Name : hsdR (BDGL_000180) Accession : YP_004994448.1 Strain : Acinetobacter calcoaceticus PHEA-2 Genome accession: NC_016603 Putative virulence/resistance : Unknown Product : HsdR protein chain Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 190615 - 193521 bp Length : 2907 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGTCTACACAAAAAGAGCTGGAATTAGAAGCTTTACTCATACAACAACTAGAAACTTTAGGTTATGAACGTGTCCAGCT TCGTAATGAAACAACGCTATTAGAAAATCTTAAAAGAAAAATTCAGCAGCTTAATAAAATTGGAAACCCATTTTCAGATT CAGAATGGAAGCAAATCTGGCATTACTTGAGTAATGAAACCACAGTATTTAAAAAAGCAGAGCTGTTACGCAATCGCTGC CCCGTCAAATTCGACGATGGATCTGTAAGGCATGTACATTTTATTAGTGAAGATGTTCAAGAAAATAGCTTTCAAGTATC TAACCAAGTTGTAGCGGATCACCGAGATTTAAACGGACGTACTAGCCGTTTTGACGTTACGTTGTTAATTAATGGCTTTC CATTAGTACAAATTGAGATTAAAAAATCTGGTGTAGAACTTAAAAAAGCCTTTGAGCAAACATTAGAATATGCCAAAACA GCCTATAAATCAGGCGAAGGTTTATTTGGCTTTATTCAATTTTTTGTTATTAGCAATGGTGTAAATTGCTTGTACTATGC AAATGGTACACAAAGTATTGAGTTTGCTTTTGCATGGACAGATGAAAACAATAAAAAAGTTAATGACTTAGGTAAATTTA CTAATTCTTTTTTAGACCCGAAACATCTGACCAAAATGTTGATGCAATATATTGTTATGCATCAGTCAACTCAAAGTTTA ATGATTTTACGACCATATCAGATTTATGCCGTAGAAAAGATTATTGAACATGTTAAAACTTCACCAGACAATGCTTATAT TTGGCACACCACAGGTTCAGGCAAAACACTGACTTCCTTTAAAGCCAGTCAGTTACTCATTAAGCAGCCAGAAATACAGC GAGTTATCTTTGTAGTCGACCGTAAAGATTTAGACGGTCAAACCGCAGAAGAGTTTAATAAGTTTCGTGAAAACAGTGTA GACAGTACAACCAATACAGCAAACTTAGTTAAACAACTGCGTTCTTTAGATAATCGTTTAGTCGTAACAACCATTCAGAA ATTGAACAATGCAATTTCAAATGACCGTTATGAAGATGAAATGGCTTTTTTAAAAGATCAAAAAGTTATTTTTATTTTTG ATGAATGTCATCGTAGTCAGTTTGGGGAAACGCATCAAAAAATTAAGAAATTCTTTAAAAATGCGCAAATGTTTGGTTTT ACAGGAACACCAATTTTTGAAAAAAATGGTCACACTGTAGGTGGGGAAAAATTTACTACTAAATATTTATTTCCAAAGTT GCTACATAAATATGTGATTGTAGATGCCATTAATGATGGCAATGTCCTACCGTTTAACATCGATTATTTAGGACGTTTCG TACATAAAAATCCAGAAGCACAAGAAGAAAAAATAGAATCAATTGATAAAAGAGAACTTTTTGAAAATGAACGCCGAATT GAAAAAATTGTACGTGAAGTAATTGCAACACATGCTAGCAAAACGAATCAGCGTGAATTTAATGCAATGTTTTGTGTATC TTCAGTTCCAGCACTCATTCAATATTACGATAAATTTGAAAAAGTGCAGGCTGAGCTACTAGAAAAAGCGCAACAAAATA ATGAGCTTTATCAACCTCTCAATATTGCAACCATATTTTCTTATGGACAATCTTCAGCACAGCAACCTAGTGAAGCTGCT GATGATTTTATTGCGGAGGAAGAAGTTGATGCGCCTAAACAAGTTGATGAGTTTGCAGAGAAGAAATTAACCCAATATAT CGCAAATTATAATCAAACTTTTAATACTAACTATAGTCTTGGTTCAGGATTTTACGATTATTATCAAAATATTAGTAGTC GAGTTAAGGCCTACGGTACAGATAAAAATAAAGGTAAAGAAATTGATATCTTACTGGTCGTAAACATGTTTTTGACGGGG TTTGATTCAAAACGACTTAATACTCTTTATGTTGATAAAAATTTAAAACATCATGGTTTAATTCAAGCTTTTTCACGTAC CAATCGAGTCTATGGTCAGACAAAGCCTTTTGGAAATATCGTGTGCTTCCGAAATCTTAAACAAGCGACTGATGATGCAT TGATTATGTTTTCTGATAAAGAAGCAAAGAATGTTGTCGTCGTTAGCCCTTATGAGCAAGTAATACAGCTCTATGAATCA GCAGTAAATAATTTATTAAACATTACACCGACATGCCAGTCTGTTGATGACTTATATGGCGAAAGTGAAAAAGAGTCGTT TGTGTATGCCTTCCGTGATGTAATGAGGCTAAATAATCGTTTAAAAATGTACTCAGAGTATGATCAAGATGCTACTTCTT TTACAAAACAAGATTTTGAAAATTATTCATCAAAATATAAAGATTTAGCTTTTAGCTATCAAATGAGGCCGAACGTAGCT GAAAAAACTTCAGTACTAGATGAGGTCGATTTCCAGCTCGATTTATTGTTTAGTGATCGAGTGAATGTAGATTACATTTT AAAATTACTTAATCTTATTATTAATTCTAAAAATCAGGAACAGAAAGACAGTAGAGTCAAACAGCTTAAGGATTTATTGA ATAATAATATTTCTTTATACGATAAGCGTGATTTGATTGAAAAATTTATCAATGAGCAAATTCCTAAAATGGTAACAGGG GAAACTGTACAAGAAGCCTTTGCCGCATTTTGGGATGCGGAGAAACATCGTGCCTATGATATTTTCTGTAATGAAGAGCA GCTGAAAAAAGATGAGTTCAATAGAGTTGCAGATAATTTTGAATTTACAGAACGGTTGCCACTCATTCATGAAATTAAAG AACTTCCGATAAAAAAACCGCCATTAGGAAGAAAGCGGGCGATATATTATGCAGACTTACATACCAAAACGAATGTGTTG TTAAGTCGCTTTGATTTGAAAATATAA Protein sequence : MSTQKELELEALLIQQLETLGYERVQLRNETTLLENLKRKIQQLNKIGNPFSDSEWKQIWHYLSNETTVFKKAELLRNRC PVKFDDGSVRHVHFISEDVQENSFQVSNQVVADHRDLNGRTSRFDVTLLINGFPLVQIEIKKSGVELKKAFEQTLEYAKT AYKSGEGLFGFIQFFVISNGVNCLYYANGTQSIEFAFAWTDENNKKVNDLGKFTNSFLDPKHLTKMLMQYIVMHQSTQSL MILRPYQIYAVEKIIEHVKTSPDNAYIWHTTGSGKTLTSFKASQLLIKQPEIQRVIFVVDRKDLDGQTAEEFNKFRENSV DSTTNTANLVKQLRSLDNRLVVTTIQKLNNAISNDRYEDEMAFLKDQKVIFIFDECHRSQFGETHQKIKKFFKNAQMFGF TGTPIFEKNGHTVGGEKFTTKYLFPKLLHKYVIVDAINDGNVLPFNIDYLGRFVHKNPEAQEEKIESIDKRELFENERRI EKIVREVIATHASKTNQREFNAMFCVSSVPALIQYYDKFEKVQAELLEKAQQNNELYQPLNIATIFSYGQSSAQQPSEAA DDFIAEEEVDAPKQVDEFAEKKLTQYIANYNQTFNTNYSLGSGFYDYYQNISSRVKAYGTDKNKGKEIDILLVVNMFLTG FDSKRLNTLYVDKNLKHHGLIQAFSRTNRVYGQTKPFGNIVCFRNLKQATDDALIMFSDKEAKNVVVVSPYEQVIQLYES AVNNLLNITPTCQSVDDLYGESEKESFVYAFRDVMRLNNRLKMYSEYDQDATSFTKQDFENYSSKYKDLAFSYQMRPNVA EKTSVLDEVDFQLDLLFSDRVNVDYILKLLNLIINSKNQEQKDSRVKQLKDLLNNNISLYDKRDLIEKFINEQIPKMVTG ETVQEAFAAFWDAEKHRAYDIFCNEEQLKKDEFNRVADNFEFTERLPLIHEIKELPIKKPPLGRKRAIYYADLHTKTNVL LSRFDLKI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
SSP0054 | YP_300144.1 | type I site-specific restriction-modification system restriction subunit | Not tested | SCC15305cap | Protein | 4e-158 | 41 |