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Name : LIV_0356 (LIV_0356) Accession : YP_004854171.1 Strain : Listeria ivanovii PAM 55 Genome accession: NC_016011 Putative virulence/resistance : Virulence Product : putative internalin protein Function : - COG functional category : S : Function unknown COG ID : COG4886 EC number : - Position : 393742 - 396123 bp Length : 2382 bp Strand : + Note : similar to internalin, with GW moduls DNA sequence : TTGGAAAATAAACGTAATTTATCGATGTGGAAAATTTTAGTAACAAGCTTCATCATTATTTTTAGTATGTGGATGAGCTT AAATTACGGGACGAATGCGCGGGCCTCAAACATTACACCCTCAACCACAATTAACCAGATTTTTCCAGATCCAGCTTTAG CAGAAGTCGTTAGAGAAAGCTTGCAAAAAGCAGCGGTTACAGATGTGGTTTCACAAAACGAGTTAAATGGAATTCTGAAA ATTGACGCTGATGATAAAAAGATTAAGTCCATCAAAGGTATCGAAAATTTAACTCATTTAAAAAACTTATTTTTAAATGA TAATGAGATAAGTGATATAAGTATGTTGGCAGATTTAAAAAACTTAGAGCGGTTAAGCTTGGATGGAAATAAAGTAACTG ATTTAAGCGGGCTTGAGAATTTAGTGGATCTAGTTTATGTTTCTATGGATGAAAATGGAATAAGTGACATCAGACCGCTT AGAAGATTAGCTAATTTAGACAGTTTATATTTGGATAATAATAAATTGACGGATATAACCCCACTATCGGGTTTAACGAA ATTAACAACCTTATCTCTAGAAGGAAATCAATTAAACGACATAATTGCGCTTGTGGGTTTAACAAATTTGCAAAATCTAT ATTTGAGTAAGAACCAAATAATGGATATAAGAGGATTAGCTGCTCTTAAGAACCTAGATGTGTTAGAGTTGCATGATCAA GAACACGTGAATAAACCAATTAATTATGAGCACAATTTAGTCATACAAAATACAGTAAGAGATGAAAATGGAACATTGGT TAGTCCAGAAGTTATAAGTAATGGTGGTGACTACGAAAAGCCAAACTTAAAGTGGAATTTGCAATCTTATACCAATGAAG TATTTTGTATCTTTTATCAGCCTGTCTTGATTGGAAAAGCAAAGGCAAATTATTATGTTAGATTAACACAGCCATTAAAA GCAGTATATACAGTGAACTTCCATATTGACAGCACAGTAATACCGACAAAAGTAGAAACAGGTTCCCTTTTGAATGAACC AAAGTCCCCAACCAAACAAGGCTATACTTTTAAAGGTTGGTACACGGCCAAATCAGCTGGACGCATGTGGGACTTTAAAA AAGACCAGATGCCAGGAAATAATTTGGATTTATACGCTGTGTTTAAAGAGGAACCCACTGAAAAAGTAGTTAATCTAACT CGCTATGTTAATAACATTTATGGGAATTCAGGAGTCTATACGCTCCCTAAAGAAGATAATTCACTAAAAAAGGGTACCCT GGTTGCGCACAGATTCAAAGCTTTAACAGTTGATCGAGAAACGCAAAGTGGTGGCGAACTATGGTATAGGCTGAAAAATA TCGGTTGGACAAAAGCGAAAAACCTTTCCCTGGATAGATATGACAAAATAACAGGGGATAAAGCAATAATAGCCTATGCA AAAGTAAAAACTGCAAAGGGAAATACTGTTTGGACAAAACCGTTTAATACTGCCGGTGCCAAACAGGTAAACCAACTTTC TGCATTCTCTGGCAAGAAACTGCGTATCTTACGCGAAGCAAAAACACCGATTTCCACATGGTATCAATTCAGTATTAACG GTAAAACTATTGGCTGGGCAGACATGAAAGCTCTTAACATCTTTTATAATCAACGTATGGAAAAAGCTGCTAATCTAACT CGTTATGTGAATGTAAATAAAGCAAGTGCTGCTATCTATTCTGTTCCAGTAGAAGATGCGCCGGTGAAAAAAGGAACCCT AGCTAGCCACAAATTCAAAGCGCTAAAGATTGATCGTCAAGCAACTGTCGAAGGACAACTTTGGTACAGAATTAAAAATA TTGGCTGGACAAAAGCCACTAATTTATCCACTGACAAATACGATAAAATTAAGTACAACAAAGCAATCACTGCATATAGT CGTATAAAAAAAGCTTCTGGAAATGCCGTTTGGACGAAACCTTATAATACAGCAGGTGCCAAACGTGTAAAAGCACTTGC TGCCTATACTGGAAAAAAACTACGAATCCTACGAGAAGCAAAAACATCCAGTGCCACATGGTATCAGTTCAGCATTAATG GCAAAACTATCGGCTGGGTCGACACGCGTGCGCTAAATACATTTTATAAGCCAAGTATGGAAAAACGTGCCAATTTAACA CGTTACGTAATTGCCCGCAAAGCTAAAGAGTTTTGCTACAAGCTCCCAGTGATAGACGCACCCTTGAAAAAAGCAAGATT AACTAGCTACAAAGGAAAAGTGCTAAAAGTGGATCGGCAAGCAAAAGTAGAAGGGCAAGTATGGTATCGCATAAAAAGAG GCTCTACTATTATCGGATGGACCAAAGCCGCCAACCTCAGCGCAAAGAAATCATACCGTTAA Protein sequence : MENKRNLSMWKILVTSFIIIFSMWMSLNYGTNARASNITPSTTINQIFPDPALAEVVRESLQKAAVTDVVSQNELNGILK IDADDKKIKSIKGIENLTHLKNLFLNDNEISDISMLADLKNLERLSLDGNKVTDLSGLENLVDLVYVSMDENGISDIRPL RRLANLDSLYLDNNKLTDITPLSGLTKLTTLSLEGNQLNDIIALVGLTNLQNLYLSKNQIMDIRGLAALKNLDVLELHDQ EHVNKPINYEHNLVIQNTVRDENGTLVSPEVISNGGDYEKPNLKWNLQSYTNEVFCIFYQPVLIGKAKANYYVRLTQPLK AVYTVNFHIDSTVIPTKVETGSLLNEPKSPTKQGYTFKGWYTAKSAGRMWDFKKDQMPGNNLDLYAVFKEEPTEKVVNLT RYVNNIYGNSGVYTLPKEDNSLKKGTLVAHRFKALTVDRETQSGGELWYRLKNIGWTKAKNLSLDRYDKITGDKAIIAYA KVKTAKGNTVWTKPFNTAGAKQVNQLSAFSGKKLRILREAKTPISTWYQFSINGKTIGWADMKALNIFYNQRMEKAANLT RYVNVNKASAAIYSVPVEDAPVKKGTLASHKFKALKIDRQATVEGQLWYRIKNIGWTKATNLSTDKYDKIKYNKAITAYS RIKKASGNAVWTKPYNTAGAKRVKALAAYTGKKLRILREAKTSSATWYQFSINGKTIGWVDTRALNTFYKPSMEKRANLT RYVIARKAKEFCYKLPVIDAPLKKARLTSYKGKVLKVDRQAKVEGQVWYRIKRGSTIIGWTKAANLSAKKSYR |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| inlB | CAC20629.1 | internalin B | Virulence | Internalin | Protein | 4e-173 | 62 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| LIV_0356 | YP_004854171.1 | putative internalin protein | VFG0076 | Protein | 2e-173 | 62 |
