Name : tktB (SCc_184) Accession : YP_005060370.1 Strain : Serratia symbiotica Cinara cedri Genome accession: NC_016632 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 344686 - 346680 bp Length : 1995 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTCACCCCGCAAAGAGCTTGCTAATGCTATTCGCGCACTTAGTATGGATGCCGTGCAAAAAGCAAATTCCGGTCATCC AGGCGCACCTATGGGGATGGCAGATATCGCTGAAGTTCTATGGCGTGACTATCTAAACCACAATCCAATGAATCCACTAT GGGCTAATCGCGATCGTTTTGTGCTATCAAACGGTCACGGTTCTATGTTGATTTATAGTATACTGCACTTAACTGGTTAT GATTTACCGATAAGTGAGTTAAAAAATTTTCGCCAGTTGCGTTCTAAAACACCAGGACACCCTGAATATAGTTATACTCC TGGCGTTGACACTACCACCGGTCCATTAGGGCAAGGTATTGCAAATGCTGTTGGTTTTGCTATCGCTGAACGTACGTTAG GTGCACAGTTTAATCGTCCAGGTTACAATATTGTCGACCATTTTACTTATGTTTTTATGGGTGATGGTTGCATGATGGAA GGCATTTCTCATGAGGTTTGTTCGTTAGCTGGTACGTTAAAGCTTGGTAAGTTAATTGTTTTTTATGATGATAATGGTAT TTCTATTGATGGTCATGTCGATGGTTGGTTCACTGATAATACTGCTATGCGGTTTGAATCTTATGGATGGCATGTAATAC GTAATATCGATGGTCACGATTATAAGGCTATTAATTCAGCAATTAAAGATGCCCATAGCTTTATTCATAAACCATCACTA CTAATATGTAAAACTATAATCGGTTTTGGTTCACCGAATAAAGCAGGTAGTCATCATTCTCACGGTGCTGCACTTGGCTT ATCTGAAATAGCCGCTACTCGAAAACAGCTTGGTTGGAAATACGCGGCGTTCGAGATTCCACAGCACATTTATGCTCAAT GGGATGCTAAAATTGTTGGTGAGGCTAAAGAAGTTGCTTGGAATCAGCGTTTTGATGCTTATGCTATAGCTTTCCCTGAG CTTGCTGTTGAGTTTAAGCGCCGTATGAGTGGTACCTTACCAATGAATTGGTCAACTGCAGCAAAAGTATTTGTAGAGCG ATTACAGGCACATCCAGCTAATATCTCTAGTCGTCAAGCATCGCAGAATGCGCTAGAAAATTATGGCAAACTATTGCCAG AATTTCTTGGTGGTTCTGCTGATTTAGCGCCGAGTAATTTAACTATATGGTCAGGGTCTAAGCCACTTAATCTAGATCTT GCTGGTAACTATATTCACTATGGTGTACGTGAGTTTGGTATGATGGCTATTACGAATGGTATTGCTTTGCACGGTGGTTT TCTTCCATATTCAGCTACATTTTTAATATTTGTTGAATATGCGCGCAATGCGGTACGCATGGCTTCGTTAATGAGGTTAC GTAATTTATTTATTTACACGCACGATTCTATAGGTTTAGGGGAAGATGGCCCAACTCATCAACCAGTGGAGCAATTGGCT AGCTTACGTATGACTCCAAATATGAGTACTTGGCGTCCTTGTGATCAGGTAGAATCAGCTATTGCTTGGCAGTGCGGTAT TGAACGCAATGATGGTCCAACCGCGCTAGTATTTTCACGTCAGAATTTAGTGCAGCAGCCACGTACTACAGAGCAGCTAG CTAATGTATATCGTGGCGGATACGTACTAAAGGACTGCACTGGCGTGCCAGAAGTGATTCTAATCTCTACTGGCTCGGAA GTTGGGATCACGATAGAAGCGGCAGAAAAGTTAACTACAGCTAGTCATAAAGTGCGTGTAGTATCAATGCCGTCTACTGA TGTATTTGATAAACAAGATATTACATATCGTCAATCAGTTTTACCGTCATCTGTTACTGCTCGTGTAGCAGTAGAAGCGG GTATCACGGATTATTGGTATAAGTATGTAGGTTTAAATGGCGCGATTATTGGTATGACTACTTTTGGTGAGTCAGCTCCC GCAGAGTTATTATTTAAAGAATTTGGTTTTACTGTGGATAACGTAGTAGTAACGGCACGGTCGCTGTTGATATGA Protein sequence : MSPRKELANAIRALSMDAVQKANSGHPGAPMGMADIAEVLWRDYLNHNPMNPLWANRDRFVLSNGHGSMLIYSILHLTGY DLPISELKNFRQLRSKTPGHPEYSYTPGVDTTTGPLGQGIANAVGFAIAERTLGAQFNRPGYNIVDHFTYVFMGDGCMME GISHEVCSLAGTLKLGKLIVFYDDNGISIDGHVDGWFTDNTAMRFESYGWHVIRNIDGHDYKAINSAIKDAHSFIHKPSL LICKTIIGFGSPNKAGSHHSHGAALGLSEIAATRKQLGWKYAAFEIPQHIYAQWDAKIVGEAKEVAWNQRFDAYAIAFPE LAVEFKRRMSGTLPMNWSTAAKVFVERLQAHPANISSRQASQNALENYGKLLPEFLGGSADLAPSNLTIWSGSKPLNLDL AGNYIHYGVREFGMMAITNGIALHGGFLPYSATFLIFVEYARNAVRMASLMRLRNLFIYTHDSIGLGEDGPTHQPVEQLA SLRMTPNMSTWRPCDQVESAIAWQCGIERNDGPTALVFSRQNLVQQPRTTEQLANVYRGGYVLKDCTGVPEVILISTGSE VGITIEAAEKLTTASHKVRVVSMPSTDVFDKQDITYRQSVLPSSVTARVAVEAGITDYWYKYVGLNGAIIGMTTFGESAP AELLFKEFGFTVDNVVVTARSLLI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 0.0 | 76 |
APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 65 |