Name : LIV_1690 (LIV_1690) Accession : YP_004855440.1 Strain : Listeria ivanovii PAM 55 Genome accession: NC_016011 Putative virulence/resistance : Virulence Product : putative soluble internalin Function : - COG functional category : S : Function unknown COG ID : COG4886 EC number : - Position : 1783325 - 1784665 bp Length : 1341 bp Strand : - Note : Similar to soluble internalin DNA sequence : TTGAAAAAACAAAATTGGTTACAATATGTAGGAGTAGCAATGCTATTATTAATTATAGGTTTGTGCATTAATACAGGTTC TGGAATGAAGGTACATGCCGCAAATATTCCAAATCCTATGCCTCTAAATCAACTATTCCCTGATTCAAATTTAGCGTATG AGATGAAAAAAAATTTAAGAAAAGCAAGTGTAACAGATGTTGTCACGCAACCGGAACTAGATAGTTTACGCCAAGTCAAT GCTGACGATAGTGGGATCCAATCAGTGGAAGGACTACAATACTTGACTAATGTAGAAGTGTTGTATTTGTCAGGCAACCA AATAACGGATATTAGCCCTTTAGCAAGTTTAAAAAAATTGATTGTATTATATCTGGAAAGGAACAAATTAGCTGACATAA GTGGTATTAAGAAAATTGCAAAAACTAATCCACTAGCGCACTTGTTTCTGGGTGATAATGAGCTAACAGATATTAGTCCG TTAGAAAATTTAACCAACTTAGAAACTTTATCTTTAGAACATAATAAGTTAAGTAATGTCCAGATACTCCCTAGTTTGAC AAATTTAAAAGAATTGGATTTGAGAGGAAACAAATTACGAGATATACGCGGATTAGAAAAATTAAAGAATATGGAGAGAC TGCTTGTATCAATGCAGCAATGTGTCAATGAACCTGTAGATTATCAGTCTAAATTAGTTATTCCAAATACTTTTAAAGAC ATGGATGGAAAACTGATTGCACCAAGCTATATTAGCAATGATGGGACATACACAGACGGTAAACTTATATGGAATTTACC TGCATACATTAAAACAGTATCTTGCTCATTTAATAAAGAAGTAAAAATTGGGAAAAGCACGACAATGTTTCATGGGGTAA TGACACAGCCATTACAACAAAAGGCACCAGAAATTGAAAATTCTAAACCAATTAATCAAATTTTTCCAGATGTTAATTTA GCAGAAATAGTGAAAAAAAGCTTAAGAAAGAAATATATAACAGATGTGGTCTCTCAAGTTGAGCTAAATAAAATACATGA AATCCACGCTGATAGTAAAGATATTCATTCCATTGAGGGACTACAACATTTATACAACTTAAAAAGACTCTTTTTATCGG ATAATCACATAAGTAACATCCGTCCTTTAGAAAATTCCGTTCATTTAACAGAATTGTATTTAGACAATAATGATTTAACC GATGAAAATGTTAGTGAACTTACTAATTTATCACAATTAGAAGTTCTATCTATTAGAGTTAATAAAATTAGTGGAGCAAC TGCAAGAAAGTTAATGAATAATTTAATGGAATTAGAAGAATTTAATTGGAGTAAAAAATAA Protein sequence : MKKQNWLQYVGVAMLLLIIGLCINTGSGMKVHAANIPNPMPLNQLFPDSNLAYEMKKNLRKASVTDVVTQPELDSLRQVN ADDSGIQSVEGLQYLTNVEVLYLSGNQITDISPLASLKKLIVLYLERNKLADISGIKKIAKTNPLAHLFLGDNELTDISP LENLTNLETLSLEHNKLSNVQILPSLTNLKELDLRGNKLRDIRGLEKLKNMERLLVSMQQCVNEPVDYQSKLVIPNTFKD MDGKLIAPSYISNDGTYTDGKLIWNLPAYIKTVSCSFNKEVKIGKSTTMFHGVMTQPLQQKAPEIENSKPINQIFPDVNL AEIVKKSLRKKYITDVVSQVELNKIHEIHADSKDIHSIEGLQHLYNLKRLFLSDNHISNIRPLENSVHLTELYLDNNDLT DENVSELTNLSQLEVLSIRVNKISGATARKLMNNLMELEEFNWSKK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
i-inlJ | CAC20607.1 | internalin J | Virulence | LIPI-2 | Protein | 3e-105 | 58 |