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Name : LCGT_1848 (LCGT_1848) Accession : YP_004780025.1 Strain : Lactococcus garvieae ATCC 49156 Genome accession: NC_015930 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : - Position : 1835750 - 1838365 bp Length : 2616 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGAAAACAAGAAAAATAAATTACTGCTTATTGATGGATCTTCATTAGCATTTCGGGCTTTTTTTGCCCTCTATAATCA GGTAGATCGTTTTGTGGCTCCAAGTGGCTTACATACCAATGCGATCTATGGTTTTCATCTTATGCTTAATAATTTGGTCG AAAGATTAGAACCTAATCATGTTCTGATTGCATTTGATGCAGGAAAAACAACTTTTAGAACGGAAATGTTCGCTGCTTAC AAAGATGGGCGGGCACGTACACCGGATGAATTCCGTGAACAGCTGCCCTTTATTAAGGAGCTGATTGAAAAGTTAGGCTA TAATCATTATGAGCTTAAAAACTATGAAGCAGATGACATTATTGGTACTTTAGACAAAATGGCTGAACTCCCTGAAGCTG GTGATTATGATGTCACAATCGTAACTGGGGATAAGGATTTGATTCAGTTAGTGGATTCCAATACGACAGTGGAAATTTCG AAGAAAGGCGTCGCTGAGTTTGAAAGCTTCACACCTGCTTATTTAATGGAAAAAACGGGCTTAACCCCACAACAGTTTAT TGATCTTAAAGGTTTGATGGGGGATAGTTCGGATAATTATCCAGGAGTAACAAAAGTCGGTGAAAAGACGGCCTTGAAGT TGCTTCAAGAGTGGGGTTCTATCGATAATCTCTATGAGAATATTAATTCACTTAAGAAAAGTAAGATGAAGGAAAATCTT ATTGCTGACCGTGAAATGGCCTTTTTATCTCGTACTCTTACAACGATTGATACGAAATCTCCAATTGAAATTGATCTTGC TGATACTTTGATTAAACCTGTGGATGCAGCAGAGTTGATCAAGTTTTATGATGAGATGGGATTTGCGCAATTCAAAGCCA AACTTGAAACGGCAGAGGCTGATGAGGTTACACTTAGCTTTGAAGTTGTGGAAGAAGCAGCAGACATTTTAGTGGACAAA GACGATTTCTTTTATATCGAAATTTTAAATGAAAATTACCACAAAGAAGAAATCATTGGCTTTGCTTGGGGAAATGAAGA AAAAGTTTTTGTCTCGAAGAATACAGAACTCTTAAAGCATTTTGTCTTTCCGGAAAATACATACGATTTTAAGAAAAATA AAGTTTTGCTTCATCGCTTAGGTATTGAACTACCGACAGCCAAGTACGACAGTATGTTAGCTAAATATCTTATTTCTACA ACGGAAGATAATAAGGTTGAAACGATTGGTCGATTATTTGCCAACAAGTATATATCTACAGATGAAGAAGTTTACGGCAA AGGAGCAAAACGTCGTATCCCTGAAGATGAAATTCTATTCAAACATTTGGCAGGAAAAATCCATGTCTTGGCCACAACGA AAGCAGTAATGATTCAAAATCTCGAGGAAAATGAACAGTATCATCTTCTGACGGAAATGGAATTACCCCTGGCCAACGTG CTAGCTAAAATGGAAATAGCAGGAATAGCTGCTGAAGTGAGCACCTTAGAAGAAATTGGTGCGGCAAATCAAAATCTGAT TGCTGATTTAACTGAACAAATTTATGCACTTGCAGGTGAAGAATTTAATATCAACTCACCTAAACAACTTGGAGTCATTC TTTTTGAAAAATTACAGTTGCCGCATGGGAAAAAAACAAAGACAGGCTATTCAACAGCAGCAGATATTTTAGAAAACTTG GCTCAAGATTATGAATTAGTGGCCAAAATACTCGAATATCGTCAAATCTCAAAAATTCAATCCACTTATGTGCAAGGTTT GATTCCGCAAATAGCCGAAGATGGACGTATCCATACACGATATGTACAGGATTTAACCCAAACAGGGCGTCTCTCCTCGA TTGATCCAAATCTGCAGAATATTCCAGTACGCTTAGAAGCCGGACGCTTGATTCGCAAAGCTTTTGTAGCTGCTGAAAAT AACATTCTGTTAAGTTCCGACTATTCACAAATTGAACTTCGGGTTTTGGCACATATGTCTAAAGACGAACATCTTATTGA TGCCTTTAATCATGGCGCTGACATTCATAGCAGTACAGCAATGCGTGTTTTCAACATAGATAAGCCCGAAAATGTTACGC CTAATGATCGTCGCAATGCGAAAGCTGTCAATTTTGGTATCTCCTATGGAGAAACAGAATACGGACTCGCTAAACGCTTG AGTATTTCCAATAAGGAAGCAGCAGAGATGATCCAAGCATACTTTGAACGTTATCCAGGAGTGGCAAATTATATAGCAGA AACAAAACGTGAAGCCAAGGATAAAGGTTACGTAAGCACGATGTTTAACCGCCGGCGTAAACTGCCAGAAATCAATAATC GCAACTTCATGGTGCGTCAGGGTGCAGAACGTCAAGCTATTAATGCCCCAATTCAAGGGTCAGCCGGCGATATCTTGAAA ATTGCCATGATTAACCTCGATGCAGCATTGTCAGAAGGCAAGTTTAAAGCCAAATTGTTGCTGCAAGTTCACGATGAGAT TATTCTTGAAGTACCTAAGGAAGAACTTACGGCGGTTCAAACCTTGGTGAAACAAACCATGGAATCTGCGGTCGAGTTAA ACGTTCCTTTAATTGCAGATGAAAATACGGGCGACAGCTGGTATGAAGCAAAATAA Protein sequence : MENKKNKLLLIDGSSLAFRAFFALYNQVDRFVAPSGLHTNAIYGFHLMLNNLVERLEPNHVLIAFDAGKTTFRTEMFAAY KDGRARTPDEFREQLPFIKELIEKLGYNHYELKNYEADDIIGTLDKMAELPEAGDYDVTIVTGDKDLIQLVDSNTTVEIS KKGVAEFESFTPAYLMEKTGLTPQQFIDLKGLMGDSSDNYPGVTKVGEKTALKLLQEWGSIDNLYENINSLKKSKMKENL IADREMAFLSRTLTTIDTKSPIEIDLADTLIKPVDAAELIKFYDEMGFAQFKAKLETAEADEVTLSFEVVEEAADILVDK DDFFYIEILNENYHKEEIIGFAWGNEEKVFVSKNTELLKHFVFPENTYDFKKNKVLLHRLGIELPTAKYDSMLAKYLIST TEDNKVETIGRLFANKYISTDEEVYGKGAKRRIPEDEILFKHLAGKIHVLATTKAVMIQNLEENEQYHLLTEMELPLANV LAKMEIAGIAAEVSTLEEIGAANQNLIADLTEQIYALAGEEFNINSPKQLGVILFEKLQLPHGKKTKTGYSTAADILENL AQDYELVAKILEYRQISKIQSTYVQGLIPQIAEDGRIHTRYVQDLTQTGRLSSIDPNLQNIPVRLEAGRLIRKAFVAAEN NILLSSDYSQIELRVLAHMSKDEHLIDAFNHGADIHSSTAMRVFNIDKPENVTPNDRRNAKAVNFGISYGETEYGLAKRL SISNKEAAEMIQAYFERYPGVANYIAETKREAKDKGYVSTMFNRRRKLPEINNRNFMVRQGAERQAINAPIQGSAGDILK IAMINLDAALSEGKFKAKLLLQVHDEIILEVPKEELTAVQTLVKQTMESAVELNVPLIADENTGDSWYEAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 64 |
