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Name : treC (Pmu_13220) Accession : YP_005177177.1 Strain : Pasteurella multocida 36950 Genome accession: NC_016808 Putative virulence/resistance : Unknown Product : trehalose-6-phosphate hydrolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 3.2.1.93 Position : 1424883 - 1426523 bp Length : 1641 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAGTAATAAAAATTGGTGGCAAAATGGGGTTATCTACCAAATCTATCCAAAATCTTTCCAAGATACAACGGGAAGTGG AACTGGCGATATTCAGGGAATTATTAAGCGTTTAGATTATTTAAAAGAATTGGGTGTTGATGGGCTTTGGATTACACCGA TGTATGTTTCGCCACAAATTGATAATGGTTATGACATCGCTAATTATCGTGATATAGATCCGAGTTATGGCTGTATGGCT GATTTTGAACAGTTAATTGCACAAGCGCATCAACGAGGCATCAAAATTGTGATGGATATGGTGTTTAATCATAGCTCAAC TTTCCATCGATGGTTTGTTGAGGGTGAGGACCCAAATAGCGAATATCACGACTATTATATTTGGCGTGAGAGCCTAACCA ATTGGAAGTCAAAATTTGGCGGTTCAGCATGGAAATGGTCTGACAAAGCACAAAAATATTATTTGCATTTATTTGCACCC GAGCAGGCGGATTTAAATTGGGAGAACTCAAAATTACGAGAAGAACTATTCGACATTTGTAAGTTTTGGGCAGAGAAAGG TATTGATGGCTTGCGCTTAGATGTGGTGAATTTAATTTCAAAACCTGAACAATTTGAAGATGAGCCCGAAGGGGATGGGC GTCGTTTTTATACGGATGGACCGAAAATTCACCAATATTTACAGTTATTAAATCAACGTGCACTCACTCCTTATGGCTTA ATGACGGTTGGAGAGATGTCTTCGACGACCTTAGAAAACTGTCAAAAATATGCCAATTTAGCAGGCACAGAACTCTCGAT GACTTTTAATTTTCATCATTTGAAAGTCGATTATCCAAATGGGGAAAAATGGACTTATGCTCAACCTGATTATGTGCAAT TGAAATCTATTTTTAACTATTGGCAACAAGGTATGTATGGCAAAGCTTGGAATGCCTTGTTCTGGTGTAATCATGACCAA CCGCGTATTGTGTCACGCTTTGGTAATGAAGAACAATGGCATCAAGAGTCAGCAAAAATGCTAGCTATGTTATTACACGG CTTGCAAGGAACGCCTTATATTTACCAAGGTGAAGAATTTGGTATGACAAATCCAAATTTCACTACTATTGAGCAATATC GTGATGTAGAAAGTTTAAATGCTTATGCAGAATTACAGGAAAAAGGCATTGATGAAACATTAATTATGCAAATTTTGGCA CAAAAGTCTCGTGATAATAGCCGAACACCAATGCAGTGGGATGACTCGGCACAAGCTGGATTTACAACAGGTGAGCCTTG GATTGATGTGGCAAAAAACTATTTAAAAATCAATGCAAAATCTGCCTTAGCTGACAAAAATTCAGTGTTTTATACCTATA AAAATTTGATCGCATTACGTAAGAAATTGCCGATTTTAACAGAGGGTGATTATCAAGATTTAGCCCCTGAACATCCCTTA TTGTGGTGTTATCAACGCCAGACTTTAGATGAAAAATTGCTTGTATTGGCTAATTTAAGTGAAGTAGAACAGATATTTGA ATTACCTCCAGCGTGGTGTCATAAGGAAGTCATATGTTTGATGAATAATTATGGAGACTATAGAATTGAAAATAGGCAAG TTACGTTAATGCCTTACCAAGCAGTCTATCTTCATCAATAA Protein sequence : MSNKNWWQNGVIYQIYPKSFQDTTGSGTGDIQGIIKRLDYLKELGVDGLWITPMYVSPQIDNGYDIANYRDIDPSYGCMA DFEQLIAQAHQRGIKIVMDMVFNHSSTFHRWFVEGEDPNSEYHDYYIWRESLTNWKSKFGGSAWKWSDKAQKYYLHLFAP EQADLNWENSKLREELFDICKFWAEKGIDGLRLDVVNLISKPEQFEDEPEGDGRRFYTDGPKIHQYLQLLNQRALTPYGL MTVGEMSSTTLENCQKYANLAGTELSMTFNFHHLKVDYPNGEKWTYAQPDYVQLKSIFNYWQQGMYGKAWNALFWCNHDQ PRIVSRFGNEEQWHQESAKMLAMLLHGLQGTPYIYQGEEFGMTNPNFTTIEQYRDVESLNAYAELQEKGIDETLIMQILA QKSRDNSRTPMQWDDSAQAGFTTGEPWIDVAKNYLKINAKSALADKNSVFYTYKNLIALRKKLPILTEGDYQDLAPEHPL LWCYQRQTLDEKLLVLANLSEVEQIFELPPAWCHKEVICLMNNYGDYRIENRQVTLMPYQAVYLHQ |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 2e-117 | 44 |
