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Name : polA (PECL_1142) Accession : YP_005005080.1 Strain : Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 Genome accession: NC_016605 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1133560 - 1136217 bp Length : 2658 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGACTGATAAACGATTACTTTTGATTGATGGGAACAGTATTGCGTTTCGTTCTTTTTTTGCATTACAAAATTCACTAAG TCGATTCACTAATGCTGATGGATTGCATACTAATGCTATTTATGGTTTTAATAAAATGCTAGATATTATCTTGGATAATG TAAACCCAACAGATGCTTTAGTTGCTTTTGATGCTGGAAAGACAACCTTTAGGACAAAAATGTATACCAATTACAAGGGG GGACGTGCCAAAACACCTTCGGAATTAACAGAGCAAATGCCATATTTACGTGATTTGCTAACAGGATACGGAATAAAGTC GTACGAATTGGCTGATTATGAAGCTGATGATATTATTGGAACTTTGTCCTTAGAAGCAGAAAAGCTTGGATATCGTGTCA CAATAGTGACGGGTGACCGTGATTTAACTCAGTTAGTCAGTGATAAGACCACAGTGGCTGTTACCGTTAAGGGCGTTACC GAGGTTGAAGATTATACTCCAGAGCATTTGAAAGAAAAGTTAGGTGTGACACCTACGCAAGTGATTGATTTAAAGGGGTT AATGGGAGACAGCTCAGATAATTATCCTGGCGTAACTAAAGTTGGTGAAAAGACCGCCTTAAAGCTGATTGACCAGTTTG GAAGTGTTGAAAATTTATACGACCACATTGATGATCTAAAGCAAAGCAAGATGAAAGAGCACCTTATCGAAGATGAAGAT AATGCATTTTTATCAAAAAAATTGGCAACAATTGATCGTGATTCCCCTCTAAAAATTGGATTGGATCAACTTGAATATAA AGGAATTAACGAAGAATACCTAATTGATTTTTATCAAAAAATGGGATTTAAATCCTATTTAAAAAAATTTCAAAAATCTG GTGGGCTGAAAGAAGTAGAGCAAACACAATTTCAAGAGTTAACAAAAGCGAATTTAGATAAGGCAATGGAGAGCTTAGGT AATGAAGTATCTTTGTATTTAGAAATGCCTGAAAAAAATTATCATTTATCAAGTTTTGCGGGTTTTGTAATAGGCAACGA TGAAAAGTGGTTTGTTTCCCGGAATGTCGAGTTACTCAAACTTCCAACCATTAAAGATTTGATTGAAAATATTGACGTAA AATTAAATGTTTTTGATAGCAAGCGAACCTATGTGGGCTTGAATAGACTAGAAATTAATGCTCAATGTTTTAATTACGAC GTTTTATTACAATCATATTTACTTGATACTAATGAGAATTCTAATGATTTAGGTTTATTAGCTCAACAACATGCTTATTA TAATGTGGAATCCGATGCTGACGTGTACGGCACTGGTGCAAAGTTGTCTATTCCAGATGATGATCAAACCTTTTTTCAGC ATCTGGCGAATAAGGGTAAAGCAATAGAGGTTTTAGGAAAAGCCTTGGATGGCGAGTTGAAGCAAAATGAGCAGGATAAA CTTTATTGGGAAATCGAATTGCCCCTTGCAATAGTTTTGGCAAAAATGGAAATCAGCGGAATTAGAGTAGATTCCAATCG GTTAATCCAAATGCAAAGTGAATTTGCTGAACGATTAAGTGAAATAGAAGGTGAAATTTACCGTTTGGCGGGTGAAGAGT TCAATATAAACTCTCCTAAACAATTAGGACGGATTTTATTCGAAAAAATGCGTTTGCCAATTATCAAGAAAACCAAGACA GGATACTCAACAGCGGTTGATGTTCTTGAAAAACTACGTGGGGAATCTGATATTGTTGATGATATTTTAAACTATCGAAC TATTTCAAAGATCCAATCTACCTATGTTGAAGGCCTTTTAAAAGTTGTACATTCGAAAGATCAAAAAATTCACACAACAT ACATTCAAACTTTAACCCAAACGGGGCGATTATCATCAATTGAACCTAATTTACAGAATATTCCCGTTCGAATTGATGAA GGAAAGAAGATTCGACAAGCTTTCGTACCCTCAAAGGAAGGATGGCACATTTTATCATCCGATTATTCTCAAATTGAGTT GCGTGTGCTGGCACACCTAACCGGTGATAAGAACATGCAGGAAGCCTTTATTGAGAATCAAGACATTCATGCAAGTACTG CCGTTAGAATTTTTGGTTTGAAAGATGCTTCCGAAGTTACACCTAATATTAGAAGGCAAGCCAAAGCTGTAAATTTTGGG ATTGTCTATGGTATTAGTGATTATGGTCTTTCTCAGAATATTGGAATTTCACGATCCGATGCTAAAAAATTTATTGAAAC TTATTTCCAGGAATTTCCTGGGGTAAAAAATTATGTGGATAATATTGTTAAAGTTGCCAAGGAACAAGGGTATGTAGAGA CAATTTCACACCGTAGAAGATATTTACCGGATATAAACTCTAGTAATTTTAGTCAAAGGTCTTTTGCGGAGAGAACTGCA ATGAATACACCAATTCAGGGTAGTGCAGCGGATATAATCAAGATTGCGATGATAAAAATGCAACAAGAACTTGAAAGTAG AAACTTAAAAACAAAGATGTTGCTACAAGTTCATGATGAATTGATTTTCGAGGTGCCTGATGAAGAAATGAATGAAATTA AGAAACTTGTACCTAGTGTGATGGATTCAGCAATGAAATTAAAGGTTCCGCTTAAAGTTGAAACATCGTGGGGAAATAAT TGGTATGAAGCCAAATAG Protein sequence : MTDKRLLLIDGNSIAFRSFFALQNSLSRFTNADGLHTNAIYGFNKMLDIILDNVNPTDALVAFDAGKTTFRTKMYTNYKG GRAKTPSELTEQMPYLRDLLTGYGIKSYELADYEADDIIGTLSLEAEKLGYRVTIVTGDRDLTQLVSDKTTVAVTVKGVT EVEDYTPEHLKEKLGVTPTQVIDLKGLMGDSSDNYPGVTKVGEKTALKLIDQFGSVENLYDHIDDLKQSKMKEHLIEDED NAFLSKKLATIDRDSPLKIGLDQLEYKGINEEYLIDFYQKMGFKSYLKKFQKSGGLKEVEQTQFQELTKANLDKAMESLG NEVSLYLEMPEKNYHLSSFAGFVIGNDEKWFVSRNVELLKLPTIKDLIENIDVKLNVFDSKRTYVGLNRLEINAQCFNYD VLLQSYLLDTNENSNDLGLLAQQHAYYNVESDADVYGTGAKLSIPDDDQTFFQHLANKGKAIEVLGKALDGELKQNEQDK LYWEIELPLAIVLAKMEISGIRVDSNRLIQMQSEFAERLSEIEGEIYRLAGEEFNINSPKQLGRILFEKMRLPIIKKTKT GYSTAVDVLEKLRGESDIVDDILNYRTISKIQSTYVEGLLKVVHSKDQKIHTTYIQTLTQTGRLSSIEPNLQNIPVRIDE GKKIRQAFVPSKEGWHILSSDYSQIELRVLAHLTGDKNMQEAFIENQDIHASTAVRIFGLKDASEVTPNIRRQAKAVNFG IVYGISDYGLSQNIGISRSDAKKFIETYFQEFPGVKNYVDNIVKVAKEQGYVETISHRRRYLPDINSSNFSQRSFAERTA MNTPIQGSAADIIKIAMIKMQQELESRNLKTKMLLQVHDELIFEVPDEEMNEIKKLVPSVMDSAMKLKVPLKVETSWGNN WYEAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 54 |
