Gene Information

Name : LSA_04410 (LSA_04410)
Accession : YP_004840821.1
Strain : Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304
Genome accession: NC_015978
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : K : Transcription
COG ID : COG2183
EC number : -
Position : 434523 - 436706 bp
Length : 2184 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATTGGAGGTAACGGAGTGGAAAAAGAAATTATTAAACAAGTTAGTCAGGACCTTTCTGACATAAACCAACATCAAATCGA
AACAACTTTATCGTTACTAGATGAAGGTAATACGGTTCCGTTTATTGCCCGTTATCGTAAAGAAAGAACGGGGAGCCTTG
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GCAGATGCACTCAAGGCAATTGAGTTTCCAGTTCACTATGTGATTGTGAATGAATCAGGAGCTTCCGTTTATTCTGCTAG
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TTTTGGGGCGTTTGTGGATGTTGGTGTAAAGCAAGATGGCTTAGTTCATATTTCACACATGAGTAATAAATTCATTAAAG
ATCCAGCAATGATTGTTTCAGTTGGTGATATTGTAGATGTTTGGGTACTGTCAGTTGATATAGATCGGAAACGAATCCAA
TTATCTATGATAGAACCGGAATGA

Protein sequence :
MGGNGVEKEIIKQVSQDLSDINQHQIETTLSLLDEGNTVPFIARYRKERTGSLDEVQIRDIQDTYQRLLKLSNRKIDVIN
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LLKSDVMKIDDLKPGMKLQGTVRNVIDFGAFVDVGVKQDGLVHISHMSNKFIKDPAMIVSVGDIVDVWVLSVDIDRKRIQ
LSMIEPE

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
NMB0075 NP_273139.1 transcriptional accessory protein Tex Not tested IHT-A Protein 9e-135 43