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Name : Clocl_2645 (Clocl_2645) Accession : YP_005047135.1 Strain : Clostridium clariflavum DSM 19732 Genome accession: NC_016627 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.7.7.7 Position : 3057910 - 3060600 bp Length : 2691 bp Strand : - Note : PFAM: 3'-5' exonuclease; 5'-3' exonuclease, C-terminal SAM fold; 5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain; DNA polymerase family A; TIGRFAM: DNA polymerase I DNA sequence : ATGAATAAGAAAAAATTAATGGTTATTGATGGAAATAGTATATTGAACAGGGCTTTTTATGGTCTGCAAGGCCCTAATCT TTTGGCAACATCGGATGGATTGTATACTAATGCTGTTTATGGATTTATAAACATAATGAATAAGTATATTGAAGAGGAGA ATCCACAGTACATCTGTGTTGCTTTCGATTTGAAGGCACCTACATTCAGACATAAGCAATTTGACGGTTACAAGGCAAAT AGAAAGGGAATGCCTGATGAATTGAGGGTTCAGGTGCCGGTTATCAAGGAAGTACTTGATGCAATGCGTATAAAAAGACT TGAGATGGAAGGCTATGAAGCTGACGACATACTTGGGTCCATATCCTTGTGTGCACAGCAAAAAGGTATGGAGGTAATAA TCATTACCGGTGACAGAGATGCACTACAGCTTGCAGACAAGGATATAAGGATTAAGATACCTAAAACTAAGGGTGGTAAA ACCGAGACAGAAGAGTATAATCTTGAGACAATACATGGAAAATATAAAATTGAGCCTGTTCAGTTTATTGATGTCAAAGC TCTGATGGGAGATACATCCGACAATATACCCGGTGTTCCGGGAATAGGTGAAAAGACTGCTTTAGATCTTATTCAAAATT ACGGCACCATCGAAAATTTGTATGAGAATGTTGACAATATTACAAAAAAAGCGCTTAAAGAGAAGCTTATAACCTATAAG GAACAGGCTTTTATGAGCAAGGAACTGGCCAGAATTGAAAGGAACATGCCCTTTTTGTGCAATATTGACGAACTTGCAAG AGTAGAGTTTGATAAACCAAGACTTTATGAACTTTTTAAGCGTTTGGAGTTTAAAAGTTTTATTGAAAAATTCGGATTGA AAGACAGTCAGAATCAGGAATCTTTTAAAGTTAATATAAAGAGAATTAAAGACAAACAAGGAATTTTGGAATTAAAAAAC GAGATTTTCGAAGAAAAAGAGATGTCCTTTTATTATTTGATAGATAAAGTTGATAAGTTTACAAACAAACTTTCGGGTAT TTCTATATCAGCTAAAGAGGGAAACTCGTATTATCTGGCATTTAATGAAGATTATAATGAGAAGGAATTTTTAGAAGAAT TCAAAAGTATTTTTGAAGATTCCGACATCAAGAAATACGGACATGATCTGAAGAATTTTATTGTATATTTAAAGAACAGA GGGATTGAGTTAAACGGAATTGCCTTTGACACCATGATAGGGGCATATATCATAAATCCTTCCCGCGACACTTATACCAT CTCGGAATTGGCAAACGATTATCTGGGCTTAAGTGTAAAGTCGGTAGAAGAGATGGCGGGCAAGGGTAGGAATTTTATGC CTTTTGATGCTATGGATGAGGAAGAACTTAAAAATGTTGCAGGCCTGTATCCGGAAGTAATATTTAAATGCAAGAACAAA ATTGAAGAAAAACTTGGAGAAAACGATCAGATAAAACTTTACTATGAAATTGAGCTACCATTGGTTGAGGTTCTTGCAGA TATGGAATATTACGGGTTTAAGGTCAATGTTAATGAACTTATGTCCATCTCAAGGCAGTTGGATGAAAAAATCCAGGAAC TTACCGTGAAAATATACGAACTTGCTGGGGAAGAGTTTAATATTAACTCTACCAAACAATTGGGTGTAATACTGTTTGAA AAACTGGAACTGCCTGTTATAAAAAAGACTAAGACAGGATATTCCACCGATGCAGAGGTTTTGGAGGAGCTTGCCGACAA GCATGAAATTATACCTAAAATCCTTGAGTATCGTCAGTTGATAAAATTGAAGTCTACTTATATTGATGGCTTGATGTCGG TTATAAATCCTGTTACCGGGAAAATTCATTCCAGTTTTAACCAGACTGTTACTGTAACGGGCAGAATAAGCAGTACAGAG CCTAATCTTCAGAATATTCCCATTAAACTTGAAATGGGAAGGAATATAAGGAAGGCTTTTGTATCAAGTGATGAAAATTA CAGGTTGGTGGATGCCGACTACTCCCAGATAGAGCTCAGAGTATTGGCGCATATAACCGGCGATGTCAACATGATTGAAG CCTTCAATAAAAATGAAGATATTCATGCTTCAACGGCTTCAAAGGTATTTGGAGTGCCAATTAACGAAGTGACTCCTCTG TTGAGGTCCAAAGCAAAGGCGGTAAACTTTGGAATAGTATATGGAATTGGAGATTTCAGTCTTTCAAAAGACCTTGGCAT AACAAGAAAAGAGGCTAGGGCGTATATTGACGGGTATCTTGAGAAGTATGCCAATGTAAAAAAGTATATGCATGACATTG TAGTTCAGGGAAAGGAATTTGGCTTTGTCACTACATTGTTTGGCAGGAGAAGATATTTGCCCGAGCTTAAATCCAGCAAT TTCAATATCAGGTCTTTTGGCGAAAGAATAGCTATGAATACACCTATTCAAGGAAGTGCTGCCGATATTATCAAAATTGC AATGGTTAAAGTATATAAAGAGCTAAAGGCAAGAAAACTTAAATCAAGGCTGATTCTGCAGGTTCACGACGAACTCATTA TTGAAGCGCATGTTAGTGAAGTGGAAGAAGTGACAACCATTTTGAAAGAGAGCATGGAAAATGCAGTTAAATTGAGTGTT CCTTTAAGTGTGGAAGTAAAATCAGGTTCTAATTGGTATGAGACAAAATAG Protein sequence : MNKKKLMVIDGNSILNRAFYGLQGPNLLATSDGLYTNAVYGFINIMNKYIEEENPQYICVAFDLKAPTFRHKQFDGYKAN RKGMPDELRVQVPVIKEVLDAMRIKRLEMEGYEADDILGSISLCAQQKGMEVIIITGDRDALQLADKDIRIKIPKTKGGK TETEEYNLETIHGKYKIEPVQFIDVKALMGDTSDNIPGVPGIGEKTALDLIQNYGTIENLYENVDNITKKALKEKLITYK EQAFMSKELARIERNMPFLCNIDELARVEFDKPRLYELFKRLEFKSFIEKFGLKDSQNQESFKVNIKRIKDKQGILELKN EIFEEKEMSFYYLIDKVDKFTNKLSGISISAKEGNSYYLAFNEDYNEKEFLEEFKSIFEDSDIKKYGHDLKNFIVYLKNR GIELNGIAFDTMIGAYIINPSRDTYTISELANDYLGLSVKSVEEMAGKGRNFMPFDAMDEEELKNVAGLYPEVIFKCKNK IEEKLGENDQIKLYYEIELPLVEVLADMEYYGFKVNVNELMSISRQLDEKIQELTVKIYELAGEEFNINSTKQLGVILFE KLELPVIKKTKTGYSTDAEVLEELADKHEIIPKILEYRQLIKLKSTYIDGLMSVINPVTGKIHSSFNQTVTVTGRISSTE PNLQNIPIKLEMGRNIRKAFVSSDENYRLVDADYSQIELRVLAHITGDVNMIEAFNKNEDIHASTASKVFGVPINEVTPL LRSKAKAVNFGIVYGIGDFSLSKDLGITRKEARAYIDGYLEKYANVKKYMHDIVVQGKEFGFVTTLFGRRRYLPELKSSN FNIRSFGERIAMNTPIQGSAADIIKIAMVKVYKELKARKLKSRLILQVHDELIIEAHVSEVEEVTTILKESMENAVKLSV PLSVEVKSGSNWYETK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 4e-161 | 43 |
