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Name : PECL_329 (PECL_329) Accession : YP_005004317.1 Strain : Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 Genome accession: NC_016605 Putative virulence/resistance : Unknown Product : S1 RNA binding domain-containing protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 342307 - 344484 bp Length : 2178 bp Strand : + Note : - DNA sequence : TTGGAAGAAAACGTACTTAATATAGTAGAAAAAGAATTAAATCAATATCGACCGATTCAAATAAATGCAACACTTGATAT GCTTGAAGACGGTAATACGGTTCCGTTTATTGCACGATATAGAAAAGAACGAACTCATAGTTTGGACGAAGTTCAGATAC GAGAGATTCAAGCGACGTACCATCAAGTTGAAACACTTGAGAAACGTAAAGCAGATGTTATTAAGAACATTGAGGAGCAA GGAAAGTTAACTTCTGAACTCAGAAGATCAATCACAAAAGCAACTGCATTGCAGACGGTTGAAGACTTGTATTTACCATA TAAACAAAAACGTCGCACTAAGGCAACTATTGCAAAAGAGGCTGGGCTTGAACCGTTTGCTTCATGGTTATTAACATTTC CAACTAATGAAATTAATAAAAAAGCCGAGCAATTTTTAAATTCTGATCAAGACATTAATACAGTTGACGATGTTTTGGCA GGCGTTCATGAGATCTTGGCGGAAGCCTTTGGAGATAATGCTGACTTTCGTGATTGGATAAGAACTTATACTAAGAAAAA TGGACTTTTAACATCTGTTCTTAAGTCAAAAGGCGAAGAACATGATGAAAATGAAGTGTACAAACTTTATTATGATTTTT CAGAACAATTTAATAAAGTTGTATCACACCAAATGCTAGCAATTAATCGTGGTGAAAAAGAAAAAGTTCTTAGAGCCAAG ATTGACGTTAATGAAGATGGGATTGAACGCTTTTTGCGGTTTAGAATTATTGGAGATAAGACTGGAGAAGCTCTTCCAAT TATTGAAGATGCATATCGAGATGCTTATAAGCGTTTTATCGGACCGGCAATTGAGCGTGAATTAAGGGCGGAATTAACCG AAAGTGCAAGTCAACAAGCAATTAAGGTGTTTGGAGATAACCTATATCATTTGTTGATGCAAGCACCCTTAAAGGGAAAG GTAGTTCTCGGATTTGATCCTGCATATCGTACAGGATGTAAATTAGCTGTGATGGATGAAAACGGGAAATTTTTGGATAA ATTGGTAATTTATCCACATAAACCAGCATCGGCATCAAAAAGGGCTGAGGCAGGAAAACTCTTCAAAGATTTTCTGAATA AGTATCAGGTTGAAATGATTGCAATTGGAAATGGGACAGCCAGTCGTGAGTCGGAAGAGTTTGTTGCGCAGAAATTAAAA GAAATTGATCGAAAGATTTACTATGTCATTGTGAATGAGGCTGGGGCATCCGTTTATTCGGCAAGCCCAGAAGCACGTAA AGCATTTCCTGAATTACAGGTTGAAGAACGAAGTGCCATCAGTATCGGGCGTCGTTTGCAAGATCCACTAGCAGAGTTAA TAAAAATTGATCCACAAGCAGTTGGCGTAGGTCAATATCAGCATGATTTGCCACAAAAAGAGTTGACCGAACAGCTTGAT GGAGTTGTGGAAACTGCGGTTAATCAAGTTGGGGTTAATCTTAATACAGCTAGCCCAGAATTATTAACACATATTTCTGG TTTAACTAAAACAACGGCTCAAAACATTGTTAATTTTCGTGATGAAAACGGACGTTATGATGCGCGTAATCAGCTTAAAA AGGTACCACGTTTAGGACCGAAGGCTTTTGAACAAGCGGTCGGATTCTTGCGAATTGTTGATGGCAAAGATGTGCTAGAC AATACTGATGTTCATCCAGAAAGCTATAAAGCTGCTAAACAGTTATTGAAAGACTTAGGAATTGGAATGGATTCTTTGGG GCAGGATGAAACTATTCAGAAGCTTAAGAATGCAAATATTCAGCAGTTATCCAACCAACTTAAGATAGGGAGTGAAACCC TGACCGACATCATAGAAGCTTTACAAAAACCAGGTCGTGATTTACGTGATGCTATGCCGGCACCGTTACTTAGAGCGGAT GTTTTGACTATGGAAGACCTTAAACCTGGAATGGAGCTACAAGGTACGGTTCGTAACGTGATTGATTTTGGCGCTTTTGT TGATATTGGGGTCAAGCAAGACGGCTTGGTACACATTTCCAAGCTAACCAAACAGTTTGTTAAGAAACCAAGCGATATTG TGTCAGTGGGCGACATCGTCACAGTATGGGTGGAAAGCGTTGATTTAAATCGACATCGTATTCAGTTAACAATGATACAG GATGAGAATAAAAAATAA Protein sequence : MEENVLNIVEKELNQYRPIQINATLDMLEDGNTVPFIARYRKERTHSLDEVQIREIQATYHQVETLEKRKADVIKNIEEQ GKLTSELRRSITKATALQTVEDLYLPYKQKRRTKATIAKEAGLEPFASWLLTFPTNEINKKAEQFLNSDQDINTVDDVLA GVHEILAEAFGDNADFRDWIRTYTKKNGLLTSVLKSKGEEHDENEVYKLYYDFSEQFNKVVSHQMLAINRGEKEKVLRAK IDVNEDGIERFLRFRIIGDKTGEALPIIEDAYRDAYKRFIGPAIERELRAELTESASQQAIKVFGDNLYHLLMQAPLKGK VVLGFDPAYRTGCKLAVMDENGKFLDKLVIYPHKPASASKRAEAGKLFKDFLNKYQVEMIAIGNGTASRESEEFVAQKLK EIDRKIYYVIVNEAGASVYSASPEARKAFPELQVEERSAISIGRRLQDPLAELIKIDPQAVGVGQYQHDLPQKELTEQLD GVVETAVNQVGVNLNTASPELLTHISGLTKTTAQNIVNFRDENGRYDARNQLKKVPRLGPKAFEQAVGFLRIVDGKDVLD NTDVHPESYKAAKQLLKDLGIGMDSLGQDETIQKLKNANIQQLSNQLKIGSETLTDIIEALQKPGRDLRDAMPAPLLRAD VLTMEDLKPGMELQGTVRNVIDFGAFVDIGVKQDGLVHISKLTKQFVKKPSDIVSVGDIVTVWVESVDLNRHRIQLTMIQ DENKK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| NMB0075 | NP_273139.1 | transcriptional accessory protein Tex | Not tested | IHT-A | Protein | 1e-128 | 44 |
