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Name : LSA_08440 (LSA_08440) Accession : YP_004841182.1 Strain : Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 Genome accession: NC_015978 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism COG ID : COG0624 EC number : - Position : 814405 - 815556 bp Length : 1152 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAAAAAAGAAGAGAAAATTAAAATTTTACAAGATTTAGTGAAAATTAATTCAGTTAATGGTAATGAAAGAGAAATTTC AGATTACCTTTCTAATTTACTAAATAAGTATGGAATTAAACATGAAATCTTCCCCTTTGTTGATGATGAAAATCGTTCAA ATTTAATTGTCGAAATTGGAGAAGGAAGAACAGATCAGGTTTTTGGACTAACAGGACATCAAGATACGGTTGCGGTGACA GATGAGTCAGCTTGGAAATATTCGGCATTTTCTGGCACAATTGAAGGCGACTTTTTATATGGTCGTGGGGCTGCTGACAT GAAAAGTGGTTTAGCAGCAGAAGTGATTGCGCTAATTGAATTAGTTGAAAAACAACAAATTCCATCCGGAAAAGTTAGAT TAATTATTACAGCAGGAGAAGAATTTGGTGCACCAGGAGCTTACAAGATTAATCCTAAATTAATTGAAGATTTGGATGCT TTGATTATGGGTGAAGCTACAAATGGAAACGTTAAGTATGCTCATTCGGGTAGCTTTAATTATCGGATAAACAGCATTGG AAAATCCGTGCATAGTTCGGTGCCTAACCAAGGTATTAATGCAATTGAAGGACTTGTAGCATACATTAATGATGAAGGAC GCGTTTTTAGCGATTTACCAGTTGATGAAATTTTAGGTAATGTTCAACATAGTATTACTGTAATTGAGGGTGGAAAACAA ATTAATACAATTCCCGGACATGCATATTTGTTAGGTAATGTTCGACCTACGCCAACATTTAATAACAAACAAGTTCGTTC TTTAATTGAAAAAACAATTACTAAAATTAATCAGGAAACCGATTACCAATTAAAATTTGAATTATTACATGATTTTTATC CAATTCGTACATTAACTAATAACTCTTTGGTTGAAAATGCATATCAAGCTTCAAAAGAGTTCTATCCTGATCGTGATATT AAGCTCTTTACAGATAATGGTGCAACTGATGCTAGTGTCTTTGTTCAAATTAAACCGGATTTACCAGTTATTATTTTAGG TCCAGATTCAAACGGTTCTGCTCATCAAATTAATGAGCATACGTCACTTAGTAGCTATTTAGCAACAATTGATATCTATC AAAAAATTATTAATGAATTTTTTGCAAACTAA Protein sequence : MKKEEKIKILQDLVKINSVNGNEREISDYLSNLLNKYGIKHEIFPFVDDENRSNLIVEIGEGRTDQVFGLTGHQDTVAVT DESAWKYSAFSGTIEGDFLYGRGAADMKSGLAAEVIALIELVEKQQIPSGKVRLIITAGEEFGAPGAYKINPKLIEDLDA LIMGEATNGNVKYAHSGSFNYRINSIGKSVHSSVPNQGINAIEGLVAYINDEGRVFSDLPVDEILGNVQHSITVIEGGKQ INTIPGHAYLLGNVRPTPTFNNKQVRSLIEKTITKINQETDYQLKFELLHDFYPIRTLTNNSLVENAYQASKEFYPDRDI KLFTDNGATDASVFVQIKPDLPVIILGPDSNGSAHQINEHTSLSSYLATIDIYQKIINEFFAN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| dapE | CAA07459.1 | succinyl-diaminopimelate desuccinylase | Not tested | Internalin | Protein | 2e-66 | 42 |
| unnamed | CAC20637.1 | - | Not tested | Internalin | Protein | 6e-67 | 41 |
