVGADYSQI ELRVLAHLSGDENLIDAFKKEQDIHTRTASEIFGVALDAVTRIQRGQAKAINFGLIYGKQAFSLGKDLGISRNEAQDYIN LYFARYPKVQVYMENVKRQAKEEGYVTTIWGRRRYIPEMNSRNGMLVQAGERMALNTPIQGSAADIIKLAMIKVYNRLND ENLKAELILQVHDELIIDTPKNEQTQVERLIKEEMEGAASLSVPMTVDVNSGTSWFDLK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 3e-138 | 41 |
