Name : PECL_1579 (PECL_1579) Accession : YP_005005473.1 Strain : Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 Genome accession: NC_016605 Putative virulence/resistance : Resistance Product : copper-translocating P-type ATPase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1517348 - 1519444 bp Length : 2097 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAAAAATAATGAGAAGAATAATCAAATGATGAAACATGATATGGGTCATATGAGTCACGACGACATGAATATGTCAGG AATGGATATGAGTGATATGCATCATGGAGGTACTATGAGCCACATGAGCGGGATGGGACACATGGGCAATATCAAACAAC GGTTGATTATTTCAACGATTATGGCGATTCCCGTCATCATGATTTCTCCACTAATGGGGATTGATATTTTTCATATCAGT TTTCCTGGCTCTAATTGGCTTGTGTTGTTACTTGCAACGGGATTATATTTTTATGGTGGATATCCCTTTATTGGAGGGGC CGGCGAAGAGCTAAAAGAACGTAAACCTGCTATGATGACTTTAATTACAATGGCAATTTCCGTTGCGTATTTTTATAGTT TATATGCTTTTTATGTTAATAATTTTTATAATCATGGTGAAATGCGTGTCATGGACTTTTTTTGGGAACTAGCAACGTTG ATTGTTATCATGCTGTTGGGTCACTGGATTGAAATGAATTCAGTTATGGCGGCCGGTAATGCTGTTGATAAACTATCCGC CCTGTTACCTGCAACGGCCCATTTAGTGGGGAGCGATGGACAGACAAGTGATGTGCCAACCAACCAAATTAAAGTCGGTG ATCAGGTACTGATATTAGCGGGAGAAAGTATACCAGCTGATGGTAAAATAGTTTCAGGTCAGACTTTTGTAAATGAATCA TTGGTAACAGGGGAGTCGAAGTCAGTTGAGAAGAAAATTAGCGACCAAGTGATTGGTGGTTCTATCAACAACGATGGTGC AATTACGGTTGAAGTGACGGGGGCCGGTGATAGTGGGTATTTATCTAAAGTGACTGCAATGGTTAGTGAAGCTCAAAATT CACAATCGAAGGCAGAAACCCTAGCTGACAAAGTGGCTGGCTGGTTGTTCTATTCAGCTTCAGCGGTTGGTATTTTGGCG TTTGTTATTTGGTTACCAATTAGTGGCGTTTCAGAGGCTTTTTCCGTTATGGTAACGGTTTTTGTAATTGCGTGTCCTCA CGCGCTTGGATTAGCGATCCCACTGGTAGTTGCAAGATCGACTTCAATTGCGGCAGTTAATGGATTATTGATTCGCGATC GAAATGCTACAGAAGCTGCAACTAAGATTGATATGGTACTTTTGGATAAAACTGGTACCCTCACAAATGGAAACTTCAAA GTGGCTGAATTAAAGTCAGTTAATGATGCAATAACGGATAAACAGGTAACAACCATCATGGCTGGTTTGGAGAAGAATTC AAGTCATCCAATTGCCAAGAGTATTACTCAATACGCGGAAAAATTAAAAATCGAGATTCCGACAGCCGAAAAGGTAGAGA CTATAAAAGGTGTTGGTCTAAGCGGCAAAGTTAACAATCAAAATTATTTGATTGTAACTAAGACCTACCTGGATAAGCAA AAAATTGGTTACAATGTTGAGCAATACGAAGCATTAGCGAATCAAGGACTTTCAGTTAGTTATCTGATTGACGATAAAAA TGTTTTAGGAATTGTCGGGACTGGTGATCAAATAAAATCAGAATCGAAGAGCTTTATCACCCGACTAAAATCAATGGGAA TCACACCTGTAATGTTAACTGGTGATAATCATGCAACCGCTGAAAAAGTTGCACATGAGGTTGGAATTGAAGAAGTGCAG GCCCATTTGTTACCAGAGAATAAGCAAGATGTTGTGAAAAAATATAAGTCACAGGGACATAGAGTTATGATGGTTGGTGA CGGAGTTAATGATGCGCCTAGTTTAGTTTCGGCCGATATTGGTGTAGCTATTGGGGCCGGAACTGATGTTGCAATTGATG CTGCTGATGTGGTTTTGGTCAATAGTAATCCGCAGGACATTATTCAATTCTTAGAGTTATCCAATGCTACTAAACGAAAA ATGGTTCAAAATCTGTGGTGGGGAGCAGGCTATAATATTATAGCGATGCCCCTTGCAGCTGGTATTCTGGCGCCCTTTGG ATTTATGCTAAATCCTGCTATGGGAGCATTAATTATGTCGTTTTCAACTATTATTGTAGCTTTGAACGCTATGACGTTGA AGATTAAGAGAAATTAG Protein sequence : MKNNEKNNQMMKHDMGHMSHDDMNMSGMDMSDMHHGGTMSHMSGMGHMGNIKQRLIISTIMAIPVIMISPLMGIDIFHIS FPGSNWLVLLLATGLYFYGGYPFIGGAGEELKERKPAMMTLITMAISVAYFYSLYAFYVNNFYNHGEMRVMDFFWELATL IVIMLLGHWIEMNSVMAAGNAVDKLSALLPATAHLVGSDGQTSDVPTNQIKVGDQVLILAGESIPADGKIVSGQTFVNES LVTGESKSVEKKISDQVIGGSINNDGAITVEVTGAGDSGYLSKVTAMVSEAQNSQSKAETLADKVAGWLFYSASAVGILA FVIWLPISGVSEAFSVMVTVFVIACPHALGLAIPLVVARSTSIAAVNGLLIRDRNATEAATKIDMVLLDKTGTLTNGNFK VAELKSVNDAITDKQVTTIMAGLEKNSSHPIAKSITQYAEKLKIEIPTAEKVETIKGVGLSGKVNNQNYLIVTKTYLDKQ KIGYNVEQYEALANQGLSVSYLIDDKNVLGIVGTGDQIKSESKSFITRLKSMGITPVMLTGDNHATAEKVAHEVGIEEVQ AHLLPENKQDVVKKYKSQGHRVMMVGDGVNDAPSLVSADIGVAIGAGTDVAIDAADVVLVNSNPQDIIQFLELSNATKRK MVQNLWWGAGYNIIAMPLAAGILAPFGFMLNPAMGALIMSFSTIIVALNAMTLKIKRN |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
SH0105 | YP_252020.1 | hypothetical protein | Not tested | SCCmec | Protein | 2e-126 | 55 |
Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
PECL_1579 | YP_005005473.1 | copper-translocating P-type ATPase | BAC0079 | Protein | 4e-162 | 53 |
PECL_1579 | YP_005005473.1 | copper-translocating P-type ATPase | BAC0383 | Protein | 3e-135 | 49 |
PECL_1579 | YP_005005473.1 | copper-translocating P-type ATPase | BAC0629 | Protein | 9e-123 | 46 |