Name : shlB (BDGL_001208) Accession : YP_004995476.1 Strain : Acinetobacter calcoaceticus PHEA-2 Genome accession: NC_016603 Putative virulence/resistance : Unknown Product : putative hemolysin activator Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1292663 - 1294420 bp Length : 1758 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGTGAACTATAACAAATTTAATAAAAGTGTCTTATTTATCTGTTTATCGATTATGGGAGGATTAAGTTACGCTGCAGA TCCTGATGACCCGATTCGACAGCGAATTCAGGCTGATCAGTCTACTCGTCAACAACAACGTGATACAGCGCTAGAAAAAC AAATCCAGCCCAATGTGAATGTCAATCTGGGGCAAGAACAAAATAAAAATTTAGCTCAACAATTACAATATTTACGCTCT AATAGTGAAACTCCTTGTTTTGAAATTAAAAAAATACTTTTAGAAGGTGATTTAGCTCATCAATTCATATCAGATTTTAA TGTGATTACGACTGGCAAGAATAATATTATTGGACGTTGCTTGGGTGTAAATGGTCTCAATCAGGCACTTGATCTTGTTC AAAACAAAATTATTGCAGATGGTTATGTCACAACACGAGTTTTGCTTCCTCAGCAAAATATCGCATCTGGCACTGTTCGA GTTCGTGTTATTCCTGGCCGAGTTGATCAGATTAAGTTTGCTGAGGGTACTTCTAAACGTGCTCATTTATGGAACGCTTT ACCGATGAAATCGGGTGAGCTTTTAAATATTCGTGATATGGAGCAAGGCTTAGAAAACTTTAAAAGAGTACCTACGGTTG AGGCTGATTTTAAAATTCAGCCAGCAGAACAAAAAAATGAACCGGGCTATAGTGATGTGATTCTTGCATGGCAACAGGCT AAACCTTATCGCTTACATGTGGGAATTGATGATTCAGGTTCTGATGCTACTGGAAAATACCAAGGTACAGCGACCTTGTC ACTTGATCATGTGTTGACTTTAAATGATTTGTTTTATGTTAGTTATAATCATGACTTAGGGGGTAGTGGTTCTGGTAAGC ATGGTACAGATGGCTTTTATGCAAGTTATACCATTCCATTTGATTATTGGTTATTTTCAACCAGTTATAGCCGTTCTAAC TATTTACAAACAGTCGCCGGAAGCAGTGAGACCTATCAATATAGCGGTAAAAGCGAACTTATTAATGCAGATTTGTCCCG AATTATTTATCGCGATGCACACCGTAAAACTGCCGTAGGTTTTGGTGGCTGGTATCGTGAATCACAAAACTATATCAATG ATGTTGAAGTAGAAGTACAACGCCGAAAAACGGCGGGATGGAAAGCAAGTCTCGATCATACCGAATATTTTTCTAATGCC ACTTTAAGCGGTAATGTGACTTATAAGCGTGGTACAGGCTGGCTTAATGCAATGAGAGCACCAGAAGAAGATTTTGGTGA GGCTTATACACATGTAGGGATTTTACAGGCCAATGCCAGTTTACAAGTTCCTTTTAAAGTAGGGCAACAGAACCTGCAAT ATCTTGCAGAATGGCGTACCCAGCACAGTAATAAACCTTTAACACCGCAAGACCGCTTCTCGATTGGAAACCGTTATACC GTAAGAGGTTTTGACGGTGAGCAAACGTTGTTGGCAGATAATGGCTTTTTAGTTCGCAATGAACTGAGTGGCTCAATCAT GAATAAACCACATTCATGGTATGCCGGTATTGATTATGGAGAGGTGGGTGGAAAAACCGCGCATTATCCAAACCCTTTAC CGGGTACCAGTTTATTAGGTGCAGTTGTGGGATTGCGTGGACAAATTGTCCCTCTGCATTTGAATTATGACGCTTTTGTC GGAGCACCGTTGAAAAAGCCAGATCACTTTGAAACGGATGATTACACGACTGGATTTAGCGTGAACTGGACCTATTAA Protein sequence : MVNYNKFNKSVLFICLSIMGGLSYAADPDDPIRQRIQADQSTRQQQRDTALEKQIQPNVNVNLGQEQNKNLAQQLQYLRS NSETPCFEIKKILLEGDLAHQFISDFNVITTGKNNIIGRCLGVNGLNQALDLVQNKIIADGYVTTRVLLPQQNIASGTVR VRVIPGRVDQIKFAEGTSKRAHLWNALPMKSGELLNIRDMEQGLENFKRVPTVEADFKIQPAEQKNEPGYSDVILAWQQA KPYRLHVGIDDSGSDATGKYQGTATLSLDHVLTLNDLFYVSYNHDLGGSGSGKHGTDGFYASYTIPFDYWLFSTSYSRSN YLQTVAGSSETYQYSGKSELINADLSRIIYRDAHRKTAVGFGGWYRESQNYINDVEVEVQRRKTAGWKASLDHTEYFSNA TLSGNVTYKRGTGWLNAMRAPEEDFGEAYTHVGILQANASLQVPFKVGQQNLQYLAEWRTQHSNKPLTPQDRFSIGNRYT VRGFDGEQTLLADNGFLVRNELSGSIMNKPHSWYAGIDYGEVGGKTAHYPNPLPGTSLLGAVVGLRGQIVPLHLNYDAFV GAPLKKPDHFETDDYTTGFSVNWTY |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
S1 | AAQ19124.1 | putative hemolysin activator HlyB | Not tested | PAI I CL3 | Protein | 2e-93 | 44 |