Name : LSA_04410 (LSA_04410) Accession : YP_004840821.1 Strain : Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 Genome accession: NC_015978 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : K : Transcription COG ID : COG2183 EC number : - Position : 434523 - 436706 bp Length : 2184 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATTGGAGGTAACGGAGTGGAAAAAGAAATTATTAAACAAGTTAGTCAGGACCTTTCTGACATAAACCAACATCAAATCGA AACAACTTTATCGTTACTAGATGAAGGTAATACGGTTCCGTTTATTGCCCGTTATCGTAAAGAAAGAACGGGGAGCCTTG ATGAAGTACAAATTCGCGACATTCAAGATACCTATCAACGCTTATTAAAACTTAGTAATCGTAAAATTGATGTAATTAAC AAAATTGCAGAACAAGGAAAATTAACTGATCAATTACAAAACCAAATTAAAGCAGCTAGTGATATTCAGGTAGTTGAAGA TTTATACCTTCCTTATAAACAAAAACGGAAGACGAAAGCAATGCTTGCCGACGAACAGGGATTAACTCCGTTAGCTAATC AAATGATGAAGTTCCCAAGCCAAAGTCCAGAACAGTTAGCTGAAAGTTACGTTAATCCGGCAGTTGGATTGAATGACGTT ACCGAAGTTTTAAGTGGGGTAGCTGATATTATTACTCAATCAGTTGCTGATGTAGCAATTTTTCGTGAATGGATTCGAAA TTACACGGAAAAAAATGGATTAATTGTGACTAAGTTGAAAAGTAAGGCGGATGAACTTGATGAAAATCAAGTTTATGCAA ATTACTATGACTTTTCTGAAACCATTAAAACAATTCCTTCTTTTCGGGTGCTAGCGATTAACCGTGGGAAAAAACAAAAG ATTTTACAAGTTAAAATTGATGTTAACGAAGATGCTATTTTGAAATACTTAAACTTTACGGTAATTGGCAAACATATGGG ATCAGTAGCTGACTTTGTCGCAGATGCAGTTAAAGAAGCCTATCGAAAATCAATTCGGCCAGCAATTACTCGTGATGTTC AAGCAAAATTGACGGAAACTGCTGAGGAACACGCCATTGAAGTTTTTGGAAAAAATCTTTATCATCTTTTAATGCAAGCA CCAATTAAAGGAAAAGTAACTCTAGGTTTTGACCCCGCTTATCGAACTGGATGTAAATTAGCCATTATGGATAAAAATGG TAAATTTTTGCATAAACAAATTATTTTCGCAACTAAGCCAGCTAGTGAAGCAAAAATTACTCACGCTAAACAACAATTCA TCGATTTAATTAATCAATATCATGTTGAAATGGTGGCGATTGGGAATGGAACCGCGTCACGTGAGTCCGAATTATTTGTA GCAGATGCACTCAAGGCAATTGAGTTTCCAGTTCACTATGTGATTGTGAATGAATCAGGAGCTTCCGTTTATTCTGCTAG TTCCAATGCACGAAAAGAATTCCCAGATTTATATGTTGAGGAACGTTCCGCCATTAGTATTGGTCGGCGTTTGCAAGATC CATTAGCCGAATTAATTAAAATTGATCCAAAAGCAGTTGGAGTTGGTCAGTATCAGCATGATGTTTCAGAGACACATTTA GATAAACAACTAGATCGAGTAGTAGAAACAGCGGTTAACCAAGTTGGAGTAAACTTGAATACAGCGAGTGTTGAATTACT GGAACATATTTCTGGATTATCAGCAGCAATTTCACAAAATATTGTTGATTATCGAGAAGAAAATGGTAGTTTTACAAATC GGAAACAACTAAAAAAGGTAAAACGACTTGGACCCAAAGCCTATGAACAATCGGTTGGATTTTTACGGATTATTGGTGGT AATAATCCACTAGATAATACTGATATTCATCCTGAGAGTTATGATCAAGCCCAATCTATTTTACAAGCACTTGATTTATC AGTTGATCAATTAGGGACGGATGTAGCTATTCAAAGTCTAAATAATGTTAATCCAAGTGAATTAGCAAATAAACTAGATT TAGATGAACAACTAACAGTTGATTTGCTAAACGGATTAAAAAATCCAGGACGTGATTTACGTGATCAAATGCCTGCACCA TTATTGAAATCAGATGTAATGAAAATTGATGATTTAAAGCCTGGAATGAAATTACAAGGAACGGTTCGTAATGTAATTGA TTTTGGGGCGTTTGTGGATGTTGGTGTAAAGCAAGATGGCTTAGTTCATATTTCACACATGAGTAATAAATTCATTAAAG ATCCAGCAATGATTGTTTCAGTTGGTGATATTGTAGATGTTTGGGTACTGTCAGTTGATATAGATCGGAAACGAATCCAA TTATCTATGATAGAACCGGAATGA Protein sequence : MGGNGVEKEIIKQVSQDLSDINQHQIETTLSLLDEGNTVPFIARYRKERTGSLDEVQIRDIQDTYQRLLKLSNRKIDVIN KIAEQGKLTDQLQNQIKAASDIQVVEDLYLPYKQKRKTKAMLADEQGLTPLANQMMKFPSQSPEQLAESYVNPAVGLNDV TEVLSGVADIITQSVADVAIFREWIRNYTEKNGLIVTKLKSKADELDENQVYANYYDFSETIKTIPSFRVLAINRGKKQK ILQVKIDVNEDAILKYLNFTVIGKHMGSVADFVADAVKEAYRKSIRPAITRDVQAKLTETAEEHAIEVFGKNLYHLLMQA PIKGKVTLGFDPAYRTGCKLAIMDKNGKFLHKQIIFATKPASEAKITHAKQQFIDLINQYHVEMVAIGNGTASRESELFV ADALKAIEFPVHYVIVNESGASVYSASSNARKEFPDLYVEERSAISIGRRLQDPLAELIKIDPKAVGVGQYQHDVSETHL DKQLDRVVETAVNQVGVNLNTASVELLEHISGLSAAISQNIVDYREENGSFTNRKQLKKVKRLGPKAYEQSVGFLRIIGG NNPLDNTDIHPESYDQAQSILQALDLSVDQLGTDVAIQSLNNVNPSELANKLDLDEQLTVDLLNGLKNPGRDLRDQMPAP LLKSDVMKIDDLKPGMKLQGTVRNVIDFGAFVDVGVKQDGLVHISHMSNKFIKDPAMIVSVGDIVDVWVLSVDIDRKRIQ LSMIEPE |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
NMB0075 | NP_273139.1 | transcriptional accessory protein Tex | Not tested | IHT-A | Protein | 9e-135 | 43 |