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Name : lysS (MYM_0563) Accession : YP_005205277.1 Strain : Mycoplasma hyorhinis GDL-1 Genome accession: NC_016829 Putative virulence/resistance : Virulence Product : lysyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 6.1.1.6 Position : 645015 - 646493 bp Length : 1479 bp Strand : - Note : Identified by match to HMM PF00152.14; identified by match to HMM TIGR00499 DNA sequence : ATGTCTATAAATAAATTATCAGAGCAAGAATTAGTAAGGCAAAAAAAAGTTGAGTTATTAAATAAAAAAAACATTCCAGC TTATTCAGAAACTAAATTAGAAAATACTAATTGGCAAGAAGTAGTTGCTGAATTTAATGTTTTTAGTAAAGAAGAACTTG AACAAAAAAGTGTTATTATCAATGTTGCAGGTCGTATAGTTGCAATGCGTGGACCTTTTATAATTATTAATAGTTATTTT GATAAAATTCAACTTTATTATGATAAAAAATTACTTCAAATCGAAGAAAATAAAGACTTATTTGAACTTCTTGACTTGGG TGATATTATCCAAGCACAAGGTGTTGTTTTTAAAACTAAAACCAATGAATTGTCTTTAAAAGTAAATAAACTACAACTTC TTACTAAAGCTTTAAAACCCTTGCCTGATAAATTCCACGGAATTAATGATGTTGATGAAAAATATAGAAAACGTTATTTA GATTTAATCTCAAATCCAGAAACAAAACAAGTTTTTTTCACCAGAACAAAAATTATTTCTTTAATTAGACAGTTTTTAGA TAACCTCAATTATATGGAAGTTACTACTCCGATTTTACAATCTTTATTAACAGGAGCTAGCGCTCGTCCCTTTACTACTT TTTATAATTCGTTACATGCAAATTTTTATTTAAGAATAGCAACAGAATTACCACTTAAAAAATTATTAGTAGGTGGTTTA GATCGAGTTTATGAAATTGGAAAAATCTTTAGAAATGAAGGAGTGGATACAACTCACAATCCTGAATTTACTTCAATAGA GTTTTATGAGGCATATGCTAATTTAGAAACAATGATGGAAAGAACAGAAGCAATTTTCAAATTTTTAGTTGATAAATTAA ACATTAAAAATAAAAAAATTGTTTTTGGTGAGTACGAAATTGATTTTAATTTACCATTTAATAAATTTGATTTAGTAGAT AAAACTTCGGAAATTTTAGGAATTAATTTAAAAACACAATCATTTGAACAGTTAAAAGCTATTGCTCAAGCACACAATAT CAAAATTGAAAAATTTTATCAATCAGGTCATATTATTAATGCTCTTTTTGAAGAATTTGTTGAACCCAAACTTATTCAGC CAACTTTTGTTTATGGACATCCTATTGAAATTTCTCCATTAGCTAAAAAGGATGAAAAAGATCCTCGTTTCACACAAAGA GCAGAACTTTTTATTGCTAAAAAAGAATTTGCTAATATGTTTAATGAATTAAATGATCCTGAGGATCAATTACAGCGTTT TGAAAATCAAATAAAAGAAAAAGATTTAGGAAATGAAGAAGCAAATGAAATTGACTATGATTTTGTTGATTCTTTAAAAT ACGGAATGCCACCAGCTGGTGGCTGTGGAATAGGAATTGACAGACTTGTAATGCTCTTAACTTCCAAAACATCTATTCGT GAAGTAATTTTATTTCCACAATTAAAGGCTAAAAAATAA Protein sequence : MSINKLSEQELVRQKKVELLNKKNIPAYSETKLENTNWQEVVAEFNVFSKEELEQKSVIINVAGRIVAMRGPFIIINSYF DKIQLYYDKKLLQIEENKDLFELLDLGDIIQAQGVVFKTKTNELSLKVNKLQLLTKALKPLPDKFHGINDVDEKYRKRYL DLISNPETKQVFFTRTKIISLIRQFLDNLNYMEVTTPILQSLLTGASARPFTTFYNSLHANFYLRIATELPLKKLLVGGL DRVYEIGKIFRNEGVDTTHNPEFTSIEFYEAYANLETMMERTEAIFKFLVDKLNIKNKKIVFGEYEIDFNLPFNKFDLVD KTSEILGINLKTQSFEQLKAIAQAHNIKIEKFYQSGHIINALFEEFVEPKLIQPTFVYGHPIEISPLAKKDEKDPRFTQR AELFIAKKEFANMFNELNDPEDQLQRFENQIKEKDLGNEEANEIDYDFVDSLKYGMPPAGGCGIGIDRLVMLLTSKTSIR EVILFPQLKAKK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 2e-89 | 42 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| lysS | YP_005205277.1 | lysyl-tRNA synthetase | VFG1668 | Protein | 1e-89 | 42 |
