|
Name : polA (LSA_06120) Accession : YP_004840967.1 Strain : Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 Genome accession: NC_015978 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : 2.7.7.7 Position : 599386 - 602085 bp Length : 2700 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGACCGAAAAAAAACTTTTATTAATTGATGGGAATTCATTAACTTATAAGGCATTTTTTGCTTTATATACCTCAATGGA TAGATTCACTAGTCCAGACGGATTACATACAAGTGCGGTTTATGGATTTAATCGGATGTTAAATGATATCTTAGCTGATA TCAAACCAACAACTGTTTTAGCAGCATTTGATGCTGGTAAAAAGACCTTTCGAACAAAAATGTATTCTGATTATAAAGCA GGCCGAGCAAAAATGCCTGACGAGTTGAGGGAACAATTTCCTTATGTGATGGATTTGCTAAAAGCTCGAGGAATCAAAAC TTATGAATTAAAAGATTATGAAGCTGATGATATTATCGGTACAACGGCTAAGATAGCTGAAAAAGAGGGTTATCACGTTG ATATTATTACTGGAGACCGCGATTTAACTCAACTTTGTTCTGAGAAAACAACCGTTAAAGTTTCCAAAAAAGGGGTCAGT GATCTTGAAGATTATACACCGACCTATGTAAAAAAGAATATGGGTATAAATCCTGAACAAATTATTGATATTAAGGGACT TCAAGGTGATACTTCTGATAATTATCCAGGTGTAGAAAAAGTTGGTCCGAAAACAGCAATTAAATTAATTAAACAGTATG GTACGGTTCAGGGTCTTTATGACCATATTGATGAAATTACGGCTAAAAAATTAAAAGAACATTTGGTAAACGATGAGAAG CAAGCATTTCTTTCAAAGAAATTAGCTACAATTGATACTAACGCACCAATTGATATTAAACTTGCTGATTTAATTTACAA GGGTCCACAAGAACCAGAATTATCTGATTTTTATAAAAAAATGGGATTTAAATCATTTTTGAATAGTTCAAATAATGCCG ATAATCAACTTGGAACCTCTAAAATTGAACTACCAGAAGTTGAATTTACTGAGTTAAGTAAAGAAAATCTCGATGAAGTT AATAGTTTAGGTAATGAAATAACTTTTAATCTTGAAACAATTAATCCTAACTACCATACGGCTGAACAATTAGGTTTCGT AATTGGCAATGGAAAAAAGTGGTTTGTTAGTCGCGATATGAGCTTATTATCTGATAAACGAATTAAACAAATTTTAGAAA ATAGTGAAATTAATAAAAATATTTTTGATACCAAAGCACAAATTGTTGGATTACATCGTAATGAGATTGGATTTCAAGGC GTTGATTTTGACATGCTTTTGGTCTCATATTTAATTAATACACTCAATAATGAAGATGATATCGGAGAAGTTGCTAATCG CCATGGTTATTTCGGTGTTTTATCTGATGAAGAGGTTTATGGCAAGGGAAAGAGCTTTCAAATTCCAGATAATCATGAAT TATTCGAGCATATGGTGCGAAAAGCATTAGCTATTTCAACATTAAAAAAACAAATGCTTGAAAAACTAAAAGAACATCAG CAAGCTGATTTATATCGTGATTTGGAACTTCCATTAGCTCGCGTTTTGAGTGCAATGGAGATTCAAGGAATTAGTGTTAA TCAAGATAAATTAGAAGAATTAAAAAGTAAATTTACTGAACGAGTTAGTGAATACAAACAAAAAATCTATCAAGAGGCCG GTGAAGAGTTTAATATTGGCTCACCCAAACAATTAGGAATTGTGTTATTCGAAAAAATGGGGCTTCCAGTTATTAAAAAA ACTAAGACTGGTTACTCAACCGCAGTTGATGTTTTAGAACAATTAGCCCCAGATCATCCAATTATTGAAAATATTCTTAA TTATCGTCAATTAACTAAATTAATTTCTACGTATTTGGACGGAATTAAAGCTGATATTACGGATGATGGTAAGGTGCACA CACGATACTTGCAAACCTTAACGCAAACTGGTCGATTATCATCCGTTGACCCTAATTTACAAAACATTCCCGTTCGAACT GAAGAAGGCCGTAAGGTTCGTGAAACTTTTGTTCCTAGTCATAAAGGGTGGAAATTGTTTTCTTCTGATTATTCTCAAAT TGAATTACGTGTTTTAGCTGCGATTTCTGGCGATAAAAATATGCGAGAGGCTTTCGAAAGTGGAGAAGATATTCATGCAG CCACCGCTCGTAGAATATTTGAATTGGATAAAGATGCTGTAATCACACCAACTTTAAGACGACAAGCCAAAGCGGTTAAC TTTGGAATTGTGTATGGAATTAGTTCGTTTGGATTAGCGCATAATACCGGGATTTCAAATGGTGACGCTAAACGGTTCAT TGACAAATATTTTAATGAATACCCTGGTGTTAAGCAATATATGGAAGATTCAGTTAAATTTGCCAAAGAACATGGATATG TTGAAACTATTTCCCATCGCCGACGCTACATTCCAGAAATTCAGTCCAAACGTTTTCAGCAACGTCAATTTGCCGAACGA ATTGCGATGAATTCTCCCATCCAAGGAAGTGCAGCTGACATAATTAAGGCGGCAATGATTAAAATGCAATCTGTTTTAAA AGAAAAAGGATTACAAGCTAAGATGCTTTTACAAATTCATGATGAGCTAATTTTTGAAGCACCAGAAACAGAAATCCCAG TTTTAGAAAAGTTAGTACCACAAGTGATGGACTCAATTATGAAGACAGACAAATTACTCAGTAATTCAACTGTTGATTTT AATGTTCCATTAAAGGTTGAAAGCCATCCTGGATCAGATTGGTATAATATAAAAAAATAA Protein sequence : MTEKKLLLIDGNSLTYKAFFALYTSMDRFTSPDGLHTSAVYGFNRMLNDILADIKPTTVLAAFDAGKKTFRTKMYSDYKA GRAKMPDELREQFPYVMDLLKARGIKTYELKDYEADDIIGTTAKIAEKEGYHVDIITGDRDLTQLCSEKTTVKVSKKGVS DLEDYTPTYVKKNMGINPEQIIDIKGLQGDTSDNYPGVEKVGPKTAIKLIKQYGTVQGLYDHIDEITAKKLKEHLVNDEK QAFLSKKLATIDTNAPIDIKLADLIYKGPQEPELSDFYKKMGFKSFLNSSNNADNQLGTSKIELPEVEFTELSKENLDEV NSLGNEITFNLETINPNYHTAEQLGFVIGNGKKWFVSRDMSLLSDKRIKQILENSEINKNIFDTKAQIVGLHRNEIGFQG VDFDMLLVSYLINTLNNEDDIGEVANRHGYFGVLSDEEVYGKGKSFQIPDNHELFEHMVRKALAISTLKKQMLEKLKEHQ QADLYRDLELPLARVLSAMEIQGISVNQDKLEELKSKFTERVSEYKQKIYQEAGEEFNIGSPKQLGIVLFEKMGLPVIKK TKTGYSTAVDVLEQLAPDHPIIENILNYRQLTKLISTYLDGIKADITDDGKVHTRYLQTLTQTGRLSSVDPNLQNIPVRT EEGRKVRETFVPSHKGWKLFSSDYSQIELRVLAAISGDKNMREAFESGEDIHAATARRIFELDKDAVITPTLRRQAKAVN FGIVYGISSFGLAHNTGISNGDAKRFIDKYFNEYPGVKQYMEDSVKFAKEHGYVETISHRRRYIPEIQSKRFQQRQFAER IAMNSPIQGSAADIIKAAMIKMQSVLKEKGLQAKMLLQIHDELIFEAPETEIPVLEKLVPQVMDSIMKTDKLLSNSTVDF NVPLKVESHPGSDWYNIKK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 50 |
