Gene Information

Name : siiE (SL1344_4197)
Accession : YP_005184062.1
Strain : Salmonella enterica SL1344
Genome accession: NC_016810
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 4503766 - 4520445 bp
Length : 16680 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
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GTATGGAATTTTCAATTTACCACAGCGTTATCCGATGGCTCGCATGACGTAACGGTAAAGGTAGAAGATATTGCCGGTAA
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GGGTTGATAATACAGACCATATTATTAATGAAAAGAATCCTGCACTGACAGGAACCGCTGCACCCTATTCAACGGTTAAA
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TAATTAGCGTCGATACTGCTATTTCAATACCGATAGTTTCATTGAGCCCGGATTCAGATTCGGGAATTTCAGATGATAAT
TTAACGAATATCGTTAAACCTACCTTGCACCTAAAAGATATTGATCCGGACATTATCAGTGTTCAGGTATGGGATGCCAT
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TGATGGGGTGGAACTGGTCAACGATAGCGGCGTGAAAGGCGATAATATGACCAACGACGACCGTCCCCACTTTCGTGTGA
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GGAAGCTGGGAGTATATCTGGCCGACAGACCTGGCAGATGGTCAATACACGCTAACGGTGGAAGCGACTGATAAAGCAGG
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ACACCGGCATCCAGGGCGATAACATGACGAATAGCACCCAGCCGACATTTGCCCTGCAGCATATTGATGATGATGCCGTT
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GCCGCCGACATCATGGGCGGATGGTGATTATACCCTGAGTGTGTCAGTCGAAGATAAAGCGGGGAACACCAGCCATTCTG
CATCGCTGACGGTGACGGTGGACACGCAAATCGCCATTAATAACATTGAACTGGTCAATGACAGCGGTATTCCCGACGAT
AATCTGACTAATAATGTGCGTCCGCACTTCCAGGTGACGGTACCGACGGATGTCAACGTGGTGCGCCTGAGCATTGACGG
CGGCAAGACGTGGTTCAACGCTACCCAGAGCGCGACGCCAGGCGTCTGGGATTATATCTGGCCGGATGATGTGGCCGACG
GAGGCTATACCCTGACGGTAGAAGCGACCGATGAGGCGGGAAATAAGGCAACACAGACGCTCGATTTCACCATCGATACC
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GCCGGGCTTTACCCTCAACAATATTGATACCGATGTCAGCCGGGTGATAGTGGAGGTAATGCACAATGGCATTAAACAGG
AGGTGCCACTGGTTCAGACCGGCGGACAGTGGCGCTTTGCGCCGACCAGCGACTGGGCGGACGGCGACTATATCCTGACG
GTGAAGGTAGAAGATAGGGCCGGAAATGTGAAGCAGTCCGCGCCGTTGACGGTGACAGTAGACACGCATATCGCCATTGA
CCGTATTGAACTGGTTAACGACAGCGGTATCCCCGGCGATAATCTGACCAATGAAGCGCGCCCGCACTTTCAGGTGACAG
TACCGGCGGATGTTAACGGTGTAAGACTGAGTATTGATGGCGGCAAAACGTGGTTTGACGCCACGCAGAGCGCGACGTCG
GGCGTCTGGGATTACACCTGGCTGACGAATGTGGCTAACGGCCCTCACACCCTGATGGTGGAAGCGTCCGACAAGGCGGG
AAACAAAACGACGCAGAAACTGGACTTCACCATCGATACCATTCTGTCAGAACCGACGATTACCCTGGACAGCGCGGATG
ATAGCGCCGCTGGCGATAACATCACCAACGTTAAGATGCCAGGCTTTACCCTCGGTAATATCGACGCCGACGTGACCAAA
GTGGTGGTGACGGTGGCGCATGATGGTAAGAACCAACAGATAGAGTTGATTAAGAACGGCGGTGTGTGGCGCTTTACGCC
GGGCGCAGCCTGGACCGATGGCGACTATACGTTGACGGTAAAGGTAGAAGATAAGGCGGGTAATACAAATTATTCTGCGC
CGCTGACGGTGACTATCGATACGCAAACGTCTATTGATCGCATTGAGCTTCTTAATGACACGGGTATTGTCGGGGATAAC
CTGACCAATGAAGCACGTCCACAGTTTCATATTACGGTACCGACGGACGTGAACTCTGTGCAACTGAGTCTTGATGGCGG
CATCAACTGGGTTAACGCAACGCTGACGTCTGACGGCGTTTGGGAGTATATATGGCCGACAGATCTGGTCGAAAATACGT
ATACCCTGACAGTGAAAGCAACCGATGTTGCAGGCAACACGGCGACGGAAACGCTCAATTTTATCATTGATACCACATTG
TCGACACCGACCATCACGCTGGATAGCGCAGATGATAGCGGCACCGCCAACGATAATAAGACTAACGTTAAAACGCCGGG
TTTTATTATCGGCGGTATTGATTCTGACGTGACTCAGGTCGTCGTGCAGGTGATGCGCGATGGTCACAGCGAGGAGGTGG
AGCTGACGCAGACTAACGGGCAGTGGCGTTTTGTACCCGGCAGCGCGTGGACTGATGGCGACTATACGCTGACGGTAACG
GTGAAAGATGAGGCGGGTAATATTCGCCACTCAGCGCCGTTGACGGTCACCATCGATACGCAAATCACCATTGACCATAT
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CGGATGTCAACGTGGTGCGCCTGAGCATTGACGGCGGTAAGACGTGGTTCAACGCTACCCAGAGCGCGACGCCGGGCGTC
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AACGACGCAGCAACTGGACTTCATCATCGATACCCTACTGTCAGAACCGACTATCGTGCTGGACAGCACGGACGACAGCG
GAACAAAAGGCGATCACCTGACCAACGTAAATAAGCCGACGTTTTTACTGGGCAATATTGACGCAGACGCGCGGTATGTC
ACGGTTGAGGTACAGCATGGCGGCACGAAAGAGGTGCTGACGGCCACCAAAGACGCGACCGGCAACTGGAGCGTGACACC
GACCGGCACATGGGCAGATGGCGACTATACGCTGACAGTGAGGGTGGAAGATGAGGCGGGGAACGAAAAACACTCAGCGT
CGCTGACGGTCACTGTTGATACCCAAATCACCATTGATGTTATTGAACTGGTTAATGATAACGGTATTCCCGGCGACAAT
ATGACTAACGACGCCCATCCGCAGTTCCGCGTGACGGTACCGGGGGACGTTAACGAAGTCAGTCTGAGCATTGACGGTGG
CGTGACCTGGGTTAAGGCGACACAGAGCGCGACGCCGGGCGTCTGGAATTATACCTGGCCGGGCACCGTGCCGGATGGCG
ACTATACGCTGAATGTGAAAGCGACTGACAATGCGGGTAATACGGTGACGGAGACACTCCACTTCACTATTGATACTACG
TTGTCGACGCCGGTGATCGTACTGGATAGCGCGGACGACAGTGGTGTCCATGGCGATAACATGACCAATCACACCCAGCC
GACATTTGCCCTGCAGCATATTGATGATGATGCCGTTCGCGTTACGGTCAGCGTAGAGCATGGCGGCGTCACCACCACAT
TTGACGCCACGAAAGACGCAGGCGGATGGACCTTTACGCCGACAGGGGCGTGGGCGGATGGTGATTATACCCTGAGTGTG
TCAGTCGAAGATAAAGCGGGGAACACCAGCCATTCTGCATCGCTGACGGTGACGGTGGACACGCAAATCGCCATTAATAA
CATTGAACTGGTCAATGACAGCGGTATTCCCGACGATAATCTGACTAATAACGTGCGTCCGCACTTCCAGGTGACGGTAC
CGACTGATGTCAACGTGGTGCGCCTGAGCATTGACGGCGGCAAGACGTGGTTCAACGCGACCCAGAGCGCGACGCCGGGT
GTCTGGGATTATACCTGGCTGGCTGATGTGGGAGAGGGGAAGCATACCCTGACAGTGGAGGCGACCGACAAGGCGGGAAA
CAAAACGACGCAGCAACTGGACTTCATCATCGATACCCTACTGTCAGAACCGACTATCGTGCTGGACAACACGGACGACA
GCGGAACAAAAGGCGATAACCTGACCAACGTAAATAAGCCGACGTTTTTACTGGGCAATATTGACGCAGACGCGCGGTAT
GTCACGGTTGAGGTGCAACATGGCGGCACGAAAGAAGTGCTGACGGCCACCAAAGGCGCGACCGGCATCTGGAGCGTGAC
ACCGACCGGCACATGGGCAGATGGCGACTATACGCTGACGGTGAGGGTGGAGGATGATGCGGGGAACGTAAAATACTCAG
CGCCGCTGACGGTCACGGTTGACACCCAAATCACCATCGATGTTATTGAACTGGTTAATGATAACGGTATTCCCGGCGAC
AACCTGACCAATGACGTTCGTCCACACTTCCGCGTCACGGTGCCAGGGGATGTCAACGAGGTACGTCTGAGTATCGACGG
CGGTAATACGTGGGTTCGTGCAACACAGGGCACGGCAGGGATCTGGGATTACACCTGGCCGAAAGATGTGACCGACGGGC
TACATACCCTGACGGTAGAAGCGACCGATAAGGCGGGAAATAAGACGACGCAGACGCTCGATTTTACCATTGATACCCGG
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GGGCTTTACTATTGGCAATATTGACGCCGATGCGCACTCGGTCATTTTGCGGATCACACAGGGCGGCAATAGCCAGGAAG
TGACACTAACCCAGGTTGGAGGACAGTGGCGCTTTACGCCAGATGCTGACTGGGCGGACGGTAGCTATACGCTGACGGTA
GAGGTAACGGATAACGCAGGAAACGTTCGTCAGTCCACGCCGCTGGTGGTGACGGTGGACACGCAAACCAGCATTACTGA
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CGGCGGATGTGAATTCTGTGCAACTGAGCATTGATGGGGGCGCAAACTGGGTGAGCGCGACGCAGGGTATCGAAGGCGTC
TGGGGCTATACCTGGCCAACGGATATGGGCGATGGAAAACACACCCTAACCGTCATGGTCACCGACAGAGCGGGCAATAC
GGCGACGCAAACGCTTGAATTTTTCATCGACACCCGGTTGTCGACGCCGACCATTGCGCTGGATAGCACGGATGATACCG
GTACGCCTGGCGATGATATGACCAATCGCACCCGACCGACCTTTATTCTGCAGAATATCGATTCGGATGTTATCAACGTT
ACAGTCAGCGTCACGCATAATGGAACGACAACCTCGTTTACTGCGACACAGGGGGCTGGAGGATGGAGCTTTACACCGCC
AGCGCCGTGGGGCGACGGTGATTATACGCTGACGGTGACAGTGGAGGATCGGGCGGGAAATACGCGTCCGTCTACGCCGC
TGACGGTGACAGTGGATACGCAAATAGCCATTGATCGTATTGAATTAGTCAACGATAGCGGCGTCCCTGGCGATAATGTG
ACAAAACATGTGCGTCCGCAGTTCCAGATCTCGGTACCGGATGATGTGGAAAAGGTTCTTCTGAGTATTGACGGCGGCAC
GACCTGGGTTACTGCAATCAAGAGTTCGACGGCTGGCATTTGGGATTACACCTGGCCGACGGATATGCCAGAGGGACAGC
ATACCCTGACCGTGGAAGTGACTGACGGTGCGGGTAATAAGATGACGGAGACGCTCAATTTCACTATCGATATCACGTTG
TTAACGCCAACCATTGAGCTAGCGCCCGATCAGGATACCGGACAGAATAAGAACGATAATCTGACCAGCGTCACTCAGCC
GGTATTTGTGTTGGGGAGTATCGATAAAGATGTTCGACACGTGGAATTGAGTATTGAGCATAACGGCACGTTTAAAACGG
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GGCGGGGAATGTAAAAGAGTCTGCGCCGTTTGAGGTGCGTATTGATACCACGACAACCATTAACAATATCGTATTGCTTA
ATGATACCGGCGTGCAGAATGATCAATTAACGAATGTTGCCAAACCGTCATTCAGAATTGACGTTCCCGGTGATGTCGTC
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CCCGAATACTCTGGTTGACGGCACATATACCCTTCGCGTAGAGGCCACGGATGAGGCAGGTAATATTGCGAATAAAGATT
TAGTATTTAATATCGATACTAATATACAGGTTCCTACTATTGCTTTAGACGCAGGACAAGATACCGGAGCGAATACCGCC
GATAATATTACTAATATTTCACGACCCACCTTTACGATTGGTAATGTTGACCCCGATGTTATCAAAGTCGTGGTGACGAT
TGATGGTCATGATTATAACGCGACTAAGGTTGGGGCTGGTTGGCAATTTACACCAGGCAATGCCATTCCGGATGGTTCTT
ATAATATTACCGTTACGGTTGAAGATAAGGCCGGAAATACCGCGACATCGAAACCATTACCTGTTGTGATAGATACGACG
GCTGAAATTGAAAGCGTCACGTTGGTTACAGATAGCGGTGATAGCGATGTAGATAACATTACCAAAGTCGACAAGCCGCA
GTTTAGTATTGTTACCGCTGATGATATTACCCATGTGCGCGTTAAAATCGATAACGCCGCTAATTGGATTGAACTCACAA
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CTGCCGGATGGCATGTATACCATCAACGTCGTCGCAACAGATGTCGCGGGAAATACTGCGCAAACGCAGGAAAGATTCAC
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GATGGCACATGGCGCGCGCCGATACTGCTGCAAGATGATGGTACGTTTAATATTCATTTCAGCATTACTGACGTTGCTGG
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TACCAGCGAGCTTGATGACAATAAATCATCATCGAAAACGGAATGGTGGAGTAATAGCGATCTCATTACCATGCGAGGCA
CGGGTGAAATTGGCGCTACGGTATCATTAATCGTGGCTGGCGTCACGCTGGCAACTGCTGTTGTGGCGGCAACAGGACGA
TGGGAATTATCAACAGACAAGCTTCCAGAAGGGACTTACGATATTAGTTTGGTCATTGAAGATAGCGCCGGAAATCGTTG
GGAAGATGTGCGTGAAATATTTATTGACCGAACGCCGCCAAATGCTCCGGTCGTAACGTATTCAGATATTGTCAACGATC
TAATTATTATGCAGGGGACGGCGGAAGCCAAATCTCAGCTAATAATAACCGATAGTGAGGGGAATACTTATACGTTAACC
GTTCCTGATAATGGTAAATGGAGTATGGCTATCCCGTATCCATCAGAAGGGAAGTTTACCATTACGAGTGTGGATGCTAT
TGGTAACCGGAGTGATGATGTCCCTCTCGATATCATGAAAGAGGTTCCCGTTATTTCATTATCTCCAGACTCAGACAGTG
GTACGGTGGGCGATAATATTACGCGAGATAAGCAACCTACCTTTATTATCGGGAATCTGGAAAGCGATGTTGTGGTCGTT
CAGGTCGATATCAATGGGACCGTATATAATGCTGAAAAAAATGCCGATGGCGTTTGGTTCTTTACGCCAGGTACACCGTT
AGCTGATGGTTCCTATACGATATCGGTAATCGCAAGCGATGCCGCGGGTAATCAGAAAAACTCGTTACCCATTACTGTCA
CGATCGACAGCACGCTGACGGTGCCGGAGATTGCGTTGGCAGCAGGTGAAGACAATGGCGCTTCAGACAGCGATAACGTG
ACGAATCACACCCAGCCTAAGTTCACGCTGCAGCATATTGATGCTGATGTGACCGGGGTGACCGTAAACGTGACGCATAA
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ACTACACGCTGAGCGTGACGGTGGTGGATCGCGCGGGGAATTCACAGCAATCTGCTTCGCTAGCGGTGACGGTTGACTCA
ACGGTGACGGTAACAGCGGATAGCCAGCATGACGATGCGAGCGATGACGCCACGGCAACAGCGGTTACTCCACCGGAGTC
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CCTATAGTATTACATTGTTAAACGCTGACTCTGGGGATGAAATAGATCGTTCAATTAGTCAGACACCTTCTTTTGAAATA
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Protein sequence :
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DDINDSPSTSSVGHNNNGAIDVFAVNEVTLPVDNQEEHA

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
STM4261 NP_463126.1 inner membrane protein Not tested SPI-4 Protein 0.0 100
siiE CAE11797.1 large repetitive protein Virulence SPI-4 Protein 0.0 100
SC4140 YP_219127.1 inner membrane protein Not tested SPI-4 Protein 0.0 99

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
siiE YP_005184062.1 hypothetical protein VFG0581 Protein 0.0 100