Name : leuS (RATSFB_1159) Accession : YP_004857647.1 Strain : Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit Genome accession: NC_016012 Putative virulence/resistance : Unknown Product : leucyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG0495 EC number : - Position : 1332129 - 1334591 bp Length : 2463 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAATACAGGCTACTCCGTCAAAATAGATAAGGATTCCCAAAAATTTTGGGAGGATCAAGAAATTTCTAAATTCGATTT GAACAATGAAAAAGAAAAGCTATATGTTCTTGAAATGTTTTCATACCCATCAGGAAGTAATCTACACGCTGGACATTGGT TTAATTTTGGACTTGTAGACTCATACGCACGATATAAAAAAATGAGTGGATTTAATGTATTTCAACCAATGGGATTCGAT GCTTTTGGACTTCCTGCAGAAAACTATGCAATAAAAACAGGAATACACCCTAAAGATTCCACAATGAAAAACATCGATAC TATGAGATTACAGCTCAAAAAAATGGGAGCTTTATTTAATTTTGAAAATGAAGTAGTTACATGTACACCTGATTACTACA AATGGACTCAATGGATATTTTTGAAATTATATGAAAACAATTTAGCTTATAGAGAAAACGCTCCTGTTAATTTCTGCCCT TCTTGCAATACGGTTCTTGCAAATGAACAGGTTATAGATAATTGTTGCGAGCGATGCTCAACTGAAATTGAAAAGAAAAA CTTAACTCAATGGTTCTTTAAAATAACAAATTATGCTGATGAACTAGTTAATAAATTGGATTCATTAGACTGGCCTGATA AAACAAAATCTATGCAAAAAAATTGGATTGGAAGATCGTTTGGAACTATAGTTAATTTCTCTATCGATAATTCTAACAAA AATTTTAATGTATTCACAACGAGAGTAGATACTCTCATGGGTGTTTCTTACGTTGTTCTAGCTCCTGAACATAATCTAGT TTTGGAAATAACTACAAAAGACAATCTTAATAAAGTTAAAAATTACATAGAAGAATCATCTAAACAATCAGAAATAGATA GATTATCTTCATCCAGAGAAAAGACAGGAGTTTTCACTGGATCTTATGCGATTCATCCGATAACAAATAAAAAAATCCCT ATTTGGATTTCAAATTACGTTATATCAACTTATGGAACTGGAGCTGTAATGGCAGTTCCTGCACATGATGAAAGAGATTT TGAATTTGCAACCAAATTTAATCTTCCTATAAATAAAGTTATAACAAATAACAAGGAAGATGAGCTTCCTATGACGAAAA AAGGTGTATTAATAAATTCTCTTCAATTCAATTCATTGTCATCAGATGAAGCTAAAGATAAAATCACTAAATATTTAGAA AGTATAGGAAAAGGAAGTTTTAAAACTACATTTAGACTTCGTGATTGGCTAATATCTAGACAGAGATATTGGGGAGCTCC TATACCTATAGTACACTGTGATGACTGCGGAATTGTACCAGTTCCATACACATCACTTCCTGTAGAACTTCCTTACAATA TTAAATTTAATGCAAATGGTAAATCTCCACTTGAAGAGTGTTCTGAATTCAAGGAAACAACTTGTCCAAAATGCAATAAA AAAGCTAAGAGAGAAACAGACACACTAGATACATTTGTATGTTCATCATGGTATTATTTAAGATACGTAGATCCTAAAAA TAATGATGCCCCATTTGATAGTAATAAAGTAAACAAAATGCTTCCTGTCGATAAATATGTCGGTGGACCTGAACACGCTT GCATGCATCTTTTATACGCAAGATTTATAACAAAAGCTCTACGTGATATGGGATATTTAAATTTTGATGAACCTTTCACA TCTCTAACTCATCAAGGGTTAATACTTGGACCTGATGGATTTAAAATGAGTAAATCTAGGGGAAATACAATTTCTCCAGA TAAATACATAGAAGAATATGGATCAGATGTATTTAGAGTGTATTTAATGTTTGCATTTACATACACAGAAGGAGGAGCTT GGAGTGACGACGGTATAAAATCTATTTGTAAATTTATAAATCGAAGTGAGAGGCTCATAAATAAATCATTAGATATATTA AGAAATAAAAATTTCATTTTTGATTATGATAAAGAGGCTCATGAAGAACTCCTATTTGCTCTAAATACTTCAATTAAAAT GATAACATCCGATATAGAACAACTTCAATTCAATACTTGTATTGCTCATTTTATGAAGTTAACAAACCAATTTTCAAAAT ATTTAAACACAAACAAGATAACTTACGATGTTTTAAAAGATTTATTATTAAATTATTTAAAAATATTTGCACCATTTGCT CCTCATTTCTCTGAATATTATTTTGGAATAGTTAAAGAATTAGATAATGAAGCTAAAACTTCTGTTTTCCTTGAAGAATA TCCTAAAGCAGATGAAAAGTATTTAACTCGAGATCAAGTAGAAATTGCTATTCAAATTAATGGAAAAATTAAAACAAAAA TATATGTGGATACAAACTCTAGTGAGGAAGAAATCAAAAATATTTCTTTATCAAACAACGATATAATAAATAACATAACT GGAAAAACTATAGTTAAAGTTATCGTTATTCAAAATAGACTTGTAAATATCGTTGTAAAATGA Protein sequence : MNTGYSVKIDKDSQKFWEDQEISKFDLNNEKEKLYVLEMFSYPSGSNLHAGHWFNFGLVDSYARYKKMSGFNVFQPMGFD AFGLPAENYAIKTGIHPKDSTMKNIDTMRLQLKKMGALFNFENEVVTCTPDYYKWTQWIFLKLYENNLAYRENAPVNFCP SCNTVLANEQVIDNCCERCSTEIEKKNLTQWFFKITNYADELVNKLDSLDWPDKTKSMQKNWIGRSFGTIVNFSIDNSNK NFNVFTTRVDTLMGVSYVVLAPEHNLVLEITTKDNLNKVKNYIEESSKQSEIDRLSSSREKTGVFTGSYAIHPITNKKIP IWISNYVISTYGTGAVMAVPAHDERDFEFATKFNLPINKVITNNKEDELPMTKKGVLINSLQFNSLSSDEAKDKITKYLE SIGKGSFKTTFRLRDWLISRQRYWGAPIPIVHCDDCGIVPVPYTSLPVELPYNIKFNANGKSPLEECSEFKETTCPKCNK KAKRETDTLDTFVCSSWYYLRYVDPKNNDAPFDSNKVNKMLPVDKYVGGPEHACMHLLYARFITKALRDMGYLNFDEPFT SLTHQGLILGPDGFKMSKSRGNTISPDKYIEEYGSDVFRVYLMFAFTYTEGGAWSDDGIKSICKFINRSERLINKSLDIL RNKNFIFDYDKEAHEELLFALNTSIKMITSDIEQLQFNTCIAHFMKLTNQFSKYLNTNKITYDVLKDLLLNYLKIFAPFA PHFSEYYFGIVKELDNEAKTSVFLEEYPKADEKYLTRDQVEIAIQINGKIKTKIYVDTNSSEEEIKNISLSNNDIINNIT GKTIVKVIVIQNRLVNIVVK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
leuS | YP_281511.2 | leucyl-tRNA synthetase | Not tested | Not named | Protein | 9e-152 | 42 |