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Name : gabD (RJP_0484) Accession : YP_004884837.1 Strain : Rickettsia japonica YH Genome accession: NC_016050 Putative virulence/resistance : Unknown Product : succinate semialdehyde dehydrogenase Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1012 EC number : - Position : 613677 - 615104 bp Length : 1428 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAGCTTACTTAAAAACATTACGGGAAAGAATTATATAAACGGTGAATTTATAGAGTTCGGGAAGCAAATATCCGTTAT TAATCCTGCGACCTTAAAAGAAATTGCTACAGTTCCGAATTTAGGATTATCTGAGGTTAATTCAGCGATTAATAATACGG TGACTAGTTTTTCTTTATGGTCACAAAGCTCATTTGAAGCGAGAATAGCGATTCTTAGAAGATGGTATAATTTAGTAATC GAAAATATTGAGGAGTTAAGTCATATATTAACCCTAGAGCAGGGTAAAATACTTGCTGAATCAAAAAAAGAAATTTTATA TGGAGCCTCTTTTATTGATTGGTATACATATGCTATACATAATATTCATTCGACTATTAAACCCGGTAATAGTAAAACTC ATAAAATTGTTACGCAATATGAGCCTGTAGGACCGTCTGCTGCTATAACTCCTTGGAATTTTCCAAATGCAATGATTACT CGCAAGGTAGTACCTGCAATAGCTGCGGGTTGCAGCGTTATATTAAAACCGTCAAGTCTTACGCCTCTATCAGCTTTAGT ACTTGCGAAATTTGCAAACGATGCCGGTTTGCCTGCCGGAGTATTTAATATAATTACAGGTAGTTCAGATATTATAGGTA AGGCTTTTTGTGAAGATTTTAGGCTTCGGAAATTATCATTTACCGGCGCTACAAATGTCGGTAAAATTCTATATCAAAAT GCCGCAAATACTCTAAAACGTTTATCTTTGGAACTTGGCGGCAATGCTCCTTTCATTATAACGGCAGATAATAATTTAGA GAAAGTAGTAAGTGATTTAGTAATCGCTAAAACTAGAAATAGTGGACAGTCTTGTATTTCACCTAACAGAACATTTATAG AAGAATCTATATATGAAAAATTTATAGAAATTCTAAAGGCTAAATTTACTAAGCTTAAAGCCGGTGACGGATTTGATAAG GAATCGGATGTAGGTCCGTTAATTAATTCTGCTGCCATAGAAAAAATACAAAAGTTACTCGCTGATGCACAAAGTAAAGG AGCTAAATTAATTTGCGGCGGTAAAGCTGTTGATAATTTTATTGAGCCTACTATTATTATTGACTGTTTGGATAATATGG ATATCTTTAGAATAGAAATATTCGGTCCGGTAGTTGCTTGTTATAAGTTTAAAGATTTAGATGAAGTAATAGAACATGCA AATAATACCGAATACGGCTTGCAAGGATATGTATATTCAAATAATATATCCGTGGCACAAATGATAGCATCTAAGCTTGA TTTTGGTATGGTATCGATTAACGACCCGTTACCTGCAAATGCAAAAGCACCTTTTGCAGGACGTAAAGCTTCAGGTTTTG GAGTTGAAGGCTCATTTGAAGGGATATTTGAATATCTAAATACGAAATATATAAATTTACAGAATTAA Protein sequence : MSLLKNITGKNYINGEFIEFGKQISVINPATLKEIATVPNLGLSEVNSAINNTVTSFSLWSQSSFEARIAILRRWYNLVI ENIEELSHILTLEQGKILAESKKEILYGASFIDWYTYAIHNIHSTIKPGNSKTHKIVTQYEPVGPSAAITPWNFPNAMIT RKVVPAIAAGCSVILKPSSLTPLSALVLAKFANDAGLPAGVFNIITGSSDIIGKAFCEDFRLRKLSFTGATNVGKILYQN AANTLKRLSLELGGNAPFIITADNNLEKVVSDLVIAKTRNSGQSCISPNRTFIEESIYEKFIEILKAKFTKLKAGDGFDK ESDVGPLINSAAIEKIQKLLADAQSKGAKLICGGKAVDNFIEPTIIIDCLDNMDIFRIEIFGPVVACYKFKDLDEVIEHA NNTEYGLQGYVYSNNISVAQMIASKLDFGMVSINDPLPANAKAPFAGRKASGFGVEGSFEGIFEYLNTKYINLQN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf17 | AAO17183.1 | Orf17 | Not tested | tcd island | Protein | 2e-94 | 47 |
