Gene Information

Name : tktB (SCc_184)
Accession : YP_005060370.1
Strain : Serratia symbiotica Cinara cedri
Genome accession: NC_016632
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : transketolase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 344686 - 346680 bp
Length : 1995 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGTCACCCCGCAAAGAGCTTGCTAATGCTATTCGCGCACTTAGTATGGATGCCGTGCAAAAAGCAAATTCCGGTCATCC
AGGCGCACCTATGGGGATGGCAGATATCGCTGAAGTTCTATGGCGTGACTATCTAAACCACAATCCAATGAATCCACTAT
GGGCTAATCGCGATCGTTTTGTGCTATCAAACGGTCACGGTTCTATGTTGATTTATAGTATACTGCACTTAACTGGTTAT
GATTTACCGATAAGTGAGTTAAAAAATTTTCGCCAGTTGCGTTCTAAAACACCAGGACACCCTGAATATAGTTATACTCC
TGGCGTTGACACTACCACCGGTCCATTAGGGCAAGGTATTGCAAATGCTGTTGGTTTTGCTATCGCTGAACGTACGTTAG
GTGCACAGTTTAATCGTCCAGGTTACAATATTGTCGACCATTTTACTTATGTTTTTATGGGTGATGGTTGCATGATGGAA
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GGGATGCTAAAATTGTTGGTGAGGCTAAAGAAGTTGCTTGGAATCAGCGTTTTGATGCTTATGCTATAGCTTTCCCTGAG
CTTGCTGTTGAGTTTAAGCGCCGTATGAGTGGTACCTTACCAATGAATTGGTCAACTGCAGCAAAAGTATTTGTAGAGCG
ATTACAGGCACATCCAGCTAATATCTCTAGTCGTCAAGCATCGCAGAATGCGCTAGAAAATTATGGCAAACTATTGCCAG
AATTTCTTGGTGGTTCTGCTGATTTAGCGCCGAGTAATTTAACTATATGGTCAGGGTCTAAGCCACTTAATCTAGATCTT
GCTGGTAACTATATTCACTATGGTGTACGTGAGTTTGGTATGATGGCTATTACGAATGGTATTGCTTTGCACGGTGGTTT
TCTTCCATATTCAGCTACATTTTTAATATTTGTTGAATATGCGCGCAATGCGGTACGCATGGCTTCGTTAATGAGGTTAC
GTAATTTATTTATTTACACGCACGATTCTATAGGTTTAGGGGAAGATGGCCCAACTCATCAACCAGTGGAGCAATTGGCT
AGCTTACGTATGACTCCAAATATGAGTACTTGGCGTCCTTGTGATCAGGTAGAATCAGCTATTGCTTGGCAGTGCGGTAT
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CTAATGTATATCGTGGCGGATACGTACTAAAGGACTGCACTGGCGTGCCAGAAGTGATTCTAATCTCTACTGGCTCGGAA
GTTGGGATCACGATAGAAGCGGCAGAAAAGTTAACTACAGCTAGTCATAAAGTGCGTGTAGTATCAATGCCGTCTACTGA
TGTATTTGATAAACAAGATATTACATATCGTCAATCAGTTTTACCGTCATCTGTTACTGCTCGTGTAGCAGTAGAAGCGG
GTATCACGGATTATTGGTATAAGTATGTAGGTTTAAATGGCGCGATTATTGGTATGACTACTTTTGGTGAGTCAGCTCCC
GCAGAGTTATTATTTAAAGAATTTGGTTTTACTGTGGATAACGTAGTAGTAACGGCACGGTCGCTGTTGATATGA

Protein sequence :
MSPRKELANAIRALSMDAVQKANSGHPGAPMGMADIAEVLWRDYLNHNPMNPLWANRDRFVLSNGHGSMLIYSILHLTGY
DLPISELKNFRQLRSKTPGHPEYSYTPGVDTTTGPLGQGIANAVGFAIAERTLGAQFNRPGYNIVDHFTYVFMGDGCMME
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VGITIEAAEKLTTASHKVRVVSMPSTDVFDKQDITYRQSVLPSSVTARVAVEAGITDYWYKYVGLNGAIIGMTTFGESAP
AELLFKEFGFTVDNVVVTARSLLI

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
tktA AAO17218.1 TktA Not tested tcd island Protein 0.0 76
APECO1_2641 YP_859417.1 transketolase Not tested Not named Protein 0.0 65