|
Name : LCGT_0303 (LCGT_0303) Accession : YP_004778480.1 Strain : Lactococcus garvieae ATCC 49156 Genome accession: NC_015930 Putative virulence/resistance : Virulence Product : pyruvate-flavodoxin oxidoreductase Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0674 EC number : - Position : 310044 - 313691 bp Length : 3648 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAAAAAAACTATGGATGGGAATATGGCAGCTGCACATGTTGCGTATGCTTTCTCTGAAATTGCAATGATTTACCCCAT TACGCCAAGTTCACCAATGGCTGATTATACAGATGCTTGGTCGATCTCGGGCCGCAAAAACATTTGGGGACAACCTGTAA AACTGAGCGAGATGCAATCAGAAGCAGGTGCTGCTGGGGCTTTGCATGGTGCCATAAAAGCTGGAGCTCTAGCAACAACC TTTACCTCATCTCAGGGGCTTTTATTGATGTTGCCTAATATGTACAAGATGGCAGGAGAACTTCTTCCTGGGGTTATTCA TGTGGCCGCGCGTGCTATTGCAACAGGTGCACTGAATATCTCCGGAGATCATTCGGATGTTATGGCCGCGCGCTCGACAG GTTTTGCCATGTTAGCAGCATCTAGTGTCCAAGAAGTTATGGACTTGTCAGCTGTTTCTCACTTGACAACAATTGAAGCA TCAGTGCCTTTTTTAAACTTTTTTGATGGTTTCCGCACCTCACATGAAATTCAAAAAATTGATGTTCTGGATTACGAAGA TCTGGCACCACTGATTAACCAAGAAAAATTAAGGGCCTTCCGTCAACGTGCGATGAATCCGGATCACCCCAGCGTGTCAG GAACCAATCAGAACGCTGACATCTATTTCCAACAGCGTGAAACGGTTAATCCTTTTTATGAGGAACTTCCTGCACGCGTG CAAAAATATATGCGGGAAATAAATCACTTGCGTGGTACGGACTATGATTTGGTGGATTACTATGGAGCACCAGATGCCGA AGAAGTTATTGTAAGTATGGGATCTGTTGCAGGAACAGTGAGACAAACTGTTGATTACTTGAATCATCAAGGGCGTAAAG TAGGGTTTTTGAATATCCACCTTTATCGTCCATTTCCATCAGAAAACTTTCTCGAAAAACTACCTAAAACCGTAACTTCA CTAGCTGTACTTGATCGGACAAAAGAGGCAGGAAGTAATGCTGAGCCACTTTTACTCGATATTAAAGATCTGCTGTTTGA GCAAAATATTTCTGTTATTGGTGGACGTTATGGTATTGGTGGTAAAGATACGCGCACAGAGCACATTGTGGCAGTTTTCG AACAGTTGAAAAATAAATCTGTGAATCAAAGCTTTACCATCGGTATAGAAGATGATCAGACTCATCTTTCCCTACCGCTT GCAGGGGACTTGGATCTTACTTCAGCGGATACTTATCAAGCAAAATTCTGGGGCTTTGGTTCAGATGGGACCGTGGGCGC GAATAAAGCTGCTATTAAAATTATCGGTGACCATACGGATAAATATGTTCAAGGTGCCTTTGAGTACGATTCGAAAAAAT CAGGTGGATTGACTGTAAGTCATTTGCGTTTTGGCGACAGCCCTATTCAGTCGGAATATATGATTTCGCATCCAAATTTT GTAGCCTGCCATAATACAACTTATGTGCGCCAATATGATTTAACAAAAGGCTTGCGCCCTGGAGGGATTTTCCTCCTCAA TACAAGCTGGACAGATGAACAACTTGACCGAAATTTGCCTGCTCAGCTGAAAAAGTATATTGCGGAAAATGCGATTCGTT TCTACACTATTGATGCTGCAAAAATTGCACAAACTACTGGTTTGGGACGTCGTATTAATACCATCATGCAAGTTGCTTTC TTTAAATTGACCGACATCATGCCCTTTGATAAGGTTTATGAGATTCTTAAAGCGGACGCACAGAAGTATGCCCGCAAATC GCCAAAGATTGTAGAGCAAAACTTACAAGCGATGGAAGCAGCTCTAGATCATTTACATGAAGTAAAAGTACCTGGCTCAT GGATTGAGACAAAAGAAAAAGTTATCACAGCTGCTCCGGCAGATACGGCACGTAAACGCTATGTCTTCAACTTTTTAGAT AAGGTCAATGCCTTTGAGGGAGATCAATTAACTGTTCAGGATGTGGCTACCAATGTAGCAGCAGGAAGCAGTCCACTAGG AATATCTGCTTTCGAAAAACGCGGTATCGCTTTGGAAGTTCCCGAATGGAATGGCGCTGCATGTACACAATGCAACGAAT GTTCTTTTGTCTGTCCACATGCTGCCATTCGTCCTTTCCTCGCGGATGAAGATGAATGGAATGTGGCACCAGAGGGCTTC AGTGTAATGGATTACCGTGGCAAAGACGGACTCAAGTACAGGATTCAAGTCTCCATCGAGGATTGTACAGGCTGCGGTCT CTGCGTGGAAGCTTGTCCGAAAAAAGGGCAAGCCCTAAAAATGGTACCTTATGAAAGTCAAAAAGCACAAGCCATCAACT GGGCGTTTGGGATGACACTTAAGCAAAAGGAAAATCCAGCACGCTCAGGTACAGTCGCTGCTACACAGTTTAACCAACCT CTCTTTGAGTTTTCTGGTGCGTGTTCTGGCTGTGGTGAGACGCCTTATATCAAGCTGCTGACACAGATGTTTGGTGATCG TATGATGATTTCCAATGCTACAGGATGTTCTTCTATTTATGGTGGATCACAGGCTGCGCCTTATGCCACAAACCATGCGG GGCAAGGACCAGCATGGTCAAACTCACTCTTTGAAGATAATGCTGAATACGGTTATGGTATGTGGTTTGCGAGTCAAACA AGACGTCAAAAACTTGCAGCACAAGTTAAAGTTGCCTTACCTGAAATGTCGGATACATTAGCGCAATTAGCTGAAGATTG GGTGGAGCATCTGGAAGATTCTGAAGGTACACGAGCACGTGCAGAAAAGTTCAAAGCCCTGCTCAAAGAAGAAAAAGAAA ATTCAGCTCTCCTGCAAGAAATATACAATGAAAAAGACCAATTTGTAAAACCCACACAGTGGATTTTTGGTGGCGATGGC TGGGCCTATGATATTGGATTTGGTGGTTTGGATCACGTTATTGCCAGCGGTGCAGATGTAAATATCCTCGTTATGGATAA TGAAGTCTATGCCAATACAGGCGGACAGGTTTCCAAAGGGACACCGGCTAGTGCGATTGCGCAGTTTGCTTCCGGCGGAA AGGTTGCTGCGAAGAAGGATCTTGGCTTTATGGCTATGACTTACGGCAATGTTTATGTAGCACAAATCGCAAGTGGTGCA AACATGATGCAAACAATTAAAGCCTTTGATGAAGCGGAAAAACATAATGGCCCTTCTCTCATTATTGCCTACACACCATG TATTACCCATGGCAACTATGAGGGAATGAGCAAGGTGCTTGATGAAGCAAAAGCTGCAGTAAACAGTGGGTATTGGCAAC TTTACCGCTATAATCCAGCACTTGAAGACTTAGGGAAAAATCCTCTCACTCTAGACTTTAAACGTCCAGATTTCGGACAA GTCAGAGAATTGTTGGTGAAGCAATCCCGTTTTGCCAACCTTATGAAAGTCAATGCGGAACAAGCAGAATTGCTTTATGC AAAAGCTGCAGCAGATGCGAAGAAAAAATTCCTACGCTATGCCCGCATGTCAGGAGATTACGAGAAATTTATTGCTCGTG AAGCAAAAAATTTGGATAAAAAAGCCGCGCAGCCGGTTCGTGAAAAAAGAGAACGAAAAGAACGTCCAGTTGATCCTGAG CGTGAAGCAAGACGAGCTGCACGAAAAGCTGCACGTCAAGCAAAATAA Protein sequence : MKKTMDGNMAAAHVAYAFSEIAMIYPITPSSPMADYTDAWSISGRKNIWGQPVKLSEMQSEAGAAGALHGAIKAGALATT FTSSQGLLLMLPNMYKMAGELLPGVIHVAARAIATGALNISGDHSDVMAARSTGFAMLAASSVQEVMDLSAVSHLTTIEA SVPFLNFFDGFRTSHEIQKIDVLDYEDLAPLINQEKLRAFRQRAMNPDHPSVSGTNQNADIYFQQRETVNPFYEELPARV QKYMREINHLRGTDYDLVDYYGAPDAEEVIVSMGSVAGTVRQTVDYLNHQGRKVGFLNIHLYRPFPSENFLEKLPKTVTS LAVLDRTKEAGSNAEPLLLDIKDLLFEQNISVIGGRYGIGGKDTRTEHIVAVFEQLKNKSVNQSFTIGIEDDQTHLSLPL AGDLDLTSADTYQAKFWGFGSDGTVGANKAAIKIIGDHTDKYVQGAFEYDSKKSGGLTVSHLRFGDSPIQSEYMISHPNF VACHNTTYVRQYDLTKGLRPGGIFLLNTSWTDEQLDRNLPAQLKKYIAENAIRFYTIDAAKIAQTTGLGRRINTIMQVAF FKLTDIMPFDKVYEILKADAQKYARKSPKIVEQNLQAMEAALDHLHEVKVPGSWIETKEKVITAAPADTARKRYVFNFLD KVNAFEGDQLTVQDVATNVAAGSSPLGISAFEKRGIALEVPEWNGAACTQCNECSFVCPHAAIRPFLADEDEWNVAPEGF SVMDYRGKDGLKYRIQVSIEDCTGCGLCVEACPKKGQALKMVPYESQKAQAINWAFGMTLKQKENPARSGTVAATQFNQP LFEFSGACSGCGETPYIKLLTQMFGDRMMISNATGCSSIYGGSQAAPYATNHAGQGPAWSNSLFEDNAEYGYGMWFASQT RRQKLAAQVKVALPEMSDTLAQLAEDWVEHLEDSEGTRARAEKFKALLKEEKENSALLQEIYNEKDQFVKPTQWIFGGDG WAYDIGFGGLDHVIASGADVNILVMDNEVYANTGGQVSKGTPASAIAQFASGGKVAAKKDLGFMAMTYGNVYVAQIASGA NMMQTIKAFDEAEKHNGPSLIIAYTPCITHGNYEGMSKVLDEAKAAVNSGYWQLYRYNPALEDLGKNPLTLDFKRPDFGQ VRELLVKQSRFANLMKVNAEQAELLYAKAAADAKKKFLRYARMSGDYEKFIAREAKNLDKKAAQPVREKRERKERPVDPE REARRAARKAARQAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | AFJ97267.1 | pyruvate ferredoxin | Virulence | Not named | Protein | 0.0 | 49 |
