Name : qoxB (LIV_0014) Accession : YP_004853851.1 Strain : Listeria ivanovii PAM 55 Genome accession: NC_016011 Putative virulence/resistance : Unknown Product : putative AA3-600 quinol oxidase subunit I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : - Position : 17335 - 19314 bp Length : 1980 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAAATGGAATGAGTTTATCGTAACTGGCGACCCGATGATTCTAGGTGCACAGATATCTATTGTGCTTGCTAGTGTCGG TATCGTTGTGTTACTAACTTACACAAAAAAATGGAAATGGCTCATGAAAGAGTGGATTTCCTCTGTTGATCATAAAAAAA TTGGTATTATGTATTTGCTTGCTGCTGTTTTAATGTTTTTCCGCGGCGGTGTGGATGCACTGATGATGCGTACTCAGCTA GCATTACCAGATATGAAATTTTTGGATGCACAACATTACAATGAAGTATTTTCAACGCACGGAACAATCATGATTTTATT TATGGCAATGCCGTTTATTATTGGACTTATGAACATTGCGGTACCACTTCAAATTGGTGCTCGTGACGTAGCATTTCCAT TTTTAAACAACTTAAGTTTTTGGACATTCTTTATGGGTGCCATGCTATTTAACTTATCTTTTGTTATTGGTGGTTCGCCG GATGCTGGTTGGACAAACTATGCGCCACTAGCGACGGACTTTAGTGCTGGATATGGAATTAATTTCTATCTTCTAGGAGT TCAAATCGCTGGTATTGGTACACTGATGACGGGGATTAATTTTTTCGTCACGATTTTACGAATGCGTACAAAAGGTATGA CATTAATGAAAATGCCAATGTTTACTTGGTCTTCATTAATTACAAGTTTAATTATTATCTTTGCTTTCCCAGTTTTAACA GTAGCTCTCGCGTTGATGTCATTTGACCGATTGTTTGGGACTGCATTCTTCACGCTCACGAACGGCGGGCTCCCAATGAT GTGGGCCAACCTATTCTGGGTTTGGGGACATCCGGAAGTGTATATCGTAATTTTACCGGCGTTTGGTATTTTTTCCGAAA TCATTTCCACGTTTTCCAGGAAAAAATTATTCGGTTATCCGGCGATGGTTGCTGCGATGGCAGTTATTTCCTTACTAAGC TTCCTTGTTTGGGTCCATCACTTCTTCACAATGGGATCCGGGGCGCTCGTTAACTCCTTCTTCTCGATTACGACGATGAT GATTGCGATACCAACTGGGATTAAAATATTCAACTGGCTCTTTACGATGTATAAAGGGCGAATAACCTTCACAACCCCAA TGCTTTGGTCGCTTGCTTTTATCCCTAACTTTGTTGTAGGTGGGGTAACAGGGGTTATGCTTGCGATGGCTGCGGCCGAC TATCAATATCACAATACGTACTTCTTAGTTTCGCATTTCCACTACGTATTAATCGCCGGAACCGTGTTCTCCTGCTTTGC CGGGCTTACATACTGGTATCCAAAAATGGTCGGTTACAGATTAAATGAAAAAATTGGTAAATGGTTCTTCTGGATTTTCG TTGTTGGGTTTAACGTTTGTTTCTTCCCACAATATTTCCTAGGACTTGATGGTATGCCTCGTCGTATTTACACTTATGTA CAAGGTGATGGCTGGACTACGCTTAACTTCATTTCCACAGTTGGTGGATTCTTGATGGGTATAGCATTCCTAGTTCTTTG TTATAACATTTACTATAGCTATAAAAACTCAAAACGAGAAGTTACTGGTGACCCGTGGGATGCACGTACGCTTGAATGGG CTACAAGTTCTGCTGTTCCGCCAAAATATAACTTTGCTGTTTTACCAGAATGGAATGATTTAGATGATTTCTGGAATAGA AAACAAAAAGGAAATCCATATGTGAATGATAAAAATTATAAACCAATTCATATGCCAAGTAATACAATGGTTGGGTTTGT GATGTCCGTTTTCTTCTTCATTGCCGGCTTTGGTCTAGTATTCTACTGGTATTGGTTAGGAATTATTGGTCTAATTGGGA TTTTGGGATGTATGGTTTATCGTTCATTCCAAAACAATGATGGCTATCACGTTGAAGTGGATGAAATTAAAGCAACCGAA GAACACAATGCGCGCGAACTTGCGACTGGTGTAAAGGAGGGTAACCCATGGAATCTGTAG Protein sequence : MKWNEFIVTGDPMILGAQISIVLASVGIVVLLTYTKKWKWLMKEWISSVDHKKIGIMYLLAAVLMFFRGGVDALMMRTQL ALPDMKFLDAQHYNEVFSTHGTIMILFMAMPFIIGLMNIAVPLQIGARDVAFPFLNNLSFWTFFMGAMLFNLSFVIGGSP DAGWTNYAPLATDFSAGYGINFYLLGVQIAGIGTLMTGINFFVTILRMRTKGMTLMKMPMFTWSSLITSLIIIFAFPVLT VALALMSFDRLFGTAFFTLTNGGLPMMWANLFWVWGHPEVYIVILPAFGIFSEIISTFSRKKLFGYPAMVAAMAVISLLS FLVWVHHFFTMGSGALVNSFFSITTMMIAIPTGIKIFNWLFTMYKGRITFTTPMLWSLAFIPNFVVGGVTGVMLAMAAAD YQYHNTYFLVSHFHYVLIAGTVFSCFAGLTYWYPKMVGYRLNEKIGKWFFWIFVVGFNVCFFPQYFLGLDGMPRRIYTYV QGDGWTTLNFISTVGGFLMGIAFLVLCYNIYYSYKNSKREVTGDPWDARTLEWATSSAVPPKYNFAVLPEWNDLDDFWNR KQKGNPYVNDKNYKPIHMPSNTMVGFVMSVFFFIAGFGLVFYWYWLGIIGLIGILGCMVYRSFQNNDGYHVEVDEIKATE EHNARELATGVKEGNPWNL |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 6e-90 | 45 |