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Name : polA (TEH_15050) Accession : YP_004886996.1 Strain : Tetragenococcus halophilus NBRC 12172 Genome accession: NC_016052 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : 2.7.7.7 Position : 1518970 - 1521615 bp Length : 2646 bp Strand : - Note : protein synonym:Pol I DNA sequence : ATGGCAAAAAATAAATTACTACTGGTAGATGGTAATAGTGTTGCATTTCGCGCATTCTATGCCTTACACAGTTCATTAGA ACGCTTTAAAAATCCAAGCGGTCTTCACACCAATGCAATTTATGCTTTTAATTTAATGTTTGAAAATGTAATGGAAAAAG AAAAGCCTAGTCATGTACTAGTAGCTTTTGATGCAGGCAAAACTACTTTTCGTAATGAAATGTATGAAGATTATAAAGGT GGACGGGCTAAAACACCGGGAGAATTAAATGAACAGCTTCCTTATATAAGAGAGTTGATTAATGGCCTTGGAATCTCTTA TTATGAGTTAAAAAACTATGAAGCAGACGATATTATCGGTACTTTAGCCGAGCAAGTAGATAAAGATAAATTTGATGTTA CTATTCTCACAGGAGATCGGGATTTAACCCAGTTAGCAACTGATGATGTAAAAGTCGCTATTACCAAAAAAGGTGTCAGT GATACAGAAGATTATACGCCAGAGCATATTGCTGAAAAATATGATGGTTTAAAACCTAAACAAATTATCGATATGAAAGG ACTAGCGGGAGATTCGTCTGATAATATTCCAGGCGTAACAAAAATTGGGGATAAAACTGCAATCAAATTATTAAATCAAT ATGATTCTGTTGAAGGTGTTTACGAACATATTGATGAGATGAAACAAAGCAAGATGAAAGAAAACCTAATTAATGATAAA GAAACTGCCTTACTTTCGAAAAAATTAGCCACAATAAATATATCTGCTCCTATTGATGTTTCTATTGATTCTTTAAAATA TGAAGGTAGCGATTTGGATAAACTTGTTCCTTTTTATAAAGAAATGAATTTCCGAACATTTTTGGATAATTTGGATGTCG GAGAAGAAGAAAATAAGATGGAGGACATTTTATTTGAAGTGGTTGATGAACCGACAGAAGAAATGTTTACCGATGAAATG GCTTTATATGTCGAAATGTTGGGTGAAAATTATCATGTAGAAGATATTGTAGGCGTTGTATGGGGTAACGATAAGAAAAT TTATGTCACAAAAAGCGATAAGATTTTTGAAAATAAGGCTTTTAAAAACTGGTTAACCGATAAAAGTAGAGGAAAAAGAG TCTATAACGCAAAAAGCACCCAAGTAGCGTTGAATCGTTACATTGCTTTGCCTGAAGGTTTTTCTTTTGATGTTTTGGTT GCTGCTTATTTATTGGACAATACAGATAATACGGATGATATTGCAGGGATTTGTGCACATTATGATTATCAAGATATCCA ATCAGATGTGGCTGTTTATGGTAAGGGTGCAAAAAAAGGTCTACCCGAAGATGATGAGACGTTTTTTGCCCATTTAGCAA GAAAAATCAAGGCTATTCAATGGCTTACGCCTAAATTAGAAGGTGAGCTTAAAGATAAAAATCAACTCGATCTATATAAA AATTTGGAAGCTCCTATTTCTTCCATTTTAGCTGAAATGGAAATAACAGGTATTACAGTAGATGCCCAACGATTGAATCA AATGAAGGATGAATTTGCTCAAAGCTTACAAAAAATTGAGGAAAAAATCTTTGAGCAAGCTGGAGAAAAATTCAATATCA ATTCGCCTAAACAACTAGGGCATATTTTGTTTGAAAAGATGAACTTGCCTGTCATTAAAAAGACCAAAACAGGTTACTCG ACGGCTGTTGACGTTTTAGAGCAGTTAAAAGATAAATCACCGATTGTTGAAAATATCTTAAAATACCGGCAGATTGCTAA GATCCAGTCAACTTATGTTGAAGGACTTTTAAAAGTCATTTTACAAGATGGTAAAGTTCACACGCGTTATCTGCAAACTT TAACGCAAACAGGGCGTCTAAGTTCGGTCGATCCAAACTTACAAAATATACCTATTCGTCTAGAAGAAGGACGAAAAATT CGACAAGCTTTTGTTCCGCAAAAGCACGACTGGGTCATTTATTCTTCTGACTATTCACAAATTGAATTGCGCGTGCTTGC TCATGTTTCAAAAGATGAGCATTTACAAGAGGCATTTAATGAAAACCAAGATATCCACGCCAGTACTGCTATGCGTGTGT TTGATATTGAAAAACCTGAAGATGTAACAGCTAATATCAGACGTCAAGCCAAAGCAGTAAACTTTGGGATTGTTTATGGT ATATCAGATTATGGTTTATCACAAAACCTAGGTATTTCTCGTAAAGAAGCCAAAAATTATATTGATACTTATTTTGAACG CTACCCTGGCGTGAAAAAATATATGAACGATTCTGTAGAACAAGCAAAGGAAAAAGGTTTCGCTGAGACGCTTTATCATC GTCGTCGTTATCTTGAGGATATTAATTCTAGAAACTTTAACTTAAGATCTTTTGCCGAAAGAACAGCGATTAATTCACCG ATTCAAGGTAGCGCTGCTGATATCTTAAAAATTGCTATGATCGAATTAGATAAACAATTAAAAGAAAAACAACTAGAAAC GAACATGCTTTTACAAGTACATGATGAGTTAGTTTTTGAAGTTCCAGAAAGTGAACTTAAAACACTAGATCAATTGGTAA AAGAAGTTATGGAAAATGCTGTTCATTTAGATGTTCCGTTGATTACCGAAAGTAGTTGGGGGAAAACTTGGTATGATGCA AAATAA Protein sequence : MAKNKLLLVDGNSVAFRAFYALHSSLERFKNPSGLHTNAIYAFNLMFENVMEKEKPSHVLVAFDAGKTTFRNEMYEDYKG GRAKTPGELNEQLPYIRELINGLGISYYELKNYEADDIIGTLAEQVDKDKFDVTILTGDRDLTQLATDDVKVAITKKGVS DTEDYTPEHIAEKYDGLKPKQIIDMKGLAGDSSDNIPGVTKIGDKTAIKLLNQYDSVEGVYEHIDEMKQSKMKENLINDK ETALLSKKLATINISAPIDVSIDSLKYEGSDLDKLVPFYKEMNFRTFLDNLDVGEEENKMEDILFEVVDEPTEEMFTDEM ALYVEMLGENYHVEDIVGVVWGNDKKIYVTKSDKIFENKAFKNWLTDKSRGKRVYNAKSTQVALNRYIALPEGFSFDVLV AAYLLDNTDNTDDIAGICAHYDYQDIQSDVAVYGKGAKKGLPEDDETFFAHLARKIKAIQWLTPKLEGELKDKNQLDLYK NLEAPISSILAEMEITGITVDAQRLNQMKDEFAQSLQKIEEKIFEQAGEKFNINSPKQLGHILFEKMNLPVIKKTKTGYS TAVDVLEQLKDKSPIVENILKYRQIAKIQSTYVEGLLKVILQDGKVHTRYLQTLTQTGRLSSVDPNLQNIPIRLEEGRKI RQAFVPQKHDWVIYSSDYSQIELRVLAHVSKDEHLQEAFNENQDIHASTAMRVFDIEKPEDVTANIRRQAKAVNFGIVYG ISDYGLSQNLGISRKEAKNYIDTYFERYPGVKKYMNDSVEQAKEKGFAETLYHRRRYLEDINSRNFNLRSFAERTAINSP IQGSAADILKIAMIELDKQLKEKQLETNMLLQVHDELVFEVPESELKTLDQLVKEVMENAVHLDVPLITESSWGKTWYDA K |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 57 |
