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Name : i-inlJ (LIV_1182) Accession : YP_004854954.1 Strain : Listeria ivanovii PAM 55 Genome accession: NC_016011 Putative virulence/resistance : Virulence Product : putative internalin J Function : - COG functional category : S : Function unknown COG ID : COG4886 EC number : - Position : 1237700 - 1239040 bp Length : 1341 bp Strand : + Note : - DNA sequence : TTGAGAAAAAAAGAATGGTTAAAAAAAGTATTACGGGCACTTTTACTAACATTTATTGTGGCGTGTTTGAACACAAGTTT AGGAACGAAGGTAAATGCCGCAAGTATTCCACATCCTATGCCTATAGATAAGGTTTTTCCAGATCCTAGTCTAGCGAATG AAATGAAAATAACGTTAGGAAAGAAAAGTGTAACAGATGTCGTCACTCAAAAAGAATTAGAATCGAAAAACGAGTTCAAT GCAGCTCATAAAAATATTCAATCGATTGAAGGGTTGCAGTATTTAACTAATTTAGAAGTGCTGTATTTGTCCGGGAATCA AATAACAAGTATTAGCCCTTTAAAAAGCTTAAAAAAATTAGTCGTATTAAATTTGGATGCAAATGAGTTAAGTGACATAA GTGATATAACTAAATTCTCAAGCTCGAGTGCGTTAACACACTTATTTTTGAATAATAATCAGCTAACAGATATTAGTGCA TTAGCTAATTTAACTAATTTGGAAACTTTAGATGCAATGGATAATAAATTAAGTAGCATTCAAGCACTTGCTAGCTTGGA AAAACTAAAAATGTTGCGTTTGAGCGGAAATCAAGTAAGTGATATAACAGGTTTAGAGGGATTGAATAATTTAGAGTATG TAGAGATAATTAATCAAGAATGCATAAATGAACCCATATGCTATCAGCCTTTCTTAATTATCCCCAATACTATCAAAACT TTGGAAGGAAAGCTTATTGCACCAAAAAAAATTAGGAATAATGGTAAATATGCTCAGGAGAATGTCCAGTGGGTATTATC TAGTTATGTTGATGAAGTAAGTTACACATTTGATGAGCTTATAAGAATTGGAAAAACACGCGCCAAATTCCATGGAAGAG TAATACAGCCATTAGAACGAAAGAAACTATTTATTGACAATCTAAAGTCTATCAAAGAAATTTTTCCAGATGCAAATCTA GCAGAAATCCTTAGAAGAGCTTTAAAGAAAAAGCATGTTACGGATCTAGTTTCGCAACATGAATTGGACAAAATAAAAGA AGTTCACGCAGATGATAGAGATATTACTTCCATTGAGGGACTGCAATATTTATTTAATTTAAATAAACTTTATTTAGCTG ATAACCAAATAAGCGATATTCGTTCTTTAGAAGTATTAACTAATTTAAAAGAATTATATTTAGATAATAATGGTTTAACA GATAAGAGCGTTAGTGGACTTATCAACTTAGCGCACTTAAACACACTCTCTATTAGAGATAATAAAGTGAGTGGAGCAAT GGCTAGAAATTTAATGAACAATTTAACCAAACTAAAAGATTTTAATTGGTGTGAACAATAA Protein sequence : MRKKEWLKKVLRALLLTFIVACLNTSLGTKVNAASIPHPMPIDKVFPDPSLANEMKITLGKKSVTDVVTQKELESKNEFN AAHKNIQSIEGLQYLTNLEVLYLSGNQITSISPLKSLKKLVVLNLDANELSDISDITKFSSSSALTHLFLNNNQLTDISA LANLTNLETLDAMDNKLSSIQALASLEKLKMLRLSGNQVSDITGLEGLNNLEYVEIINQECINEPICYQPFLIIPNTIKT LEGKLIAPKKIRNNGKYAQENVQWVLSSYVDEVSYTFDELIRIGKTRAKFHGRVIQPLERKKLFIDNLKSIKEIFPDANL AEILRRALKKKHVTDLVSQHELDKIKEVHADDRDITSIEGLQYLFNLNKLYLADNQISDIRSLEVLTNLKELYLDNNGLT DKSVSGLINLAHLNTLSIRDNKVSGAMARNLMNNLTKLKDFNWCEQ |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| i-inlJ | CAC20607.1 | internalin J | Virulence | LIPI-2 | Protein | 1e-180 | 99 |
| i-inlD | CAA68916.1 | internalin D | Virulence | LIPI-2 | Protein | 1e-58 | 47 |
| i-inlG | CAC20610.1 | internalin G | Virulence | LIPI-2 | Protein | 2e-61 | 42 |
