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Name : copB (LSA_03330) Accession : YP_004840717.1 Strain : Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 Genome accession: NC_015978 Putative virulence/resistance : Resistance Product : copper-transporting P-type ATPase B Function : - COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism COG ID : COG2217 EC number : 3.6.3.3 Position : 316858 - 318807 bp Length : 1950 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGATAATTTTAAACGTCGCTTTTGGATTTCCCTAATTTTGGCGATCCCAATTTTATTACTTTCACCATTTATGGGAAT TGTTTTACCATTTCAACTTACTTTTCCTGGATCACAATGGGTGGTTTTAGTCTTAGCGACGATTTTATTCTTCTATGGAG GACAACCATTCTTTAGTGGAGCCAAAGAAGAACTAAAAGCCAAGGTACCTGCTATGATGACCTTGATTTCCATGGGAATT AGTGTGGCTTACATTTACAGTGTTTATTCCTTTATTATGAATACCTTTGTAGATAAATATGTCATGGTTATGAATTTCTT TTGGGAATTAGCAAGTTTAATTGTCATCATGTTATTGGGTCACTGGATTGAAATGAGTGCCGTAATGAGTGCGGGGAGCG CGGTGAAAAAAATGGCTGCCTTACTTCCTAACACTGCCCACCTAATTCAACCAGATGGTTCGACTAAAGATGTACCCTTA AGTGACTTAATGGTTGGTGAAGAAGTCTTAGTTCAAGCCGGGGAAAAGATTCCCACTGATGGAGTGGTTGTTAAAGGAAC TAGCGCTGTTAATGAAGCTTTAGTCACTGGTGAATCAAAATCCGTTACCAAAAAGGTTGATAGCAAAGTAATTGGTGGTT CTATTAATGGTGATGGTGCGTTAATCGTTAAAGTTACGGCAACTGGTAAAAATGGATATCTTGCCCAAGTAATTGAATTA GTGGCAGATGCGCAAAAAGAAAAATCAAAAGCGGAAACTGTAGCTGATCGCGTTTCACGATGGTTATTCTACAGTGCCTT ATCAATCGGAATTTTAGCCTTAATTGTTTGGACAATTATCAGTGGCTTTAGTTATGGATTAGAACGGATGGTAACAGTCT TAGTAATTGCATGTCCTCATGCTTTAGGATTAGCTGTTCCATTAGTGATTGCTCGAAGTACTTCAATTGCTGCGCAAAAT GGTTTGTTAATTAGAAATCGTCAATCAATTGAAGCAGTGAAAAAACTTAGTTACGTCTTTATGGACAAAACTGGAACCTT AACAGAAGGGGTCTTTACCGTTAATGCTTTGGAATCACTTTCTGATTTAACAAAACAGGAAGTTCTCCAAATTCTAGCTG ACCTCGAAGTCAATTCGAGTCATCCTTTAGCAGTTGGCTTAGTTCACACTGCTAAAAAAGAAGGGGTAACCGTTGTTCCA GCCCAAAACGTTGATATTATGCAAGGGATTGGAGTCAAAGGAACGATTGCTGGTAAAGACTATGCGATTGTTACCGCTGC TTATCTTAAAGCTCACAACATGGCTTATGATCAAGCCCAATTTGATAAATTAGCTGGTCAAGGTAACTCAGTTAGTTACT TGATTAGTGGTGACCAAGTCTTAGGAATTGTCGCTCAAGGAGACGTGATTCGTCCCGCTTCCTTTGAATTAGTTAAACAC CTTCGCGCCATGCACATTGTGCCAGTTATGCTAACTGGAGATAATGATTTAGCTGCCAAACGCGTCGCTCATGAATTAGG TGACATTGCTTATAAAGCTCAATTATTACCAGGTCAAAAAGAAGAAATTATTAAAGAATATCAAGCTAAAGGAAATGATG TCATGATGGTTGGTGATGGGGTGAACGATGCTCCTAGCTTGTCACGTGCTAACATCGGAGTTGCCATTGGAGCTGGAACT GACGTAGCAATTGATTCAGCCGATGTGGTTTTGGTTAAGAGTGATCCAGAAGATATCATTGATTTCATTGACCTTGCTAA AGCTACTAATCGTAAGATGATTCAAAACCTTTGGTGGGGGTCTGGTTATAACATTATTGCCATGCCATTAGCTGCCGGAG TTTTAGCACCAATTGGAATTGTTTTATCACCTGCAATCGGTGCCATTATCATGTCACTTTCAACAATTATCGTGGCAATT AATGCGTTAACATTGCATATGCGCAGATAA Protein sequence : MDNFKRRFWISLILAIPILLLSPFMGIVLPFQLTFPGSQWVVLVLATILFFYGGQPFFSGAKEELKAKVPAMMTLISMGI SVAYIYSVYSFIMNTFVDKYVMVMNFFWELASLIVIMLLGHWIEMSAVMSAGSAVKKMAALLPNTAHLIQPDGSTKDVPL SDLMVGEEVLVQAGEKIPTDGVVVKGTSAVNEALVTGESKSVTKKVDSKVIGGSINGDGALIVKVTATGKNGYLAQVIEL VADAQKEKSKAETVADRVSRWLFYSALSIGILALIVWTIISGFSYGLERMVTVLVIACPHALGLAVPLVIARSTSIAAQN GLLIRNRQSIEAVKKLSYVFMDKTGTLTEGVFTVNALESLSDLTKQEVLQILADLEVNSSHPLAVGLVHTAKKEGVTVVP AQNVDIMQGIGVKGTIAGKDYAIVTAAYLKAHNMAYDQAQFDKLAGQGNSVSYLISGDQVLGIVAQGDVIRPASFELVKH LRAMHIVPVMLTGDNDLAAKRVAHELGDIAYKAQLLPGQKEEIIKEYQAKGNDVMMVGDGVNDAPSLSRANIGVAIGAGT DVAIDSADVVLVKSDPEDIIDFIDLAKATNRKMIQNLWWGSGYNIIAMPLAAGVLAPIGIVLSPAIGAIIMSLSTIIVAI NALTLHMRR |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SH0105 | YP_252020.1 | hypothetical protein | Not tested | SCCmec | Protein | 8e-138 | 57 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| copB | YP_004840717.1 | copper-transporting P-type ATPase B | BAC0079 | Protein | 2e-172 | 57 |
| copB | YP_004840717.1 | copper-transporting P-type ATPase B | BAC0629 | Protein | 1e-135 | 49 |
| copB | YP_004840717.1 | copper-transporting P-type ATPase B | BAC0383 | Protein | 4e-137 | 49 |
