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Name : secA (LSA_05080) Accession : YP_004840881.1 Strain : Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 Genome accession: NC_015978 Putative virulence/resistance : Unknown Product : protein translocase subunit secA Function : - COG functional category : U : Intracellular trafficking, secretion and vesicular transport COG ID : COG0653 EC number : - Position : 495330 - 497693 bp Length : 2364 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGCGAATGTATTAAAAAAATGGGTTGAAAGCGACAAACGTCGTGTTAAACAACTCGGAAAAATTGCTGATCGTGTAAG TGCTTATGCAGAGCAATACAGTAAGTTAAGTGATGAACAATTACAAGCAAAAACTGCAGAATTTCAAAAACGCTACCAAG CTGGTGAATCACTAGATGATTTACTTCCAGAAGCGTTTGCAGTAGCCCGTGAAGGTGCTCATCGAGTACTTGGATTAACG CCTTTTAAGGTTCAGATAATGGGTGGAATTGTGCTTCATGAAGGTAATATTGCCGAAATGAAGACTGGAGAAGGAAAAAC TTTGACAGCTACAATGCCCGTATACTTGAACGCTCTTTCAGGTAAAGGGGTACACGTGGTTACAGTTAACGAATACCTTT CAGAACGTGATGCCGAACAAATGGGACAACTTTATAACTGGTTGGGTCTAACTGTTGGGGTTAACAAATCAGATATGAGC CCAGAAGAAAAACGGGCTGCTTATAATGCTGATATCACTTACTCAACTAATAGTGAAATTGGATTTGATTACCTTCGTGA CAACATGGTTGTTTATGAAGAAGACCGGGTTCAACGTCCTTTGAATTTTGCGCTAGTTGATGAAGTTGATTCAATTTTAA TTGATGAAGCTCGTACTCCATTAATTATTTCTGGACAAGCTCGTGGTGCAAATGAAATGTACAAACAAGCTGACCAATTT GCCAAGACTCTAAAGGCAACAACTGACTATAAGGTTGATTTGGAAACTAAGACAGTTTCATTAACGGAAACTGGAATTCG TAAAGCTGACAAATTCTTCAACTTAAAAAACATTTATGATACTGATAACACCGCCTTAACTCATCATATTGATCAAGCTC TTCGGGCTAACTATGTCATGGAACTTGATAAAGATTATGTGGTTAAAGATGATGAAGTTTTAATCGTTGATTCCTTTACT GGACGGATTATGGAAGGTCGTCGGTTCTCTGATGGTCTTCATCAAGCGCTTGAAGCAAAAGAAGGCGTTACGATTCAAGA AGAAAGTAAGACAATGGCTAACATTACTTACCAAAACTTGTTTAGACGTTATCGTAAGCTTGCCGGAATGACTGGTACTG CTAAGACAGAACAAGAAGAATTCCGTGAAATTTACAATATGAATGCTGTTTCAATTCCTACTAACAAACCAGTTGTTAGA ATTGATGAATCTGACGTTCTTTACCCAACCTTACAATCAAAATTTGATGCTGTAATTGATAAAGTCAAAGAATTACATCA TCGTGGACAACCAATTTTGTTAGGAACGGTTGCTGTTGAAACATCGGAATACCTTTCTCAACGTTTGGATCAAGAAAAAA TTCCACATGTTGTTTTGAATGCTAAAAACCATGCTAAAGAAGCGGATATTGTTGCTAATGCTGGTCAAAAAGGTGCAGTT ACGATTGCTACCAACATGGCTGGTCGTGGTACTGATATCAAACTTGGACCTGGCGTAATTGAAGTTGGTGGATTAGCCGT AATTGGTACTGAACGTCATGAATCACGAAGAATTGATAATCAACTTCGGGGACGTGCTGGTCGTCAAGGTGATCCAGGTT ATTCACAATTCTACCTTTCACTTGAAGATGATTTGATGCGTCGTTTTGGTTCTGACAGAATCAAGAATGTTTTGAAGACA CTTAAAGTTGAAGATGATGATGCTGTAATTCGGAGTCGAATGATTACCAAACAAGTTGAATCAGCTCAAAAACGAGTTGA AGGTAATAACTACGATTCACGGAAAAACGTTTTGAAGTATGATAACGTCATGTCAGAACAACGTGATGTGATTTATGGCG AACGTAATCGAGTTATTGAAGAAAAGAAATCGTTGAAGTGGGTGCTTATGCCTATGATTAAACGAACGATTGATCATATT GTCGATTTACATACTCAAGGCGATCAAAAGAATTGGAATTTACAAACCATCCTTGGTTTTGCCACTAGTTCATTAGTTAG TCCTAATGAAATTAGTATGAATATGTTAGAAGGTAAGTCTGCAGATCAAATTAAAGAATTTTTGATGGGATTAGCAGAAA AACAATATGTAGAAAAAGAAAAAGAACTTCAAGATCCAGCTCAAGTGCTTGAATTTGAAAAAGTAGTTATTTTACGAGTG GTAGATTCTCACTGGACTGATCATATTGATGCAATGGACCAATTACGTGAATCAATTGGTCTTCGTGGCTACGGTCAATT AAACCCATTAGTTGAATATCAACGTGAAGGATCACGGATGTTCGAAGAAATGGTTGCTGACATTGATTACGGGGTAACTC GTTTATTCATGAAAGCTGAAATTAGACAAAATATTCAAAGATAA Protein sequence : MANVLKKWVESDKRRVKQLGKIADRVSAYAEQYSKLSDEQLQAKTAEFQKRYQAGESLDDLLPEAFAVAREGAHRVLGLT PFKVQIMGGIVLHEGNIAEMKTGEGKTLTATMPVYLNALSGKGVHVVTVNEYLSERDAEQMGQLYNWLGLTVGVNKSDMS PEEKRAAYNADITYSTNSEIGFDYLRDNMVVYEEDRVQRPLNFALVDEVDSILIDEARTPLIISGQARGANEMYKQADQF AKTLKATTDYKVDLETKTVSLTETGIRKADKFFNLKNIYDTDNTALTHHIDQALRANYVMELDKDYVVKDDEVLIVDSFT GRIMEGRRFSDGLHQALEAKEGVTIQEESKTMANITYQNLFRRYRKLAGMTGTAKTEQEEFREIYNMNAVSIPTNKPVVR IDESDVLYPTLQSKFDAVIDKVKELHHRGQPILLGTVAVETSEYLSQRLDQEKIPHVVLNAKNHAKEADIVANAGQKGAV TIATNMAGRGTDIKLGPGVIEVGGLAVIGTERHESRRIDNQLRGRAGRQGDPGYSQFYLSLEDDLMRRFGSDRIKNVLKT LKVEDDDAVIRSRMITKQVESAQKRVEGNNYDSRKNVLKYDNVMSEQRDVIYGERNRVIEEKKSLKWVLMPMIKRTIDHI VDLHTQGDQKNWNLQTILGFATSSLVSPNEISMNMLEGKSADQIKEFLMGLAEKQYVEKEKELQDPAQVLEFEKVVILRV VDSHWTDHIDAMDQLRESIGLRGYGQLNPLVEYQREGSRMFEEMVADIDYGVTRLFMKAEIRQNIQR |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secA2 | YP_006310687.1 | preprotein translocase subunit SecA2 | Not tested | FWisland_3 | Protein | 7e-151 | 43 |
