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Name : Rahaq2_3647 (Rahaq2_3647) Accession : YP_005201582.1 Strain : Rahnella aquatilis CIP 78.65 Genome accession: NC_016818 Putative virulence/resistance : Unknown Product : capsular exopolysaccharide biosynthesis protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 3864722 - 3866872 bp Length : 2151 bp Strand : - Note : PFAM: Chain length determinant protein; CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain; TIGRFAM: capsular exopolysaccharide family DNA sequence : ATGATTGAAAAAATAACGGGGCAGTCAGGAAATAAAAATATCCCGGACGAGTTTGATTTACGTAAAAACATGGGAGCTAT CATTGATAAAAGATACATTATTATTGTGATTACGTTTATTTTTGTTTTTATCGGTTTGTTATATGCCTTTTTATCATCCC CGGTTTATCATGCTGATGCTTTAGTTCAGGTCGATCCCTCAGGCGAAATCGACATGATGAGTAATATCTCGCAATTATTG CCGGCGAAATCGCCTGTTTCTGCAACAGAAATGCAACTGATTACCTCTCGGGCAATCCTTGGAGAAACGGTTACTCAATT GAATCTGGATACTGAAGTTCGTTTTACCAGTTTCCCCATCATTGGAGAGGCGATACGACGTTATTCACAGCCTGGAGTGC CGCGGATTTCGGTGGATATCTTTGAGCCACGCGGAGGTGTTATCGGAGATTCTTATACTCTTGAAATTCTCAGTAACGCT GAGTATCAGATAACGTCACCATCCGGTGCTACCGTATCAGGAATGGCAGGGAAGATACTGGATACTCCTGAATTTCGTAT TGAAGTGAACGAAATAAATGCTCTCAAGGGAGATAAGTTTTCTGTTACTAAAGTTGAAGTACTCAAGGTCATTGAGGAGT TACGGGCTAATGTTAACGTCATCGATCAGGGTAAAGATACCGGTATTTTGACTATTAGCTACAATGGCAGGGATCGTAAA CAAATTAAGAACATCCTTCAGACAATTATTGATTGCTATGCTCTTCAAAGTATTCATCGAAAAGCGGAAGAAGCAGAGAA GAGTCTGGGATTTATTAAGAGTCAGCTTCCACTGGTAAAAAACAATCTCGGTATCGCGGAAACGAAATTAAACGCCTTCA GAAGCCGTAATAATTCCGTTGATTTACCGATGGAAGCAAAATCAACTCTCGATAGCATGGTGCAACTCGATGGCCAGATT AATCAGCTTATCCTTAAAGAAACCGAAATTTCAAAACTATATACCACACAACATCCGGCTTACTTAGCATTGATTGAAAA AATCCAGGTTCTGAAAGATGAAAAGAAAAATCTGAATGAAAAAGTCAGCACCTTGCCTCTGATGCAACAGGAAGTCGTCA GATTGACGCGTGATGTCCAATCGGGTCAGCTCATTTATATGCAGTTGTTGAATAAGCAACAGGAACTTAAAATCAGCCAG GCAAGTACAATTGGCTCTGTCAGAATTATCGACCGTGCCGTCACAGGATTAAAACCGGTCAAGCCTAATAAAGCCCTGGC AATATTTATCTTTGCTTGCCTGGGATTGATTTCCTCAGTTGGATTTATACTGGCAAAAGTCTCATTGCAGCAGGGTATCG ATTCCGCAGAAATACTTGAAGATATCGGTCTTAATGTCGTTTCGAATGTACCTTTGTCAGAGTGGAGGAATAACCACTAT TCTAATTCTATGAGAGATACTCGGCCTGTTAGTTTGTTAGCCCTTGAAAAAACATCAGATATTGCGATAGAAGCCCTGAG GAATTTAAGAACCAGCTTGTATTTCTCAATGATGGAAGCTGGTTCAAATGTGCTGATGATTTCCGGTGCCACCCCGGAGG TAGGTAAAACATTCATCAGCTCCAACCTTGCAGTGGTAGTGAGTCAGGGTGAAAAGCGGGTCTTATATATTGACTGTGAC ATGCGAAAAGGATACGCGCATCGGATCTTCGATATTAAGAACGTCGGGTTAACAGAGGCCATTACGGGTTCAATCACATA TCAGGAAGCTGTTCAGAGCACTAAAATCCCCCGACTGGATATTATCACTCGCGGGAAGTTGTCAAAAAACCCTTCAGAGC TTTTGCTGCGTAAGCAGTATCACGATCTTATACATTGGGCCTCAGACAATTATGATTTCGTCATACTTGATGCGCCACCA GCCCTTGCGGTAAGCGATGCTGTTATTATAGGTAGATATGCAGGTATATCTATGCTGGTCGCTAAATTTGAGCAGAGCAC AGTACGTGAAATAGAATCCGCAATCAGAGTATTTAACAGAAATAATATTGATATTAATGGAGTGATACTCAACGCAGTAG TTAATAAGCCTTCAGGTTTTTATAACTATGGAAAAAAAGAAATATATGAATATCATTCACCTGAAACATGA Protein sequence : MIEKITGQSGNKNIPDEFDLRKNMGAIIDKRYIIIVITFIFVFIGLLYAFLSSPVYHADALVQVDPSGEIDMMSNISQLL PAKSPVSATEMQLITSRAILGETVTQLNLDTEVRFTSFPIIGEAIRRYSQPGVPRISVDIFEPRGGVIGDSYTLEILSNA EYQITSPSGATVSGMAGKILDTPEFRIEVNEINALKGDKFSVTKVEVLKVIEELRANVNVIDQGKDTGILTISYNGRDRK QIKNILQTIIDCYALQSIHRKAEEAEKSLGFIKSQLPLVKNNLGIAETKLNAFRSRNNSVDLPMEAKSTLDSMVQLDGQI NQLILKETEISKLYTTQHPAYLALIEKIQVLKDEKKNLNEKVSTLPLMQQEVVRLTRDVQSGQLIYMQLLNKQQELKISQ ASTIGSVRIIDRAVTGLKPVKPNKALAIFIFACLGLISSVGFILAKVSLQQGIDSAEILEDIGLNVVSNVPLSEWRNNHY SNSMRDTRPVSLLALEKTSDIAIEALRNLRTSLYFSMMEAGSNVLMISGATPEVGKTFISSNLAVVVSQGEKRVLYIDCD MRKGYAHRIFDIKNVGLTEAITGSITYQEAVQSTKIPRLDIITRGKLSKNPSELLLRKQYHDLIHWASDNYDFVILDAPP ALAVSDAVIIGRYAGISMLVAKFEQSTVREIESAIRVFNRNNIDINGVILNAVVNKPSGFYNYGKKEIYEYHSPET |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf41 | AAO18066.1 | Orf41 | Not tested | TTSS locus | Protein | 3e-133 | 42 |
