Gene Information

Name : LIV_1690 (LIV_1690)
Accession : YP_004855440.1
Strain : Listeria ivanovii PAM 55
Genome accession: NC_016011
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : putative soluble internalin
Function : -
COG functional category : S : Function unknown
COG ID : COG4886
EC number : -
Position : 1783325 - 1784665 bp
Length : 1341 bp
Strand : -
Note : Similar to soluble internalin

DNA sequence :
TTGAAAAAACAAAATTGGTTACAATATGTAGGAGTAGCAATGCTATTATTAATTATAGGTTTGTGCATTAATACAGGTTC
TGGAATGAAGGTACATGCCGCAAATATTCCAAATCCTATGCCTCTAAATCAACTATTCCCTGATTCAAATTTAGCGTATG
AGATGAAAAAAAATTTAAGAAAAGCAAGTGTAACAGATGTTGTCACGCAACCGGAACTAGATAGTTTACGCCAAGTCAAT
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GTGGTATTAAGAAAATTGCAAAAACTAATCCACTAGCGCACTTGTTTCTGGGTGATAATGAGCTAACAGATATTAGTCCG
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TGCTTGTATCAATGCAGCAATGTGTCAATGAACCTGTAGATTATCAGTCTAAATTAGTTATTCCAAATACTTTTAAAGAC
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TGACACAGCCATTACAACAAAAGGCACCAGAAATTGAAAATTCTAAACCAATTAATCAAATTTTTCCAGATGTTAATTTA
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ATAATCACATAAGTAACATCCGTCCTTTAGAAAATTCCGTTCATTTAACAGAATTGTATTTAGACAATAATGATTTAACC
GATGAAAATGTTAGTGAACTTACTAATTTATCACAATTAGAAGTTCTATCTATTAGAGTTAATAAAATTAGTGGAGCAAC
TGCAAGAAAGTTAATGAATAATTTAATGGAATTAGAAGAATTTAATTGGAGTAAAAAATAA

Protein sequence :
MKKQNWLQYVGVAMLLLIIGLCINTGSGMKVHAANIPNPMPLNQLFPDSNLAYEMKKNLRKASVTDVVTQPELDSLRQVN
ADDSGIQSVEGLQYLTNVEVLYLSGNQITDISPLASLKKLIVLYLERNKLADISGIKKIAKTNPLAHLFLGDNELTDISP
LENLTNLETLSLEHNKLSNVQILPSLTNLKELDLRGNKLRDIRGLEKLKNMERLLVSMQQCVNEPVDYQSKLVIPNTFKD
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DENVSELTNLSQLEVLSIRVNKISGATARKLMNNLMELEEFNWSKK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
i-inlJ CAC20607.1 internalin J Virulence LIPI-2 Protein 3e-105 58