Gene Information

Name : MI1_01530 (MI1_01530)
Accession : YP_005173734.1
Strain : Leuconostoc mesenteroides J18
Genome accession: NC_016805
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : proline/glycine betaine ABC transporter permease
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 307652 - 309367 bp
Length : 1716 bp
Strand : +
Note : COG4176 ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component

DNA sequence :
ATGAATAATTTAGTAAGTATTCCAAAAATTCCACTTGAAGATTGGGTCAGTTCAGCGGTTTCATGGTTAACTACTAATTT
ATCCGGATTTTTTGACGCCATTCAATCTGGCGGTCAATACATAATGGATGCTTTAACAAATGGTTTAACTGCTGTACCCA
TGCCACTAATGATTATTGGTATCACAGTAATTGCCATTGTTACGACACCGAAAAAGATTGGCTTTCCGTTATTCACACTT
TTGGGACTTTTGTTAATTGCCAATCAAGGACTTTGGTCTGACTTAATGAATACCGTTACATTGGTAATCATGGCGTCTAT
TGTTTCGTTGATTATTGGTATCCCCCTTGGAATTTTAACAGCAAAGTCACAAAAGACTGCGGTAGTTGTTCAACCAATCT
TAGACTTTATGCAGACTATGCCAGGATTTGTTTATTTAATTCCTGCTGTTGCCTTCTTTGGAATCGGTGTGGTTCCTGGT
GTGTTTGCTTCGATAATCTTTGCCCTACCACCGATGGTTCGTATGACTAGTTTAGGTATTCGTCAAGTTCCAGTTGATTT
GGTTGAAGCAGCTGATTCATTTGGATCAACTACTTGGCAAAAGTTGTTTAAATTAGAACTTCCTAGTGCAAAAAATACTA
TTTTAGCAGGCGCTAACCAAACAATCATGTTGGCATTGTCGATGGTTGTCACAGCTTCTATGATTGGTGCACCAGGCCTT
GGGCGTGGCGTCTTGTCTGCGGTTCAACACGCTGATGTTGGTTCTGGATTTGTTAACGGGCTTGGATTGGTAATCTTAGC
TATTGTTATTGATCGTTTTACACAAAAGTTTAACACCCAACCCGGACAAAAAGCGGTGACAAAGCCATGGCGTCGTTGGA
CAGTACTTGCGGCTTTGTTGGTTATGATTGGTGGAGGTGTTGTCAACACTTTGACTTCCGATAAAACAACAGGTCAAAAA
GTTACTATTGGCTATGTTGAGTGGGATTCAGAAGTTGCCTCTTCGAATGTGCTGGCTGAATCATTACGTCAACATGGATA
CGATGTCACGTTAACGCCATTAGATAATGCTGTTTTGTGGCAGTCGCTATCTAATAATCAAATTGATATTTCAGTTTCAG
CATGGTTGCCAGATACACACAAAGCTTTGTATGATAAGTACAAAAATGATGTAACATTGCTTGGCCCTAACTTGAAAGGT
GTTAAAACTGGATTAGTTGTTCCTGATTATATGGATGTAAATTCCATTAGTGATTTAACAACTCAAGCAAATAAGACAAT
CACAGGTATTGAGCCGGGGGCCGGTGAAATGGCCACAGCTGCTAATGCTTTGAAGTCGTATTCAAACTTATCGGCTTGGA
ACTTATCATCCTCATCTTCTGGTGCTATGGTATCAGCATTGGATAAAGCTTACAAAAATAAGCAAGATGTTGTGGTGACC
GGTTGGTCACCACACTGGATGTTTAGTAAGTACCACTTGAAGTTCTTGTCTGATCCAAAAAACGTGTTTGGATCTGGAGA
AACCATTAATACGATTGTGAATAAGAAGTTTAAAACTTCTAACCCCAAGGCCTATAAGGTTGCTGATAAATTTAATTGGA
CGAAAGATGACATGGAATCAGTCATGCTCGATATTCAAAATGGTCAAACACCAAAGCAGGCTGCTGCTAAATGGATTAAG
TCACATCAAAAGTTAGTTGATAGTTGGTATAAATAA

Protein sequence :
MNNLVSIPKIPLEDWVSSAVSWLTTNLSGFFDAIQSGGQYIMDALTNGLTAVPMPLMIIGITVIAIVTTPKKIGFPLFTL
LGLLLIANQGLWSDLMNTVTLVIMASIVSLIIGIPLGILTAKSQKTAVVVQPILDFMQTMPGFVYLIPAVAFFGIGVVPG
VFASIIFALPPMVRMTSLGIRQVPVDLVEAADSFGSTTWQKLFKLELPSAKNTILAGANQTIMLALSMVVTASMIGAPGL
GRGVLSAVQHADVGSGFVNGLGLVILAIVIDRFTQKFNTQPGQKAVTKPWRRWTVLAALLVMIGGGVVNTLTSDKTTGQK
VTIGYVEWDSEVASSNVLAESLRQHGYDVTLTPLDNAVLWQSLSNNQIDISVSAWLPDTHKALYDKYKNDVTLLGPNLKG
VKTGLVVPDYMDVNSISDLTTQANKTITGIEPGAGEMATAANALKSYSNLSAWNLSSSSSGAMVSALDKAYKNKQDVVVT
GWSPHWMFSKYHLKFLSDPKNVFGSGETINTIVNKKFKTSNPKAYKVADKFNWTKDDMESVMLDIQNGQTPKQAAAKWIK
SHQKLVDSWYK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
opuABC YP_281522.1 glycine betaine-binding protein/glycine betaine transporter permease Not tested Not named Protein 2e-143 59