Gene Information

Name : shlB (BDGL_001208)
Accession : YP_004995476.1
Strain : Acinetobacter calcoaceticus PHEA-2
Genome accession: NC_016603
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : putative hemolysin activator
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1292663 - 1294420 bp
Length : 1758 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGGTGAACTATAACAAATTTAATAAAAGTGTCTTATTTATCTGTTTATCGATTATGGGAGGATTAAGTTACGCTGCAGA
TCCTGATGACCCGATTCGACAGCGAATTCAGGCTGATCAGTCTACTCGTCAACAACAACGTGATACAGCGCTAGAAAAAC
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AATTATTTATCGCGATGCACACCGTAAAACTGCCGTAGGTTTTGGTGGCTGGTATCGTGAATCACAAAACTATATCAATG
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GGCTTATACACATGTAGGGATTTTACAGGCCAATGCCAGTTTACAAGTTCCTTTTAAAGTAGGGCAACAGAACCTGCAAT
ATCTTGCAGAATGGCGTACCCAGCACAGTAATAAACCTTTAACACCGCAAGACCGCTTCTCGATTGGAAACCGTTATACC
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Protein sequence :
MVNYNKFNKSVLFICLSIMGGLSYAADPDDPIRQRIQADQSTRQQQRDTALEKQIQPNVNVNLGQEQNKNLAQQLQYLRS
NSETPCFEIKKILLEGDLAHQFISDFNVITTGKNNIIGRCLGVNGLNQALDLVQNKIIADGYVTTRVLLPQQNIASGTVR
VRVIPGRVDQIKFAEGTSKRAHLWNALPMKSGELLNIRDMEQGLENFKRVPTVEADFKIQPAEQKNEPGYSDVILAWQQA
KPYRLHVGIDDSGSDATGKYQGTATLSLDHVLTLNDLFYVSYNHDLGGSGSGKHGTDGFYASYTIPFDYWLFSTSYSRSN
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TLSGNVTYKRGTGWLNAMRAPEEDFGEAYTHVGILQANASLQVPFKVGQQNLQYLAEWRTQHSNKPLTPQDRFSIGNRYT
VRGFDGEQTLLADNGFLVRNELSGSIMNKPHSWYAGIDYGEVGGKTAHYPNPLPGTSLLGAVVGLRGQIVPLHLNYDAFV
GAPLKKPDHFETDDYTTGFSVNWTY

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
S1 AAQ19124.1 putative hemolysin activator HlyB Not tested PAI I CL3 Protein 2e-93 44