Name : MI1_03255 (MI1_03255) Accession : YP_005174077.1 Strain : Leuconostoc mesenteroides J18 Genome accession: NC_016805 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 679136 - 681817 bp Length : 2682 bp Strand : + Note : COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) DNA sequence : ATGACCAATAAAAAACTATTACTTATTGATGGCAATTCGCTGGCTTTTAGAGCTTTTTATGCGATGTACAATCAGTTAGA TCGTATGATCTCGCATGAAGGATTGCATACAAATGCATTAGTGGCTTTTAATAACTTTTTAGATAAAATTGTAGATCCAA TGGCTCCAGATTTAGCATTAGTGGCTTGGGATGCTGGTTCTGGAAAAGAAACACATCGTGGGGAGTTATTTCCTGAATAT AAGGATGGCCGTTCTAAAGTACCAGAGGAATTTAAAGAACAGTTTCCATATTTACGTGAAATGGTTATGTTGCATGGATT GCGGAATTATGAACAGGCTGGATTAGAAGCTGACGATATCATTGGAACTTATTCACGTATGGGTGAAGCAGCAGGATATT CTGTCATTATTGTAACTGGCGATCAAGACTTGACGCAATTAGCCACGGAAAACGTTACTGTAAACGTGACTAAAAAAGGT GTAACAGATATTGAAAGCTATACACCAGCTTATATAAAAGAAAAATTTGGGATTACACCGGCTCAAATCATTGATAAGAA GGCGTTGACGGGCGATACATCTGATAATTACCCTGGTGTTACAAAGGTCGGTGAAAAGACAGCATTAAAACTTCTTGCCG AATATAATAACATTGACAATTTGTATGATAATATCGATAAACTGAAGCAGTCAAAAATGAAGGACAATTTGATCAATGAT CGTGAATTAGCCTTCCAAGCACGTGAATTAGCTACAATTTTAACTGATGCTAACTTACCTTTACCGCTTGAAGAAATGGA ATATAGAGGTGTCGATTTTGAGAAGATTATTCCATTCTATGAAAATTTGGATTTCAAACAACATTTAGCGAAAATAAAAG CATTACGTAAATCTGGGCAGCTTGAGAATACAAAAGAATTTGATAATGGTATAAATTTTGTCGAATTAAAAGAAAATAAT TTAAGAGCAATTGCGATGCTAGGTGATAAGATATCAGTTCATATTGAATTTGTGGGTGATAATTATCACGAGGGTGAAAT GATTGGTTTCGCCATTGGTAATCCAGAAGTTGGCTACTATGCTAGTCGTGACATCTCCTTGTTACAAACTGAAGAGTTGA AGTCGGTGATTGAGAATGAGCAGATTTTAAAAAATGTTTTCAATGTTAAAGCACAGCTTGTATTATTTAAGCGACTTGGT TTGGCGCTTAAGGGCGTGAATTTTGATTTTATACTGGTTGCATATTTGCTTGATACGGTAGCTAATGATAATGTTTTGTC CACTTTGGCACAGCGTTTTGATGTTTATTTGGCACCTGATGAAGATATTTATGGTAAAGGCGCCAAATTCACTGTGCCAA CCGATACCAATCTTTTATTGTCGCACATTGCTCATAAAGCGGATGGACTTTTCAAATTAGAAAAACCAGCGTTCACAGAA TTAAAGCAACACGAACAAACGCACCTATATACGGACATTGAGCTACCATTAGCGTTTGTTTTAGCTGATATGGAATATCA AGGGATTAAGGTCAATCCTGAATACTTACGAAATAAAGGCAAAGATTTATCCGAACGAATAGCTGATATTCAATCAGCCA TCTATATTGAAGCTGGTGAAGAGTTTAATCTAAACTCACCAAAACAATTAGGGGTATTGTTGTTTGAAAAAATGGGTTTA CCTGTAATTAAAAAAACAAAGACAGGCTACTCAACGGCTGTGGATGTTTTAGAAAAACTAGCACCGCAAGCGCCTATAGT TGACCATATTTTGCAGTATCGTCAGCTGGCGAAACTAAAATCAACTTACATTGACGGCCTGCTTTCAGTTATATATCCTA AGGACAGCAAGATTCACACACGATTTTTGCAGACTTTGACACAAACTGGTCGATTGTCATCAGTTGATCCTAATTTGCAG AATATTCCAATGCGTTCAGAAGAAGGGCGCTTAATCCGAACAGCATTTGTTCCTAGCCATCCGAATTGGCAAATATTTGG TGCCGATTATTCTCAAATTGAATTACGTGTTTTGGCCCATGTTACGGGTGATAAAAACATGCAAAAAGCCTTTCTAAATG GCGAAGATATCCATGCCGAAACAGCTCGAGCTGTCTTTGGCTTAGCCGATGATGCAGTAGTTGATCCACTTAAGCGTCGT ACGGCTAAAGCTGTGAATTTTGGTATTGTGTATGGTATTTCGGATTATGGATTGGCTAATAATTTGGGGATTTCACGTGC CGAGGCGAAACGTTTTATTGATACTTATTTCCAAGAGTTCCCTCAAATTCATGAATGGATGAATACAATTAAGACTTTTG CACATGAACATGGTTATGTAGAAACAATTGCCCATAGGCGACGTTATTTGCCAGATATTCAAGCAAAGAACTTTAATTTA AGGTCATTTGCTGAACGCACTGCGATGAACTCGCCCATCCAGGGTTCAGCAGCAGATATTATCAAAATTGCGATGATAAA GGTTAACGAGGCTTTACGAAAGAATAATTTACAGGCGAGAATGTTGCTTCAAGTACACGATGAATTGATTTTTGAAACCC CCGTAGACGAAATTGATGAATTGACCGAAGTTGTTACGAATGTTATGGATTCAGCCGTTGCATTAGATGTACCATTGAAA GTTGATGCACACCATGGTGACACTTGGTACGATGCAAAGTAG Protein sequence : MTNKKLLLIDGNSLAFRAFYAMYNQLDRMISHEGLHTNALVAFNNFLDKIVDPMAPDLALVAWDAGSGKETHRGELFPEY KDGRSKVPEEFKEQFPYLREMVMLHGLRNYEQAGLEADDIIGTYSRMGEAAGYSVIIVTGDQDLTQLATENVTVNVTKKG VTDIESYTPAYIKEKFGITPAQIIDKKALTGDTSDNYPGVTKVGEKTALKLLAEYNNIDNLYDNIDKLKQSKMKDNLIND RELAFQARELATILTDANLPLPLEEMEYRGVDFEKIIPFYENLDFKQHLAKIKALRKSGQLENTKEFDNGINFVELKENN LRAIAMLGDKISVHIEFVGDNYHEGEMIGFAIGNPEVGYYASRDISLLQTEELKSVIENEQILKNVFNVKAQLVLFKRLG LALKGVNFDFILVAYLLDTVANDNVLSTLAQRFDVYLAPDEDIYGKGAKFTVPTDTNLLLSHIAHKADGLFKLEKPAFTE LKQHEQTHLYTDIELPLAFVLADMEYQGIKVNPEYLRNKGKDLSERIADIQSAIYIEAGEEFNLNSPKQLGVLLFEKMGL PVIKKTKTGYSTAVDVLEKLAPQAPIVDHILQYRQLAKLKSTYIDGLLSVIYPKDSKIHTRFLQTLTQTGRLSSVDPNLQ NIPMRSEEGRLIRTAFVPSHPNWQIFGADYSQIELRVLAHVTGDKNMQKAFLNGEDIHAETARAVFGLADDAVVDPLKRR TAKAVNFGIVYGISDYGLANNLGISRAEAKRFIDTYFQEFPQIHEWMNTIKTFAHEHGYVETIAHRRRYLPDIQAKNFNL RSFAERTAMNSPIQGSAADIIKIAMIKVNEALRKNNLQARMLLQVHDELIFETPVDEIDELTEVVTNVMDSAVALDVPLK VDAHHGDTWYDAK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 52 |