Gene Information

Name : PECL_1579 (PECL_1579)
Accession : YP_005005473.1
Strain : Pediococcus claussenii ATCC BAA-344
Genome accession: NC_016605
Putative virulence/resistance : Resistance
Product : copper-translocating P-type ATPase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1517348 - 1519444 bp
Length : 2097 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGAAAAATAATGAGAAGAATAATCAAATGATGAAACATGATATGGGTCATATGAGTCACGACGACATGAATATGTCAGG
AATGGATATGAGTGATATGCATCATGGAGGTACTATGAGCCACATGAGCGGGATGGGACACATGGGCAATATCAAACAAC
GGTTGATTATTTCAACGATTATGGCGATTCCCGTCATCATGATTTCTCCACTAATGGGGATTGATATTTTTCATATCAGT
TTTCCTGGCTCTAATTGGCTTGTGTTGTTACTTGCAACGGGATTATATTTTTATGGTGGATATCCCTTTATTGGAGGGGC
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CGCGCTTGGATTAGCGATCCCACTGGTAGTTGCAAGATCGACTTCAATTGCGGCAGTTAATGGATTATTGATTCGCGATC
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GTGGCTGAATTAAAGTCAGTTAATGATGCAATAACGGATAAACAGGTAACAACCATCATGGCTGGTTTGGAGAAGAATTC
AAGTCATCCAATTGCCAAGAGTATTACTCAATACGCGGAAAAATTAAAAATCGAGATTCCGACAGCCGAAAAGGTAGAGA
CTATAAAAGGTGTTGGTCTAAGCGGCAAAGTTAACAATCAAAATTATTTGATTGTAACTAAGACCTACCTGGATAAGCAA
AAAATTGGTTACAATGTTGAGCAATACGAAGCATTAGCGAATCAAGGACTTTCAGTTAGTTATCTGATTGACGATAAAAA
TGTTTTAGGAATTGTCGGGACTGGTGATCAAATAAAATCAGAATCGAAGAGCTTTATCACCCGACTAAAATCAATGGGAA
TCACACCTGTAATGTTAACTGGTGATAATCATGCAACCGCTGAAAAAGTTGCACATGAGGTTGGAATTGAAGAAGTGCAG
GCCCATTTGTTACCAGAGAATAAGCAAGATGTTGTGAAAAAATATAAGTCACAGGGACATAGAGTTATGATGGTTGGTGA
CGGAGTTAATGATGCGCCTAGTTTAGTTTCGGCCGATATTGGTGTAGCTATTGGGGCCGGAACTGATGTTGCAATTGATG
CTGCTGATGTGGTTTTGGTCAATAGTAATCCGCAGGACATTATTCAATTCTTAGAGTTATCCAATGCTACTAAACGAAAA
ATGGTTCAAAATCTGTGGTGGGGAGCAGGCTATAATATTATAGCGATGCCCCTTGCAGCTGGTATTCTGGCGCCCTTTGG
ATTTATGCTAAATCCTGCTATGGGAGCATTAATTATGTCGTTTTCAACTATTATTGTAGCTTTGAACGCTATGACGTTGA
AGATTAAGAGAAATTAG

Protein sequence :
MKNNEKNNQMMKHDMGHMSHDDMNMSGMDMSDMHHGGTMSHMSGMGHMGNIKQRLIISTIMAIPVIMISPLMGIDIFHIS
FPGSNWLVLLLATGLYFYGGYPFIGGAGEELKERKPAMMTLITMAISVAYFYSLYAFYVNNFYNHGEMRVMDFFWELATL
IVIMLLGHWIEMNSVMAAGNAVDKLSALLPATAHLVGSDGQTSDVPTNQIKVGDQVLILAGESIPADGKIVSGQTFVNES
LVTGESKSVEKKISDQVIGGSINNDGAITVEVTGAGDSGYLSKVTAMVSEAQNSQSKAETLADKVAGWLFYSASAVGILA
FVIWLPISGVSEAFSVMVTVFVIACPHALGLAIPLVVARSTSIAAVNGLLIRDRNATEAATKIDMVLLDKTGTLTNGNFK
VAELKSVNDAITDKQVTTIMAGLEKNSSHPIAKSITQYAEKLKIEIPTAEKVETIKGVGLSGKVNNQNYLIVTKTYLDKQ
KIGYNVEQYEALANQGLSVSYLIDDKNVLGIVGTGDQIKSESKSFITRLKSMGITPVMLTGDNHATAEKVAHEVGIEEVQ
AHLLPENKQDVVKKYKSQGHRVMMVGDGVNDAPSLVSADIGVAIGAGTDVAIDAADVVLVNSNPQDIIQFLELSNATKRK
MVQNLWWGAGYNIIAMPLAAGILAPFGFMLNPAMGALIMSFSTIIVALNAMTLKIKRN

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SH0105 YP_252020.1 hypothetical protein Not tested SCCmec Protein 2e-126 55

• Homologs from CARD and BacMet (resistance genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
PECL_1579 YP_005005473.1 copper-translocating P-type ATPase BAC0079 Protein 4e-162 53
PECL_1579 YP_005005473.1 copper-translocating P-type ATPase BAC0383 Protein 3e-135 49
PECL_1579 YP_005005473.1 copper-translocating P-type ATPase BAC0629 Protein 9e-123 46