Gene Information

Name : pyk (PECL_894)
Accession : YP_005004839.1
Strain : Pediococcus claussenii ATCC BAA-344
Genome accession: NC_016605
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : pyruvate kinase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 894919 - 896682 bp
Length : 1764 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGAAAAAAACCAAGATTGTTTCAACACTTGGTCCTGCAAGTACTTCAGTCGACACAATTGTTAAATTGATCGAAGCCGG
AGCTAATGTTTTCCGCTTTAACTTTTCACATGGTGACCATGAAGAACATTTAGATCGCTATAACAAGGTTAAAGAAGCTG
AAAAGATTACAGGAAAAACTGTTGGTATTCTTTTAGATACAAAAGGTGCTGAGATCCGTACTACTGCACAAAAAGACGGT
AACCAAGAATATCGCACTGGTGATAAGGCTCGTATTTCAATGGACGACTCATTAGAAACAACCAAAGAAACGATCGCTGT
TACATATCCTGGACTTTTCGACGATGTTAACGTCGGTGGTCATGTGCTTTTTGATGATGGATTACTTGATTTTAAAGTTG
ACGAAAAAGACGTTGAAAATAAGGAACTTGTTGTTCATGCAACAAACAATGGTACTTTAGGTTCACGTAAGGGTACTAAC
GCTCCCGGTGTATCAATTAATTTACCAGGTATTACTGAAAAAGATGCTGATGACATTCGTTTTGGTGTTGACTCAATGAA
CATCAACTTCATTGCGGCAAGCTTTGTTCGTAAGCCACAAGATGTTCTTGAAATTCGTCAATTGCTTGAAGAAAAAGATG
TAAATGATGTTCAAATCTTCCCTAAGATTGAATCTCAAGAAGGTATTGATAACATTGATGAGATTTTAAAGGTTTCAGAT
GGTTTAATGATTGCTCGTGGAGACATGGGTGTTGAAATTCCTGCTGAAAATGTTCCTTTGGTTCAAAAATCATTGATTAA
GAAGTGTAATGCTTTGGGTATGCCAGTTATTACTGCTACACAAATGTTAGACTCAATGATTGAAAATCCTCGTCCAACTC
GTGCTGAGGCTTCTGATGTTGCTAATGCTGTTTGGGATGGAACAGACGCTACTATGCTTTCTGGCGAAAGTGCTAATGGT
GATTACCCAGTTGAAGCTGTTGCAACAATGGCTAAAATTGATGAAAAAGCCGAAAATGCTATGTCAGAAGATGGTAACCT
TCAAATTAATAAGTTTGACCAAAGTGATGTCACTGAAACAATCGGTGCTGCTGTGGCTCGTGCTGCACGTAACCTTGGCG
TTAAAACAATTGTTGCGGCTACACAGTCAGGCTATACTGCTAAGATGATTTCAAAATATCGTCCTAACGCTGACATTTTG
GCTGTTACTTTCTCAGATCGAGTTCGTCGTGGATTAACAGTTAACTGGGGTGTACATCCTATTGTTACTGAAAAGCCAGC
AACAACAGATGAGATGTTTGACTTAGCAGCTAACAAGGCTGTTGATCTTGGATTTGCTAAGGAAGGTGATTTAATTTTGA
TCACTGCTGGTGTCCCTGTTGGGGAAACTGGTACAACAAATATGATGAAACTTCAATTAATTGGGTCCAAGTTGGCAACC
GGCCAAGGTGTCGGTGATGAGACCGTAATCGGAAAAGTTATTACTGCAACTTCTGCTAAAGAAGCTAACAGTAAAGCTGT
TGAAGGTGGAATCCTTGTTACAAAGACAACTGACAAAGATTATTTGCCAGCAATTGAAAAATCAAGTGCCTTAGTTGTTG
AAAACGGCGGATTGACTTCACATGCTGCAGTTGTTGGAATTTCAATGGGAATTCCTGTTATTGTTGGTGTCCAGAATGCA
ACGTCAATTCTTTCTGATGATGAATTAATTACGGTTGATTCTCGTCGTGGCGTGATTTATCACGGTGCTTCAAATTCAAT
CTAA

Protein sequence :
MKKTKIVSTLGPASTSVDTIVKLIEAGANVFRFNFSHGDHEEHLDRYNKVKEAEKITGKTVGILLDTKGAEIRTTAQKDG
NQEYRTGDKARISMDDSLETTKETIAVTYPGLFDDVNVGGHVLFDDGLLDFKVDEKDVENKELVVHATNNGTLGSRKGTN
APGVSINLPGITEKDADDIRFGVDSMNINFIAASFVRKPQDVLEIRQLLEEKDVNDVQIFPKIESQEGIDNIDEILKVSD
GLMIARGDMGVEIPAENVPLVQKSLIKKCNALGMPVITATQMLDSMIENPRPTRAEASDVANAVWDGTDATMLSGESANG
DYPVEAVATMAKIDEKAENAMSEDGNLQINKFDQSDVTETIGAAVARAARNLGVKTIVAATQSGYTAKMISKYRPNADIL
AVTFSDRVRRGLTVNWGVHPIVTEKPATTDEMFDLAANKAVDLGFAKEGDLILITAGVPVGETGTTNMMKLQLIGSKLAT
GQGVGDETVIGKVITATSAKEANSKAVEGGILVTKTTDKDYLPAIEKSSALVVENGGLTSHAAVVGISMGIPVIVGVQNA
TSILSDDELITVDSRRGVIYHGASNSI

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
STY1744 NP_456147.1 pyruvate kinase Not tested SPI-2 Protein 3e-89 46
pykF YP_216386.1 pyruvate kinase Not tested SPI-2 Protein 2e-89 46
pykF NP_805051.1 pyruvate kinase Not tested SPI-2 Protein 2e-89 46
pykF CAA68205.1 pyruvate kinase like protein Not tested SPI-2 Protein 5e-89 46

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
pyk YP_005004839.1 pyruvate kinase VFG0479 Protein 7e-90 46