Gene Information

Name : LIV_1472 (LIV_1472)
Accession : YP_004855227.1
Strain : Listeria ivanovii PAM 55
Genome accession: NC_016011
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : putative ammonium transporter NrgA
Function : -
COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism
COG ID : COG0004
EC number : -
Position : 1536319 - 1537524 bp
Length : 1206 bp
Strand : +
Note : Similar to ammonium transporter NrgA

DNA sequence :
ATGGAATCAGTATTTATGTTCTTTTGTACTTTATTGGTTTGGTTGATGACACCAGGAATTGCATTATTTTACGGTGGTAT
GGTTAGACGCAAAAATGTTTTAAGCACAGCAATGTATAGTTTTAGCTCGATGGCAATTATTTCTATTCTTTGGGTTATTG
TTGGTTATTCACTGGCTTTTGCTCCAGGAAATGGCTTTATCGGAAGTTTTGACTGGACTTTCCTTCATAATGTCGGCTTT
GCCTCAAATGAGACTTACTCAGATGCTATTCCACATACTCTATTCATGATGTTCCAAATGACTTTCGCTATTTTGACAGT
AGCAATCATTTCTGGGGCTTTCGCAGAACGCATGAACTTCTCTGCTTACTTAATTTTTATTATCTTATGGTCTTTACTCG
TTTACTCTCCAGTTGCTCATTGGGTTTGGGGCGACGGTGGTTGGTTACGAGAACTTGGCGCACTAGATTTCGCTGGTGGA
AATGTTGTTCATATTAGTTCCGGTGTCACTGGCTTAGTTTTAGCAATTATGATTGGACGCCGTAAAGAAGCTGATTCCGC
TTCCCCGCATAATTTACCACTTGCTTTAATCGGCGGAATTCTCGTTTGGTTTGGTTGGTATGGATTTAATGTTGGTAGTG
CCTTAACTATTGATAACGTTGCAATGGCTGCTTTTGTTAATACTAATACGGCTGCAGCAGCTGGTATTATCGGTTGGGGA
TTAGTCGAGTGGCTTATTAATAAAAAACCGACGATGCTTGGTACTATTTCTGGCGCTATTGCAGGACTCGTTTCTATCAC
TCCAGCTGCTGGATTTGTCACTGCCCCCAGTTCGTTAATTATCGGTTTTCTTGGTGGAGCTCTTTGTTTCTGGGCTGTTT
TCTGGTTAAAAGGTAAAGTAAAATACGATGATGCGCTGGATGCATTCGGCCTTCACGGAATTGGTGGTATTTGGGGTGGT
ATTGCAACAGGACTCTTTGCTACAACGAAAGTAAATGAAGCTGGTGCAGATGGCCTGTTTTACGGCAATGCTTCGTTAGT
AGTGAAGCAATTAATCGCGATTGGTTCCTCAGTTGCCTATGTTGCTGTTGTAACTGCCTTGATTGTTGTTATGATCAAGT
TATTCTTACCAATCCGTGTTAATGAAGAACAAGAATATAAAGGACTTGATTTGACGCTACACGGCGAAAAAGCTTATCAA
GAATAA

Protein sequence :
MESVFMFFCTLLVWLMTPGIALFYGGMVRRKNVLSTAMYSFSSMAIISILWVIVGYSLAFAPGNGFIGSFDWTFLHNVGF
ASNETYSDAIPHTLFMMFQMTFAILTVAIISGAFAERMNFSAYLIFIILWSLLVYSPVAHWVWGDGGWLRELGALDFAGG
NVVHISSGVTGLVLAIMIGRRKEADSASPHNLPLALIGGILVWFGWYGFNVGSALTIDNVAMAAFVNTNTAAAAGIIGWG
LVEWLINKKPTMLGTISGAIAGLVSITPAAGFVTAPSSLIIGFLGGALCFWAVFWLKGKVKYDDALDAFGLHGIGGIWGG
IATGLFATTKVNEAGADGLFYGNASLVVKQLIAIGSSVAYVAVVTALIVVMIKLFLPIRVNEEQEYKGLDLTLHGEKAYQ
E

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00287 YP_008207752.1 Ammonia permease Not tested AbaR25 Protein 4e-77 49
BJAB0868_00291 YP_008211617.1 Ammonia permease Not tested AbaR26 Protein 4e-77 49