Gene Information

Name : LIV_0353 (LIV_0353)
Accession : YP_004854169.1
Strain : Listeria ivanovii PAM 55
Genome accession: NC_016011
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : putative internalin A
Function : -
COG functional category : S : Function unknown
COG ID : COG4886
EC number : -
Position : 384648 - 387044 bp
Length : 2397 bp
Strand : +
Note : similar to internalin A

DNA sequence :
GTGAGAAAAGAACAATATGTGTGGTTAAGAAGTATATTATTAGCAATTCTTGTAGGTGTTGGTGGTCTTTATGTTGCAAC
AAGCAATGGAACAAATGTCGAAGCAGCAACTATTTCGAATCCAACTCCTATCAATACGCTTTTCACCGACCCAGCATTAG
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CAAACCCAGATATTACTTGGAATTTACCTAGTTATACAAATGAAGTAAGTTATACTTTTAATCAATCTGTGACAATTGGT
AGAGGAACAGCTACTTTTAGCGGAACGGTTACACAGCCATTAAAAGCGATATTTAATGTTAAATATCATGTGAATGGAAA
TGAGACGGCGACAGAGGTTGAATCTGGCAATTTACTAACGGAACCAAAAGTGCCTACTAAAACAGGCTATACTTTTACAG
GTTGGTTTGATGCGGAAACAGGCGGAACTAAATGGGATTTCATGACAAACAAAATGCCAACAAATGATCTTGATTTGTAT
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GCTACTTCAAGAACCACCAACTCCTACAAAAGAAGGCTATACCTTTAAAGGATGGTACGATGCAAAAACAGGCGGCAACA
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AGCAGGTTACACGTTCACAGGATGGTATGATGCAGAAAAAGGCGGTAACAAGTGGGATTTTGCAAGCGATAAAATGCCCG
CAAATGATATTACTTTGTATGCGCAATTCACAAAAGATCCTGTAACTCCTCCAAATCAACCAAATAATGGAGGAAGCGGT
TCAACTCCATCTGGAACTATACCTGGAAATAACACATCTAATACACAAATGGGTAATTCACAAAGCGCTACCGGTGATAA
CATGAGCGGATATGATCCGTACAATGCTTATAACTACCAAGGTCAAGGTACAGGACTTCCAACTACTGGTGATAGCGATA
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Protein sequence :
MRKEQYVWLRSILLAILVGVGGLYVATSNGTNVEAATISNPTPINTLFTDPALAEVVKTDLGKATVSDTVTQTDLDGITS
LEADRKGITSIAGVEYLNNVTQLDFSYNQITDLTPLANLTKLTSLVMNNNQIADLTPLQNLTSLTELTLFYNKITDVAPL
ANLTNLTNLAITDNEISDVTPIGNLTNLEGLSIGNKVTDIKPLANLTKLERLNLSRNKITDISPVAKLINLQSLSLDNNQ
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STPSGTIPGNNTSNTQMGNSQSATGDNMSGYDPYNAYNYQGQGTGLPTTGDSDNAIYILLGLLLVGTAFAITKKVRTK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
inlA CAC20628.1 internalin A Virulence Internalin Protein 0.0 68

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
LIV_0353 YP_004854169.1 putative internalin A VFG0075 Protein 0.0 68