Gene Information

Name : SPUL_4253 (SPUL_4253)
Accession : YP_005215306.1
Strain : Salmonella enterica RKS5078
Genome accession: NC_016831
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 4297953 - 4314632 bp
Length : 16680 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
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ATTCAAGTATCAAAGGCAATAACCTCGCTGTTAAATTTAAAGATAAGACTATTACCGGCGCTAAAATTCTGGGCAGCGTA
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GTATGGAATTTTCAATTTACCACAGCGTTATCCGATGGCTCGCATGACGTAACGGTAAAAGTAGAAGATATTGCCGGTAA
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GGGTTGATAATACAGACCATATTATTAATGAAAAGAATCCTGCACTGACAGGAACCGCTGCACCCTATTCAACGGTTAAA
CTCTATATTGATGGCGCACTGATCGCTGAGGTCAGAACAAATAAAGATGGCAGATGGGAGTATACCCTGAAAGCCGATCA
AGGTTTGGTTGATGGCGATCATAGAATAACCGCTTCAGTTGAAGATATCGCTGGCAACATTGCCCATTCGGATCCTTTCT
TAATTAGCGTCGATACTGCTATTTCAATACCGATAGTTTCATTGAGCCCGGATTCAGATTCGGGAATTGCAGATGATAAT
TTAACGAATATCGTTAAACCTACCTTGCACCTAAAAGATATTGATCCGGACATTATCAGTGTTCAGGTATGGGATGCCAT
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GCTTGCATCAGGTTTATGTCAAGGTTGAGGACATTGCGGGTAATAAAGCGAACAGTGCGGTATTCGATTTTACTATCGAT
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TAAGCCAGGTTTTGCTATTTCCGGTGTTGATGCCGATGCGCATCGGGTCGTCGTACAGGTGATGCATAATGGCGTGAGCG
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TGATGGGGTGGAACTGGTCAACGATAGCGGTGTGAAAGGCGACAATATGACCAACGACGACCGTCCCCACTTTCGTGTGA
CGGTACCTACGGATGTCAATGAAGTCCGTCTGAGCATTGACGGTGGTAATTCGTGGGTTCAGGCAACCCCGGGCGTGGCA
GGCAGCTGGGAGTATATCTGGCCGACAGACCTGGCAGATGGTCAATACACGCTAACGGTGGAGGCGACTGATAAAGCAGG
CAATACCGTGACGAAGACCATCGATTTCGCGGTGGATACCACGCTGTCAGTGCCGGTCATCGTACTGAATAGCGCGGACG
ATACCGGTGTCCAGGGCGATAACATGACGAATCGCACCCAGCCGACATTTGCCCTGCAGCATATTGATGATGATGCCGTT
CGCGTTACGGTCAGCGTGGAGCATGGCGGCGTCACCACCACATTTGACGCCACGAAAGGCACAGGCGGATGGACCTTTAC
GCCGCCGACATCATGGGCGGATGGTGATTATACCCTGAGTGTGTCAGTCGAAGATAAAGCGGGGAACACCAGCCATTCTG
CATCGCTGACGGTGACGGTGGACACGCAAATCGCCATTAATAACATTGAACTGGTCAATGACAGCGGTATTCCCGACGAT
AATCTGACTAATAACGTGCGTCCGCACTTCCAGGTGACGGTACCGACGGATGTCAACGTGGTGCGCCTGAGCATTGACGG
CGGCAAGACGTGGTTCAACGCTACCCAGAGCGCGACGCCGGGCGCCTGGGATTATATCTGGCCGGATGATGTGGCCGACG
GAGGCTATACCCTGACGGTAGAGGCGACCGACAAGGCGGGAAACAAGACGACGCAGGAACTTGATTTCACCATCGATACC
ACTCTGTCTGTGCCGACCCTCTCGCTGGACAGCGCAGATGACAGCGGCATCGCGGGCGATAATATCACCAATGTTAAAAC
GCCGGGCTTTACCCTCAACAATATTGATACCGATGTCAGCCGGGTGATAGTGGAGGTAATGCACAATGGCATTAAACAGG
AGGTGCCACTGGTTCAGACCGGCGGGCAGTGGCGCTTTGCGCCGACCAGCGACTGGGCGGACGGCGACTATATCCTGACG
GTGAAGGTAGAAGATAGGGCCGGAAATGTGAAGCAGTCCGCGCCGTTGACGGTGACAGTAGACACGCATATCGCCATTGA
CCGTATTGAACTGGTTAACGACAGCGGTATCCCCGGCGATAATCTGACCAATGAAGCGCGCCCGCACTTTCAGGTGACAG
TACCGGCGGATGTTAACGGTGTAAGACTGAGTATTGATGGCGGCAAAACGTGGTTTGACGCCACGCAGAGCGCGACGTCG
GGCGTCTGGGATTACACCTGGCTGACGAATGTGGCTAACGGCCCTCACACCCTGATGGTGGAAGCGTCCGACAAGGCGGG
AAACAAAACGACGCAGAAACTGGACTTCATCATCGATACCCTGCTGTCAGAACCGACTATTACCCTGGACAGCGCGGATG
ATAGCGCCGCTGGCGATAACATCACCAACGTTAAGATGCCAGGCTTTACCCTCGGTAATATCGACGCCGACGTGACCAAA
GTGGTGGTGACGGTGGCGCATGATGGTAAGAACCAACAGATAGAGTTGATTAAGAACGGCGGTGTGTGGCGCTTTACGCC
GGGCGCAGCCTGGACCGATGGAGACTATACGTTGACGGTAAAGGTAGAAGATAAGGCGGGTAATACAAATTATTCTGCGC
CGCTGACGGTGACTATCGATACGCAAACGTCTATTGATCGCATTGAGCTTCTTAATGACACGGGTATTGTCGGGGATAAC
CTGACCAATGAAGCACGTCCACAGTTTCATATTACGGTACCGACGGACGTGAACTCTGTGCAACTGAGTCTTGATGGCGG
CATCAACTGGGTTAACGCAACGCTGACGTCTGACGGCGTTTGGGAGTATATATGGCCGACAGATCTGGTCGAAAATACGT
ATACCCTGACAGTGAAAGCAACCGATGTTGCAGGCAACACGGCGACGGAAACGCTCAATTTTATCATTGATACCACATTG
TCGACACCGACCATCACGCTGGATAGCGCAGATGATAGCGGCACCGCCAACGATAATAAGACTAACGTTAAAACGCCGGG
TTTTATTATCGGCGGTATTGATTCTGACGTGACTCAGGTCGTCGTGCAGGTGATGCGCGATGGTCACAGCGAGGAGGTGG
AGCTGACGCAGACTAACGGGCAGTGGCGTTTTGTACCCGGCAGCGCGTGGACTGATGGCGACTATACGCTGACGGTAACG
GTGAAAGATGAGGCGGGTAATATTCGCCACTCAGCGCCGTTGACGGTCACCATCGATACGCAAATCACCATTGACCATAT
TGAACTGGTCAATGACAGCGGTATTCCCGACGATAATCTGACTAATAATGTGCGTCCGCACTTCCAGGTGACGGTACCGA
CGGATGTCAACGTGGTGCGCCTGAGCATTGACGGCGGTAAGACGTGGTTCAACGCTACCCAGAGCGCGACGCCGGGCGTC
TGGGATTATACCTGGCTGGCTGATGTGGGAGAGGGTAAGCATACCCTGACAGTGGAGGCGACCGACAAGGCGGGAAACAA
AACGACGCAGCAACTGGACTTCATCATCGATACCCTACTGTCAGAACCGACTATCGTGCTGGACAGCACGGACGACAGCG
GAACAAAAGGCGATAACCTGACCAACGTAAATAAGCCGACGTTTTTACTGGGCAATATTGACGCAGACGCGCGGTATGTC
ACGGTTGAGGTACAGCATGGCGGCACGAAAGAGGTGCTGACGGCCACCAAAGACGCGACCGGCAACTGGAGCGTAACACC
GACCGGCACATGGGCAGATGGCGACTATACGCTGACAGTGAGGGTGGAAGATGAGGCGGGGAACGAAAAACACTCAGCGT
CGCTAACGGTCACTGTTGATACCCAAATCACCATTGATGTTATTGAACTGGTTAATGATAACGGTATTCCCGGCGACAAT
ATGACTAACGACGCCCATCCGCAGTTCCGCGTGACGGTACCGGGGGACGTTAACGAAGTTAGTCTGAGCATTGACGGTGG
CGTGACCTGGGTTAAGGCGACACAGAGCGCGACGCCGGGCGTCTGGAATTATACCTGGCCGGGCACCGTGCCGGATGGCG
ACTATACGCTGAATGTGAAAGCGACTGACAATGCGGGTAATACGGTGACGGAGACACTCCACTTCACTATTGATACCACG
CTGTCAGTGCCGGTCATCGTACTGAATAGCGCGGACGATACCAGTGTCCAGGGCGATAACATGACGAATCGCACCCAGCC
GACATTTGCCCTGCAGCATATTGATGATGATGCCGTTCGCGTTACGGTCAGCGTGGAGCATGGCGGCGTCACCACCACAT
TTGACGCCACGAAAGGCACAGGCGGATGGACCTTTACGCCGACAGGGTCATGGGCGGATGGTGATTATACCCTGAGTGTG
TCAGTCGAAGATAAAGCGGGGAACACCAGCCATTCTGCATCGCTGACGGTGACGGTGGACACGCAAATCGCCATTAATAA
CATTGAACTGGTCAATGACAGCGGTATTCCCGACGATAATCTGACTAATAACGTGCGTCCGCACTTCCAGGTGACGGTAC
CGACGGATGTTAACGTGGTACGCCTGAGCATTGACGGCGGCAAGACGTGGTTCAACGCTACCCAGAGCGCGACGCCGGGC
GTCTGGGATTATACCTGGCTGGCTGATGTGGGAGAGGGGAAGCATACCCTGACAGTGGAGGCGACCGACAAGGCGGGAAA
CCAGACGACGCAGAAACTGGACTTCATCATCGATACCATGCTGTCAGAACCGACTATCGTGCTGGACAGCACGGACGACA
GCGGAACAAAAGGCGATAACCTGACCAACGCGAATAAGCCGACGTTTATACTGGGCAATATTGACGCAGACGCGCGGTAT
GTCACGGTTGAGGTGCAGTATGGCGGCACGAAAGAAGTGCTGACGGCCACCAAAGGCGCGACCGGCATCTGGAGCGTGAC
ACCGACCGGCACATGGGCAGATGGCGACTATACGCTGACGGTGAGGGTGGAGGATGATGCGGGGAACGTAAAATACTCAG
CGCCGCTGACGGTCACGGTTGATACCCAAATCACCATTGATGTTATTGAACTGGTTAATGATAACGGTATTCCCGGCGAC
AACCTGACCAATGACGTTCGTCCACACTTCCGCGTCACGGTGCCAGGGGATGTCAACGAGGTACGTCTGAGTATCGACGG
CGGTAATACGTGGGTTCGTGCAACACAGGGCACGGCAGGGATCTGGGATTACACCTGGCCGAAAGATGTGACCGACGGGC
TACATACCCTGACGGTAGAGGCGACCGATAAGGCGGGAAATAAGACGACGCAGACGCTCGATTTTACCATTGATACCCGG
CTGTCAACGCCTACCATCACTATGGATAGCAGGGACGATACAGGTGCCATTGGCGATCATATTACGAGCGTCAAAAGACC
GGGCTTTACCATTGGCAATATTGACTCCGATGCGCAATCGGTCATTTTGCGGATCACACAGGGCGGCAATAGCCAGGAAG
TGACACTAACCCAGGTTGGAGGACAGTGGCGCTTTACGCCAGATGCTGACTGGGCGGACGGTAGCTATACACTGACGGTA
GAGGTAACGGATAACGCAGGAAACGTTCGTCAGTCCACGCCGCTGATAGTGACGGTAGATACGCAAACCAGCATTACTGA
TATTACATTGGTCAATGATCATGGCATGCCTGATGACAATCTAACTAACAGCACCCGTCCGCAGTTTGAGATCACGGTGC
CGGCGGATGTGAATTCTGTGCAACTGAGCATTGATGGGGGCGCAAACTGGGTGAGCGCGGCGCAGGGTATTGAAGGCGTC
TGGGGCTATACCTGGCCAACGGATATGGGCGATGGAAAACACACCCTAACCGTCATGGTCACCGACAGAGCGGGCAATAC
GGCGACGCAAACGCTTGAATTTTTCATCGACACCCGGTTGTCGACGCCGACTATTGCGCTGGATAGCACGGATGATACCG
GTACGCCTGGCGATGATATGACCAATCGCACCCGACCGACCTTTATTCTGCAGAATATCGATTCGGATGTTATCAACGTT
ACAGTCAGCGTCACGCATAATGGAACGACAACCTCGTTTACCGCGACACAGGGGGCTGGAGGCTGGAGCTTTACACCGCC
AGCGCCGTGGGGCGACGGTGATTATACGCTGACGGTGACAGTGGAGGATCGGGCGGGAAATACGCGTCCGTCTACGCCGC
TGACGGTGACAGTGGATACGCAAATAGCCATTGATCATATTGAATTAGTCAACGATAGCGGCGTCCCTGGCGATAATGTG
ACAAAACATGTGCGTCCGCAGTTCCAGATCTCGGTACCGGATGATGTGGAAAAGGTTCTTCTGAGTATTGACGGCGGCAC
GACCTGGGTTACCGCAATCAAGAGTTCGACGGCTGGCATTTGGGATTACACCTGGCCGACGGATATGCCAGAGGGACAGC
ATACCCTGACCGTGGAAGTGACTGACGGTGCGGGTAATAAGATGACGGAGACGCTCAATTTCACTATCGACATCACGTTG
ATGACGCCAACCATTGAGCTGGCGCCCGATCAGGATACCGGACAGAATAAGAACGATAATCTGACCAGCGTCACTCAGCC
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TGGTACTCACCGAATCAGCCGACGGCTGGCGCTATCGACCGGATTCTGCTTTGGCGGACGGTAGCTACACATTCACCGTG
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GCCAGGTTGATTCTGACGTTACGCGCGTGATGGTCAAAGTAACTTACAACGGTAAAACGCACGAGGAAGCGGCGGTATTC
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GGCGGGGAATGTAAAAGAGTCTGCGCCGTTTGAGGTGCGTATTGACACCACGACAACCATTAACAATATCGTATTGCTTA
ATGATACTGGCGTGCAGAATGATCAATTAACGAATGTTGCCAAACCGTCATTCAGAATTGACGTTCCCGGTGATGTCGTC
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CCCGAATACTCTGGTTGACGGCACATATACCCTTCGCGTAGAGGCCACGGATGAGGCAGGTAATATTGCGAATAAAGATT
TAGTATTTAATATCGATACTAATATACAGGTTCCGACTATTGCTTTAGACGCAGGACAAGATACCGGAGCGAATACAGCC
GATAATATCACTAATATTTCACGACCCACCTTTACGATTGGTAATGTTGACCCCGATGTTATCAAAGTCGTGGTGACGAT
TGATGGTCATGATTATAACGCGACTAAGGTTGGGGCTGGTTGGCAATTTACGCCAGGCAATGCCATTCCGGATGGTTCTT
ATAATATTACCGTTACGGTTGAAGATAAGGCCGGAAATACCGCGACATCGAAACCATTACCTGTTGTGATAGATACGACG
GCTGAAATTGAAAGCGTCACGTTGGTTACAGATAGCGGTGATAGTGATGTAGATAACATTACCAAAGTCGACAAGCCGCA
GTTTAGTATTGTTACCGCTGATGATATTACTCATGTGCGCGTTAAAATCGATAACGCCGCTAATTGGATTGAACTCACAA
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GGCAGGTAATAAATGGCTGTTTACCCCTGATACACCGTTAGTGGATGGAACTTACAAAATAGAAATAGTGGCTGAAGATA
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AAGCTGCCCTTTACCATTGATACCACGACAAGCGTCAGTGTCAGAATGGAGCCAGCGTCTGATACCGGAAATTCCAATAG
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ACGATAAGTCAGGTCGGGAGGTTTTAAAACAAACGATTACGGTTGGCGCTGATGGCAACTGGAGTGTGACGCCGAATATA
CTGCCGGATGGCATGTATACCATCAACGTCGTCGCAACAGATGTCGCGGGAAATACTGCGCAAACGCAGGAAAGATTCAC
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GTCCTGAGTTCAAAGGGTTTGCCGAAGCGTTCTCGACGATTATGATTCAGTGGGATGGGAAAGTGGTCGGCTCGGCAAAC
GCCAATGCGAATGGCGAATGGAGTTGGACGCCGCCATCAGTATTAGCGCCAGGCTCCTATGTTGTGAGCATTGTTGCCAA
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TTACCTAATGCGATTGTGAGTATTTATGTGGATGGCGTGAAGGTCGGCGAGGCGACAGCGGATACAGCGGGTCGATATAC
TTTCCAGTTATCGGAAATGAAAGATGGCCATTATGTCGTCCAGGTGGGTATAGTCAACCCTCGCGATAATAGCGAACTGC
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TAACGTTTAAAGTTGAAGATGTTGCCGGCAATATCAGAGAGTTTGGTCCGCAGAATGTGATACTGGATACGGTAATTTCG
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GATGGCACATGGCGCGCGCCGATACTGCTGCAAGATGATGGTACGTTTAATATTCATTTCAGCATTACTGACGTTGCTGG
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AGTATAACGAGTCAGACCCGGCCTACGTTTAGTATTTCTGGAGAAATGAACCAGAGTGTTCAGATTTTCATTGATGGGGT
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ACGCCTGTCGCCATTGATTCTATCGGTGGACAAACGTTAGCAGAGATGACCGGTAGTGATGGCAAAATATATATAACGGA
CACGACGCGTAACTTATTGTTTAGTGGCAGTGCCGAGCCCAATAGCAAAATAGAAATCATCATTAATGGCTTAAATGTGG
GGGAAGTTTGGGTTAATGAAAAAGGCCACTGGCAGATGCCGGTGAACCCGCTTTATTTCACAGAAGGCCAACTGGATATC
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TACCAGCGAGCTTGATGACAATAAATCATCATCGAAAACGGACTGGTGGAGTAATAGCTCCACTATTACCATGAGAGGTA
TGGGGGAAATTGGCGCTACGGTATCATTAATCGTGGCAGGGGTCACGTTGGCAACCGCTGTCGTTGCGGCTAATGGGCAG
TGGGAATTATCGACCGATCAGCTTCCGGAGGGTAAATACGATATCACGTTGAGTATTGAGGATAACGCAGGCAACCGTAA
GGAAGAGGTACATGAAATATTTATTGATCGAACGCCGCCAAACGCTCCGGTCGTAACTTATTCAGATATTGTCAACGATC
TAATTATTATGCAGGGGACGGCGGAAGCCAAATCTCAGCTAATAATAACCGATAGTAATGGGAATACTTATACGTTAACC
GCTCCTGATAATGGTAAATGGAGTATGGCTATCCCGTATCCATCGGAAGGGAAGTTTACCATTACGAGTGTGGATGCGAT
TGGTAACCGGAGTGATGATGTCTCTCTCGATATCATGAAAGAGGTTCCCGTTATTTCATTATCTCCAGACTCAGACAGTG
GTACGGTGGGCGATAATATTACGCGAGATAAGCAACCTACCTTTATTATCGGGAATCTGGAAAGCGATGTTGTGGTCGTT
CAGGTTGATATCAATGGGACCGTATATAATGCTGAAAAAAATGCCGATGGCGTTTGGTTCTTTACGCCAGGTACACCGTT
AGCTGATGGTTCCTATACGATATCGGTAATCGCAAGCGATGCCGCGGGTAATCAGAAAAACTCGTTACCCATTACCGTTA
CGATCGACAGTACGCTGACGGTGCCGGAGATTGCGTTGGCAGCAGGTGAAGACAATGGCGTTTCAGACAGCGATAACGTG
ACGAATCACACCCAGCCTAAGTTCACGCTGCAGCATATTGATGCTGATGTGACCGGGGTGACCGTAAACGTGACGCATAA
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CCTACACGCTGAGCGTGACGGTGGTGGATCGCGCGGGGAACTCACAGCAATCTGCTTCGCTAGCGGTGACGGTTGACTCA
ACGGTGACGGTAACAGCGGATAGCCAGCATGACGATGCGAGCGATGACGCCACGGCAACAGCGGTTACTCCACCGGAGTC
TGAAACAGTGAATGCCGAAAGCGCTACGCATCTTCGTACAGTGCCGTCTGCGGCGGAAGAAAGCGTGGTGAAGGAGACAG
CCTATAGTATTACATTGTTAAACGCTGACTCTGGGGATGAAATAGATCGTTCAATTAGTCAGACACCTTCTTTTGAAATA
TCAGTACCTGAGAATATTGTTAATGTCAGTATTATGTTTGAAGGAGAAGAGTTTACTCTGCCGATAACTAACCAGAAAGC
AATATTCGAAGTTCCGCTATCTTTGGAAGATGGTGAATATACTATGGACGTGAAATTCATTGATAAAGACAATGATTTCC
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Protein sequence :
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KTEPNAIISVINSETGEEVIFKANDKGEWTFNFTSDSVEGINNLTFTVEDVAGNKKDFSFSYVIDTIAPVPPTVSLEDFV
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DDINDSPSTSSVGHNNNGAIDVFAVNEVTLPVDNQEEHA

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
STM4261 NP_463126.1 inner membrane protein Not tested SPI-4 Protein 0.0 99
SC4140 YP_219127.1 inner membrane protein Not tested SPI-4 Protein 0.0 99
siiE CAE11797.1 large repetitive protein Virulence SPI-4 Protein 0.0 99

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
SPUL_4253 YP_005215306.1 hypothetical protein VFG0581 Protein 0.0 99