Gene Information

Name : gpmI (RATSFB_0133)
Accession : YP_004856621.1
Strain : Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit
Genome accession: NC_016012
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : phosphoglyceromutase
Function : -
COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism
COG ID : COG0696
EC number : -
Position : 169246 - 170778 bp
Length : 1533 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
GTGAATAAGAATTTATGTGTTCTATTAATTTTAGATGGATTTGGTATATCTAAAGATTTATTTGGAAATTCCATAGCTAA
GGCTAAAACGGATAATATAGATAGAATTAATGCTATATATCCAAATATTGGTTTACATGCAAGTGGTATGAACGTTGGAT
TACCAGATGGTCAAATGGGGAATTCAGAGGTTGGTCATTTAAATATAGGTACAGGAAGAATAATTTATCAAGAACTAACA
AGGATAACAAAATCTATAAATGATGGAGATTTTTTCAAAAATGAAAAGTTAATAAAAGTGATGGATAATTGTATTAAAAA
CGATACAAACCTTCATGTTATGGGACTTGCATCAGATGGAGGGGTTCATGCTCATTATGATCATTTAAAAGCTGTTCTAA
AGCTTGCAAAAGAGAAAAATGTAAAGAAAACTTATATACATTTATTTACTGATGGAAGAGATGTTTCTCCAACTTCAGGC
CATATGTATATTAAAAATATTAAAGATTATATCAATCAAATATCTTATGGAATTATTTCAACTATCTCAGGAAGATATTA
CACAATGGATAGAGATAAAAGATGGGATAGAGTACAAAAGGCTTATGATGCTATAGTTCGTGGTATTGGAGAGGACAGAA
TTCATAAAGATCCAGTTGATGTTTTAAAATCATATTATAATGACGGAATAACAGATGAATTTGTACCACCAACTTTGATA
GAACCAAATGGAAATATTAAAGATAAAGATTCATGCATTTTTGTTAATTTTAGGCCAGATAGAGCTAGAGAGTTAACTTA
TGCTATAGTTGATAAAGGGTTTAAAGAATTTGATGTTGAAAATTTAGATATTAATTTTTTATGTATGACTATGTATGATA
AGAAACTTAATAATGTTTTAGTAGCATTTGAACCTGAAGTTTACCCAAATACGCTAGGAGAGTATTTGAGTAATCAGAAC
AAGAAACAATTAAGAATCGCAGAAACTGAGAAGTATGCACATGTTACGTTTTTCTTCAATGGTGGAATTGAACAGTCGTA
CAACGGAGAGGATAGAATTTTAATACCTTCTCCTAATGTTAAAACATATGATTTGAAACCTGAGATGAGTTTACCTGAGC
TTACAGATACATTGATTCAATCAATAGAATCTGATAAATATGATTTTATAGTTTGTAATATAGCAAATCCTGATATGGTT
GGGCATACAGGGAATTTTGAAGCTACTATTAAAGCTATTGAATCTGTTGATTTAGCTGTTGGTAAAATATCTGATAAGAT
TTTAAGTCTTGGACACAAATTATTTATTACGGCTGATCATGGAAATGCTGAATGTATGGTTGATGAAAATGGTGGACCTA
TGACTGCCCATACCTGTAATAAAGTTCCATTTATATACGTTTCAGGAGATTATGAAAGTATAGAAATAAAAGAAAGTGGA
AAACTTGCAGATATAGCACCAACGATTCTAAATGTTATGGGATTAGATGTTCCACCAGAAATTACTGGGGAAAATTTAAT
AACAAAAAAATAA

Protein sequence :
MNKNLCVLLILDGFGISKDLFGNSIAKAKTDNIDRINAIYPNIGLHASGMNVGLPDGQMGNSEVGHLNIGTGRIIYQELT
RITKSINDGDFFKNEKLIKVMDNCIKNDTNLHVMGLASDGGVHAHYDHLKAVLKLAKEKNVKKTYIHLFTDGRDVSPTSG
HMYIKNIKDYINQISYGIISTISGRYYTMDRDKRWDRVQKAYDAIVRGIGEDRIHKDPVDVLKSYYNDGITDEFVPPTLI
EPNGNIKDKDSCIFVNFRPDRARELTYAIVDKGFKEFDVENLDINFLCMTMYDKKLNNVLVAFEPEVYPNTLGEYLSNQN
KKQLRIAETEKYAHVTFFFNGGIEQSYNGEDRILIPSPNVKTYDLKPEMSLPELTDTLIQSIESDKYDFIVCNIANPDMV
GHTGNFEATIKAIESVDLAVGKISDKILSLGHKLFITADHGNAECMVDENGGPMTAHTCNKVPFIYVSGDYESIEIKESG
KLADIAPTILNVMGLDVPPEITGENLITKK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00298 YP_008207763.1 Phosphoglyceromutase Not tested AbaR25 Protein 3e-104 49
BJAB0868_00302 YP_008211628.1 Phosphoglyceromutase Not tested AbaR26 Protein 3e-104 49