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Name : coxA (RJP_0436) Accession : YP_004884789.1 Strain : Rickettsia japonica YH Genome accession: NC_016050 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase polypeptide I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : - Position : 553101 - 554699 bp Length : 1599 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGATATAACTACTACCGAAATTTATCACGATGACCACCACACCCCACACGGTTGGAGGCGATGGCTTTTTTCTACCAA TCACAAAGATATCGGCATTATGTATATCATATTTGCCGTTTTTGCTGGAATTGTCGGAGGTTTGTTCTCACTGCTTTTTA GGTTAGAGCTTGCAATGCCCGGCGGCACTTTCTTAAATCATGATTTCCAGCTATATAACGTGCTTATCACAGCACATGCG GTTATTATGGTATTCTTTATGATTATGCCGGCTTTGTTCGGCGGCTTTGGTAACTATTTCGTACCTCTGTTAATAGGGGC TCCCGATATGGCATTTCCACGCCTTAACAATATCAGTTTTTGGCTACTAGTTCCTGCTTTTCTTTTACTTATGGGCTCAG CTTTTGTTGACGGTGGGCCAGGAACGGGCTGGACGCTCTACCCTCCTTTAAGTAATTTAAGCGGTCACCCCGGTGCAGCC GTTGATATGGCTATTTTCAGTTTACATTTAACCGGTCTATCGTCAATCCTTGGATCAATTAACTTAATCGTTACTATCTT TAATATGAGAGCTCCAGGAATGGGGCTTTTCAAGATGCCGTTATTCGTTTGGTCTATTTTAGTTACCGCATTTCTAATAA TTCTTGCGATGCCGGTACTTGGTGGAGCTATTACTATGCTACTTACAGATCGTAATTTTGGAACTACTTTCTTTAAGCCT GACGGCGGCGGTGATCCTGTATTATTTCAGCATCTATTTTGGTTTTTCGGTCATCCTGAAGTATATATCGTAATACTTCC AGGCTTTGGTATAGTAAGTCAAGTTATTTCAACTTTTTCACGCAAACCTATATTCGGCTATCAAGGTATGATCGGGGCCA TGGTGATAATAGGCTTTGTTGGATTTATCGTATGGGCTCACCATATGTTTACTGTTGGGCTTTCTTATAATGCACTTATA TATTTCACTGCCGGAACAATGATTATAGCAGTTCCGACGGGTATTAAAATATTTAGCTGGATAGCGACTATGTGGGGTGG TTCGATTACATTCCCAACTCCTATGCTATTTTCGATAGGATTTATTATATTATTCACGATCGGCGGCGTAACCGGCATAA TCCTATCAAATTCGGCACTTGATAGAGTTCTGCACGATACATATTATGTTGTTGCACATTTCCATTATACGATGTCGCTC GGTGCTTTATTTACGGCATTTGCAGGCTTTTATTATTGGTTTGGCAAAATATCCGGTAAACAATATCCGGACATTTTAGG CAAAATTCATTTTTGGATTACCTTTATAGGCGTTAATTTAACTTTCTTCCCGCAGCATTTCTTAGGTCTTGCGGGCATGC CAAGAAGAATACCGGACTACCCTGAAGCTTTCGCCGGCTGGAATATGGTTTCGTCGATAGGAGCAGGTATTTCTATGTTT GCTGCCCTTTATTTTGTATTTATCGTTTTCTATACGCTAAAATACGGCAAAGATTGTCCAAACAATCCTTGGGGAGAAGG AGCAGACACATTAGAGTGGACACTTACCTCACCACCGCCGTTCCATACTTTTGAAACACCACCACATATTGAGGGGTAA Protein sequence : MDITTTEIYHDDHHTPHGWRRWLFSTNHKDIGIMYIIFAVFAGIVGGLFSLLFRLELAMPGGTFLNHDFQLYNVLITAHA VIMVFFMIMPALFGGFGNYFVPLLIGAPDMAFPRLNNISFWLLVPAFLLLMGSAFVDGGPGTGWTLYPPLSNLSGHPGAA VDMAIFSLHLTGLSSILGSINLIVTIFNMRAPGMGLFKMPLFVWSILVTAFLIILAMPVLGGAITMLLTDRNFGTTFFKP DGGGDPVLFQHLFWFFGHPEVYIVILPGFGIVSQVISTFSRKPIFGYQGMIGAMVIIGFVGFIVWAHHMFTVGLSYNALI YFTAGTMIIAVPTGIKIFSWIATMWGGSITFPTPMLFSIGFIILFTIGGVTGIILSNSALDRVLHDTYYVVAHFHYTMSL GALFTAFAGFYYWFGKISGKQYPDILGKIHFWITFIGVNLTFFPQHFLGLAGMPRRIPDYPEAFAGWNMVSSIGAGISMF AALYFVFIVFYTLKYGKDCPNNPWGEGADTLEWTLTSPPPFHTFETPPHIEG |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 6e-95 | 47 |
