Name : LIV_0353 (LIV_0353) Accession : YP_004854169.1 Strain : Listeria ivanovii PAM 55 Genome accession: NC_016011 Putative virulence/resistance : Virulence Product : putative internalin A Function : - COG functional category : S : Function unknown COG ID : COG4886 EC number : - Position : 384648 - 387044 bp Length : 2397 bp Strand : + Note : similar to internalin A DNA sequence : GTGAGAAAAGAACAATATGTGTGGTTAAGAAGTATATTATTAGCAATTCTTGTAGGTGTTGGTGGTCTTTATGTTGCAAC AAGCAATGGAACAAATGTCGAAGCAGCAACTATTTCGAATCCAACTCCTATCAATACGCTTTTCACCGACCCAGCATTAG CTGAAGTAGTGAAAACGGATCTAGGAAAAGCAACAGTATCAGATACAGTTACACAAACGGATTTAGATGGAATAACTTCT CTTGAAGCGGATAGAAAAGGTATTACATCTATTGCAGGAGTTGAATATCTAAATAATGTAACCCAATTGGATTTTAGCTA CAATCAAATTACAGATTTAACTCCACTTGCTAATTTAACCAAGTTAACAAGCTTAGTAATGAATAATAACCAAATAGCAG ACTTAACTCCACTTCAGAATTTAACGAGTTTAACTGAATTAACATTGTTTTACAATAAAATAACAGATGTAGCTCCTTTA GCTAATTTAACTAACTTAACGAATTTAGCAATAACTGATAATGAAATTAGTGATGTTACTCCTATTGGTAATTTAACAAA TCTAGAAGGGTTATCTATTGGTAATAAAGTGACAGACATAAAACCTTTAGCTAACTTAACTAAATTAGAGCGATTGAACT TATCAAGAAATAAGATAACAGATATAAGCCCAGTAGCTAAATTAATCAATTTACAAAGCCTATCATTAGATAATAATCAA TTTAGTGATTTAACACCACTTGGGATTTTAACAAATTTAACAGAGCTATCATTGTATAGCAATCATTTATCTGATATTGG TACGTTGGCTAGTTTAACGAACCTAAAGAAATTAAACTTAATGGATAATCAAATAAGTAACTTAGCTCCAATTTCAAATC TAACAAATTTGACAGATTTAAACTTATCAACCAACCAAATTAGTGATTTAAAACCGATTTCTAATTTAACCAATTTAACC GTTTTACAAGTTCCTACAAATCAACTAGAAGATATAAGTCCAATAAGCAGTTTGCCTAATTTAGAGTTTCTAACTTTATA TACGAATCAAATTAGTGATTTAAGCCCGCTGGAGAATTTAACAAAACTAAAACAATTATTTTTCTACGATAATAAGGTGA GTGATGTAAGCCCTATTGCAAACTTAACTAGCTTACAAGAGCTATCGGCAGGAACGAACCAAATAAGCGACCTTACACCA CTAGCTAAACTTACAAGACTTACACAGTTAGGTTTGGATAAGCAAAAAGTGACAAGCCAACCAGTGAAATATCAAAGTAA CTTGGTTGTTCCAAATGCAGTGAAAAATGTAACAGGAGCACTAATTAATCCAGCAACTATAAGCGATAATGGAACTTATA CAAACCCAGATATTACTTGGAATTTACCTAGTTATACAAATGAAGTAAGTTATACTTTTAATCAATCTGTGACAATTGGT AGAGGAACAGCTACTTTTAGCGGAACGGTTACACAGCCATTAAAAGCGATATTTAATGTTAAATATCATGTGAATGGAAA TGAGACGGCGACAGAGGTTGAATCTGGCAATTTACTAACGGAACCAAAAGTGCCTACTAAAACAGGCTATACTTTTACAG GTTGGTTTGATGCGGAAACAGGCGGAACTAAATGGGATTTCATGACAAACAAAATGCCAACAAATGATCTTGATTTGTAT GCCCAATTTACTATTAATGACTATACTGCAACGCTAAATGAAGATGGTAAAACTTCCACGCAAACAGTAAAATACCAAGA GCTACTTCAAGAACCACCAACTCCTACAAAAGAAGGCTATACCTTTAAAGGATGGTACGATGCAAAAACAGGCGGCAACA AGTGGGACTTTACAACAAGTAAAATGCCAGCCAAAGATATCACTTTATACGCGCAGTTTAGTGCTAATAGCTACACAGTA ACGCTTGATGTTGATGGGAAGCAAACTAAGCAAAAAGCAGACTATCAAAGTTTAGTAAAAGAACCAAAAGTCCCAACCAA AGCAGGTTACACGTTCACAGGATGGTATGATGCAGAAAAAGGCGGTAACAAGTGGGATTTTGCAAGCGATAAAATGCCCG CAAATGATATTACTTTGTATGCGCAATTCACAAAAGATCCTGTAACTCCTCCAAATCAACCAAATAATGGAGGAAGCGGT TCAACTCCATCTGGAACTATACCTGGAAATAACACATCTAATACACAAATGGGTAATTCACAAAGCGCTACCGGTGATAA CATGAGCGGATATGATCCGTACAATGCTTATAACTACCAAGGTCAAGGTACAGGACTTCCAACTACTGGTGATAGCGATA ATGCAATCTATATCTTGCTAGGATTATTGTTAGTGGGCACCGCATTTGCCATCACTAAAAAGGTGCGTACCAAGTAA Protein sequence : MRKEQYVWLRSILLAILVGVGGLYVATSNGTNVEAATISNPTPINTLFTDPALAEVVKTDLGKATVSDTVTQTDLDGITS LEADRKGITSIAGVEYLNNVTQLDFSYNQITDLTPLANLTKLTSLVMNNNQIADLTPLQNLTSLTELTLFYNKITDVAPL ANLTNLTNLAITDNEISDVTPIGNLTNLEGLSIGNKVTDIKPLANLTKLERLNLSRNKITDISPVAKLINLQSLSLDNNQ FSDLTPLGILTNLTELSLYSNHLSDIGTLASLTNLKKLNLMDNQISNLAPISNLTNLTDLNLSTNQISDLKPISNLTNLT VLQVPTNQLEDISPISSLPNLEFLTLYTNQISDLSPLENLTKLKQLFFYDNKVSDVSPIANLTSLQELSAGTNQISDLTP LAKLTRLTQLGLDKQKVTSQPVKYQSNLVVPNAVKNVTGALINPATISDNGTYTNPDITWNLPSYTNEVSYTFNQSVTIG RGTATFSGTVTQPLKAIFNVKYHVNGNETATEVESGNLLTEPKVPTKTGYTFTGWFDAETGGTKWDFMTNKMPTNDLDLY AQFTINDYTATLNEDGKTSTQTVKYQELLQEPPTPTKEGYTFKGWYDAKTGGNKWDFTTSKMPAKDITLYAQFSANSYTV TLDVDGKQTKQKADYQSLVKEPKVPTKAGYTFTGWYDAEKGGNKWDFASDKMPANDITLYAQFTKDPVTPPNQPNNGGSG STPSGTIPGNNTSNTQMGNSQSATGDNMSGYDPYNAYNYQGQGTGLPTTGDSDNAIYILLGLLLVGTAFAITKKVRTK |
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Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
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