|
Name : amt (LSA_02850) Accession : YP_004840674.1 Strain : Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 Genome accession: NC_015978 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Ammonia channel Function : - COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism COG ID : COG0004 EC number : - Position : 276738 - 277937 bp Length : 1200 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATTTATTTCATGGCAACTAACATTGTGTTTATCTTTGTTTGTTCAGTATTAGTATTTTTTATGACACCAGGATTATCTTT TTTTTATGGGGGAATGGTTCCTAAGAAACAAGTTAACAATACATTGATGTCAGTTTTCATCATGTGTAGTATTCCTGTTC TATTATGGGTAATTTGTGGTTACTCACTTTCATTTTCTGGGAACAACTGGAACTTGATTGGCGATTTACATAATTTCATG TTACATAACGTTAAAATGGGTGCTGTTTCAGCATTAACGGATGGCAAATTAAATAATGTAACGTTCATTATTTTTCAAAT GATGTTTGCTGTGATTACACCAGCTTTGTTTGTAGGTGCAATTGTAGGACGGATGGACTTTAAATTTTTGATTTCATTTG TTGTTTTATGGTCAATCTTTGTTTACTATCCAATGGTACATATGGTTTGGGGTGGAGGATTTCTTCAAGGATTAGGTGCG CTAGATTTTGCTGGTGGACTAGTTGTTCACATTAATGCTGGTGTTACGGCGTTAATCTTAGCATGGTTCTTGGGACCTCG TTTAGTTAAGCAAAATGCTAGTCCAGCTAACTTAAGTTGGGTAGTTTTAGGTACTTCAATGCTTTGGGTTGGCTGGTATG GATTCAATGCTGGTTCTGCATTGAGAATGAACACGATTGCCATGCAAGCAATGCTTACTACCACAGTTGCAACGGCGACT GCGATGTTAGTTTGGATCATTTTAGATGTTTTCTTTAAGAAAAATGCTTCATTATTAGGAATTTGTTCTGGGGCAGTTTG TGGGTTAGTTGCCATCACGCCAGCCTGTGGTTACGTAACAATTACTGGATCAATGGTAATTGGGTTAGTTGCTACTTTGG CAAGTTACTTATTCATTAATAAAGTTAAGCCAATTATTAAAATTGATGATACTTTGGACGCCTTTGGTTGTCATGGAATT GCTGGAATTGTTGGAAGTATTCTAACTGGATTATTTGCTAGTAAAGCAGTTAATCCAACGATTTCAGAAAGTGGTTTTTT TGAAGGTGGATCTTTACATCTACTTGGAATTCAATTAGGAGCAACCATTTTTACCGTGATTTTCACTGTTGTAATTGTTT CAATCGTGATTTTGGGACTTAAACAAATCATCAGAATGAGAATTTCAAAAGCTGAAGAAAAACTTCGCGAATTAATGTAG Protein sequence : MYFMATNIVFIFVCSVLVFFMTPGLSFFYGGMVPKKQVNNTLMSVFIMCSIPVLLWVICGYSLSFSGNNWNLIGDLHNFM LHNVKMGAVSALTDGKLNNVTFIIFQMMFAVITPALFVGAIVGRMDFKFLISFVVLWSIFVYYPMVHMVWGGGFLQGLGA LDFAGGLVVHINAGVTALILAWFLGPRLVKQNASPANLSWVVLGTSMLWVGWYGFNAGSALRMNTIAMQAMLTTTVATAT AMLVWIILDVFFKKNASLLGICSGAVCGLVAITPACGYVTITGSMVIGLVATLASYLFINKVKPIIKIDDTLDAFGCHGI AGIVGSILTGLFASKAVNPTISESGFFEGGSLHLLGIQLGATIFTVIFTVVIVSIVILGLKQIIRMRISKAEEKLRELM |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| BJAB07104_00287 | YP_008207752.1 | Ammonia permease | Not tested | AbaR25 | Protein | 1e-56 | 46 |
| BJAB0868_00291 | YP_008211617.1 | Ammonia permease | Not tested | AbaR26 | Protein | 1e-56 | 46 |
