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Name : nrdE (LSA_04690) Accession : YP_004840849.1 Strain : Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 Genome accession: NC_015978 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG0209 EC number : 1.17.4.1 Position : 461327 - 463495 bp Length : 2169 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGTCGCTAAAAGACCAAACTGATGTTAGTTATTATAGATTAAATAACGAGATCAACATCCCATCAAAAGATGGAAAAAT TAGACTAGAAAAAGATAAAGAAGCCCTAGATGCTTTTATTAAAGAAAACGTGATTCCTAATACCGTAAAGTTTGATTCTT TAAAGGATCGTTTGGATTACTTAACTAAAAATAACTACATTGAAGCTAGCTTTTTAGAAAAGTATCCTTTTTCATTTATT GAAAAACTTTACCAATACTTAGAGGATCAACATTTTACCTTTAAATCATTTATGGCTGCCTATAAATTTTATGCACAATA TGCCTTAAAAACAAATGATGGTAATCAATATCTTGAAAGATACATTGATCGGACTGCAATGAACGCCCTCTTTTTAGCTG ACGGTGATCAAGAATTAGCAATGCGTTTAGCTGATGAATTAATTCACCAACGTTTCCAACCAGCTACGCCAACTTTCTTA AACGCTGGAAAAAAACGGCGTGGAGAATTAATTTCATGTTTCTTAATCCAAACTACTGATGATATGAATAGTATCGGAAG AACCATTAATTCGGCCTTACAACTCTCTAAAATTGGTGGAGGTGTAGGAATTAACCTTTCTAACCTTCGTGCTGCTGGAG ATCCAATTAAGCACATTCAAGGCGCTGCTAGTGGAGTAATGCCAGTCATGAAACTGTTAGAAGACAGTTTTACCTACTCA AATCAATTAGGTCAACGTCAAGGTGCTGGTGTTGTTTATCTTAGTGTCTTTCATCCTGATATTATTGACTTTCTTTCAGT TAAAAAAGAAAATGCTGATGAAAAAATTCGAGTTAATACCTTATCTTTAGGACTAACCGTTCCTGATAAGTTTTATGAAC TTGCTAAAAATGATCAAGATATGTATCTCTTTAGCCCTTATGATGTGGAAAAAGAATATGGAGTTCCATTCTCTTACGTT GACATCACTAAAGAATATGACAATTTAGTTGCTAACGAAAACATCCGCAAGAAAAAAATGAAGGCTCGTGATTTAGAAAC CGAAATCGGTAAATTACAACAAGAATCCGGTTATCCTTACATCATGAACATTGATACTGCTAACCGGGAAAACCCAGTTG CCGGTAAAATTGTCATGAGTAACTTGTGTTCTGAAATTATGCAAGTGCAAACCCCATCAATCATTAATGACTTGCAACAG TATGACCAATTAGGGACTGATATTTCATGTAACCTAGGTTCAACAAACGTCGTTAATTTGATGAAATCAGATGATTTTGG TGAATCTGTTGACACAATGGTGCGTGCCTTAACCTACGTGACCGATGAAAGTAAAATTGATGTTGTTCCTTCAATTAGAA GAGGAAATGATTTAAGCCATTCGATTGGACTTGGTGCCATGGGTCTTCACTCATTTCTCGCTTTAAATCATATGTATTAC GGTTCGCCTGAATCAATCGAATTTACTGGTGTTTACTTTATGCTCTTGAACTACTGGACTCTAGTTGCATCTAACAAGAT TGCTAAAGAACGCGGTAAGTCATTCCATAACTTTGAAAACAGTAAATATGCAGATGGTACTTATTTTGATAAGTACACCG CCAAAGATTGGGGTCCCCAATCAGAAAAAGTTAAGGGCCTCTTCAAGGGTACCTTTGTGCCTTCTGAAAAAGACTGGGAA GAGCTTAAGAAGTCAGTTATGACTTATGGTTTATATCATCAAAACCGGATGGCAGTTGCTCCTAATGGTTCAACAGCCTA CATTGGTGACGCTACCGCAAGTATTGCCCCAATCGTTAGTCGAATTGAAGAACGACAAGATGCTAAAATTGGAACAATTT TTTATCCCGCTCCTTACCTTTCAAACGATACCCTTCCATATTATGAATCAGCTTATGATATTGATATGCGTAAAGAAATC GATATCTTTGCTGAAGCCCAAAAACACGTTGATCAAAGTTTAAGTATGACCCTCTTCATGCGTTCTACCATTCCTGAAGG GATGTACGAATGGAAAAATGGTCGTGATCCAAAGATGTCAACACGTGATTTAACAATCTTAAGAAATTATGCTTACCATA AAGGCATTAAATCAATTTACTACGTTAGAACTTTCACTGATAACAACGACACAGTTGGTGCTAACGAATGTCAAAGCTGT GTCATTTAG Protein sequence : MSLKDQTDVSYYRLNNEINIPSKDGKIRLEKDKEALDAFIKENVIPNTVKFDSLKDRLDYLTKNNYIEASFLEKYPFSFI EKLYQYLEDQHFTFKSFMAAYKFYAQYALKTNDGNQYLERYIDRTAMNALFLADGDQELAMRLADELIHQRFQPATPTFL NAGKKRRGELISCFLIQTTDDMNSIGRTINSALQLSKIGGGVGINLSNLRAAGDPIKHIQGAASGVMPVMKLLEDSFTYS NQLGQRQGAGVVYLSVFHPDIIDFLSVKKENADEKIRVNTLSLGLTVPDKFYELAKNDQDMYLFSPYDVEKEYGVPFSYV DITKEYDNLVANENIRKKKMKARDLETEIGKLQQESGYPYIMNIDTANRENPVAGKIVMSNLCSEIMQVQTPSIINDLQQ YDQLGTDISCNLGSTNVVNLMKSDDFGESVDTMVRALTYVTDESKIDVVPSIRRGNDLSHSIGLGAMGLHSFLALNHMYY GSPESIEFTGVYFMLLNYWTLVASNKIAKERGKSFHNFENSKYADGTYFDKYTAKDWGPQSEKVKGLFKGTFVPSEKDWE ELKKSVMTYGLYHQNRMAVAPNGSTAYIGDATASIAPIVSRIEERQDAKIGTIFYPAPYLSNDTLPYYESAYDIDMRKEI DIFAEAQKHVDQSLSMTLFMRSTIPEGMYEWKNGRDPKMSTRDLTILRNYAYHKGIKSIYYVRTFTDNNDTVGANECQSC VI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 52 |
