Name : nrdE (MPUT_0666) Accession : YP_004790507.1 Strain : Mycoplasma putrefaciens KS1 Genome accession: NC_015946 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG0209 EC number : 1.17.4.1 Position : 766211 - 768370 bp Length : 2160 bp Strand : + Note : Identified by match to HMM PF02867.1; identified by match to HMM TIGR02506. DNA sequence : ATGAAAGATAGTAAAGAACTTATATTAGATGATTCTAACGATGAGTACATTAAATTAAATGCTAGATCCAAGATATTTGC AAAGGGTCAAGATAATTTCAAACTAGATGTTCAAGCCGCTAAATCTTATATTACTAATCATATTGAGCCAAGATTAATGC AATTTGATGATCTAAAACAAAGAATCGATTATTTAGTAGCAAATGAATACTACGACAAGCAAATACTAGATAAATATCAA TTTGAAGAAATCACAGAATTAGACGATTATGCTAAATCATTTAATCATTCCTTTCCAAGTTTTATGGGTGCACTAAAATT TTTTAATGCTTATGCTTTAAAAACTTTTGATGGTGAGAAATATCTAGAAACATATACAGATCGTGCTTTAATGAATGCAT TATTTTTAGGTAATGGTAGTTATCAAAAAGCTAAAAATATCTTAAAAAATATTATGTTAGGACGTTTTCAACCTGCAACG CCTACTTTTTTAAATGCCGGTAAAAAGCATAGAGGAGAATATGTTTCATGTTATCTATTAAGAACTGAAGATAATATGGA ATCAATATGTAGAACTATTTCTACTTCTTTACAACTTTCAAAAAGAGGTGGAGGAGTTGCAGTTTGTTTAACTAATTTAC GTGAAACTGGTTCACCTATTAAAAATATTGATGGGTTAAGTTCTGGACCTATTCCGGTTATGAAAATTCTAGAAGATTCA TTTACATATGCTGATCAACTAGGGCAACGTCAAGGAGCTGGAGCAGTTTATATTTCAGCTCATCATCCAGACATTATTTC ATTTTTAGATACTAAAAGAGAAAATGCTGATGAGAAAATCAGAATTAAATCTTTATCACTAGGAGTTGTTATTCCTGATA TTACTTTTGAACTAGCGAGAGAAAATAAAGAAATGGCACTATTTAGTCCTTATGATGTTCAAAAAGTTTATGGAGTTGCA TTATCTGATATTTCAATTACTGAAAAATATTATGAAATGTTAGAAAATCCAAACATTAAAAAAACATTTATAAGTGCTAG AAAATTATTTTTAACAATTGCAGAGTTACATTTTGAAAGTGGTTATCCATACTTATTATTTGAAGATACAGTTAACCGTA GAAATGCTCATGATAAAAAGGGGAGAATTATTATGAGTAACTTATGTAGTGAAATTGTACAAGTAAGTACTCCAAGTCAA TACAATCAAGATTTATCATTTACAAAAATTGGTGAAGATATTTGTTGTAATTTAGGGAGCTTAAACATAGATAAAATGAT GAAGGCTGGTAAAGAATTCGAAGAAGCTGTTGATATTTCAATCACTGCATTAGACGTTGTATCAAGAAATTCTGATTTAG ATTGCGCTCCATCAATTAAATTTGGAAATGCAAATAATCATGCAGTTGGATTAGGAGCAATGAATTTACACGGATTTTTA GCAACTAATGCTATTATGTATGATTCACCTGAAGCTGTTGATTTTACAAATATCTTCTTTTATACACTTGCTTATAATGC CTTTAAAGCTTCAAATAGATTAGCTAAAGAATTTGGAAAATTTAATTCTTTTGATGAGTCAAGATTTGCTGATGGTTCAT GATTTGAAAAATACACAAAATGCCAAGCTGATAAATGAACTCCAGCTACTAAAAAAGTTGAAGAGTTATTTAAGCATTAT CAAGTTGAAATTCCTACACAAACACAATGGATCGAACTAGTTGAAGAGATTAAAAAGACTGGATTAGCAAATTCACACTT AATGGCTGTTGCTCCAACTGGTTCAATTAGTTATTTATCATCATGTACACCTTCTTTACAACCTGTTGTTTCAACAGTTG AAGTTAGAAAAGAAGGAAAACTAGGTAGAGTTTATGTTCCGGCTTATCAAATTAATTTTGATAATATGGGTTATTATGCA GTTGGTGCTTATGAAATGGGTCCAGATCCAATCATTAACATAGCTGCAGCAGCCCAACAGCATGTTGATCAGGCTATTTC ATTAACTTTATTTATGACTGACAAAGCAACAACAAGAGATTTAAACCGTGCTTATATTAATGCCTTTAAACAAGGATGCG CATCAATTTATTATGTAAGGATTCGTCAAGATGTTTTAGAAGATAGCGAAAATTATGAATGTGATGCATGCAAAATTTAG Protein sequence : MKDSKELILDDSNDEYIKLNARSKIFAKGQDNFKLDVQAAKSYITNHIEPRLMQFDDLKQRIDYLVANEYYDKQILDKYQ FEEITELDDYAKSFNHSFPSFMGALKFFNAYALKTFDGEKYLETYTDRALMNALFLGNGSYQKAKNILKNIMLGRFQPAT PTFLNAGKKHRGEYVSCYLLRTEDNMESICRTISTSLQLSKRGGGVAVCLTNLRETGSPIKNIDGLSSGPIPVMKILEDS FTYADQLGQRQGAGAVYISAHHPDIISFLDTKRENADEKIRIKSLSLGVVIPDITFELARENKEMALFSPYDVQKVYGVA LSDISITEKYYEMLENPNIKKTFISARKLFLTIAELHFESGYPYLLFEDTVNRRNAHDKKGRIIMSNLCSEIVQVSTPSQ YNQDLSFTKIGEDICCNLGSLNIDKMMKAGKEFEEAVDISITALDVVSRNSDLDCAPSIKFGNANNHAVGLGAMNLHGFL ATNAIMYDSPEAVDFTNIFFYTLAYNAFKASNRLAKEFGKFNSFDESRFADGSWFEKYTKCQADKWTPATKKVEELFKHY QVEIPTQTQWIELVEEIKKTGLANSHLMAVAPTGSISYLSSCTPSLQPVVSTVEVRKEGKLGRVYVPAYQINFDNMGYYA VGAYEMGPDPIINIAAAAQQHVDQAISLTLFMTDKATTRDLNRAYINAFKQGCASIYYVRIRQDVLEDSENYECDACKI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 54 |