Name : SFBM_0266 (SFBM_0266) Accession : YP_004770787.1 Strain : Candidatus Arthromitus sp. mouse isolate Genome accession: NC_015913 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : - Position : 291390 - 293963 bp Length : 2574 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGAAAGGGTTTTAATATTAGATAGTAATAGTATTTTAAATAGGGCTTTTTATGCTCTTCCACTTCTTAGCTGTTCTGA AGGAATACATACTAATGGAATACTTGGATATTTGACGATGTTTTTTAAAATGCAGGAAGAATTTAATGCTACATATGTGA TTGCAACTTTTGATAGAAAGGCTAAGACATTTAGACATTTGGAGTATAGTAACTATAAATCTGGTAGAAAATCTATGCCT AATGAATTATTTGAGCAACTTGAACCACTAAAAGAAATATTAAAAGCAATGAATATAAATATTTTTGAGCTCGATGGTTT TGAGGCTGATGATTTAATAGGAACATTGTCAAGAATATATGAGGAAGAAGGATTTGAACCTATAATAGTTACAGGGGATA AAGATGCACTTCAGCTTAGTTCAAGTATAACAAAAGTAATTATAACAAAAAAAGGTATAACAGATAAAGAAGTTTATAAT GAAGAAAAGATGATTGAGGTATATGGAGTAACTCCAACTGAGTTTATAGATGTTAAGGCTATTATGGGTGATAAATCTGA TAATATTCCAGGTGTTTCTGGTATTGGAGAAAAGGGAGCAATTTCTTTAATAAAAGAGTTTAAGAGTATTGAAAATCTTT ATGAGAATTTAGAATGTTTAAAGGAAGGTAAAATTAAAAAGAATTTAATAGAAGGAATGGAGTCGGCTTTTTTATCGAAG AAATTGAGTAAGATAAATAGATTTGTACCCATTGATTTTTCTTTGAATGATATGAAAGTTTATAGTGAGTTAGACCACTT AAGAGTGTATGAATTATATAATAAATATGAATTGAAGTCTTTATTGAATAAAATAAATTCAAATAATGAGTCTTATGAAA TATTAGTTAATGAAATTTCTAGTACAGAAGATTTAACAGATTTATTAAATAAGATATATAATTCTAATTGTAATTTGTAT ATTTATTGTGATGTTTTAGGCAATAAGGTTTCTGAGATGCATTTTGGGAATATGTATATTAATTTTAATAATGAAAATTA CATATTGAAAGAGAATTTTATATGCGAAAATTTTGATGATGTGAGTAGGATTTTTTCTTCTAAGAATGATAAAATATGTT TTGATTCAAAAATGATACATAAAGTTATGCTTATAAATGGTAAAGAAGTAAATAATATAATTTTTGATTTGGTTATAGGG GATTATTTATTAAAACCAGGTAGGGAACGCACTCTTATAAGTTTGTGCAGGGATTATGTATCTGTATCTTTAGATGAGGA TGATACTTGTTTAGCAGTTTCATTTTTTGAAGATATCTATAAAACTATTTTAAATAAAATAGATAAATGCAATATGAGAG AACTTTATTTTGAAATCGAACATTTATTATCTCCAATTTTAGCTAGTATTGAATTAGAAGGATTTAGGGTTTCTGTTGAG ATGTTAGGAGAATTGAAGGAGAAGTTTGATATAAAAATAAAGGAACACTCTGAAAAAATATATAGTTTATCAGGCGAAGT ATTTAATATTAATTCTCCTAAGCAATTAGGTAAGATACTATTTGAAAAGCTGGATTTACCAGTTATAAGGAAGACTAAGA CTGGGTATTCAACTAATGCTGAAGTTTTAGAAGCTTTAATGGACAAACATGAGATTATAGAGGAAATTGTAAATTATAGA CAGATAACAAAGCTACAATCAACTTACATACTTGGACTTATGGATGTTATAGATTATGATTTTAAAGTTCATACATCTTT TAATCAAACATTAACAGCTACAGGAAGATTATCTAGTGTAGATCCTAATCTTCAGAATATACCTATTAAATATCCTCTAG GTCGAGAAATAAGAAAAGCATTTATTGCGGAGAAAAATAGCTATATATTATCTGCTGATTATTCTCAAATTGAACTTAGA ATGCTTGCGCATATATCAGAAGATGATAATATCATAAAAGCATTTAGAGAAAATTTAGATATTCATAAAATGACTGCATC AGAGATTTTTTCTGTTGATGAAGATGATGTAACAAGTGAGATGAGAAATAAGTGTAAGGCTGTTAATTTTGGAATTATAT ATGGAATAAGTGATTTTGCTTTATCTAATGATTTGAAGATATCTAAAAAAGAAGCTAGAGAGTATATGGATAGGTATTTT AATAGATATGTTGGGGTTAAGAGATATCTAGATGAAATCGTAGTTAAGGCCAAGAAAGATGGTTTCGTGACAACTATTTT TAATAGGAGAAGGGATATTCCTGAGATAAAGTCATCTAATAAAATTATAAGATCTCTTGGAGAAAGACTTGCTATGAATA CACCTATACAAGGCAGTGCTGCTGATATAATAAAACTTGCCATGATAAAAGTTTACAATAGGTTAAATGAAGAAAATTTA AAATCTAAAATAATACTTCAGGTTCATGATGAACTTGTGCTAAATGTGTATGAAGATGAGATTGATAGGGTATCTTTAAT AGTTAAGGAAGAAATGGAATTATGCTATGATGGGATATTAGTTCCATTGAGTATTAATTTATCTTATGGAAAAAATTGGT TTGAAGCGAAGTAG Protein sequence : MERVLILDSNSILNRAFYALPLLSCSEGIHTNGILGYLTMFFKMQEEFNATYVIATFDRKAKTFRHLEYSNYKSGRKSMP NELFEQLEPLKEILKAMNINIFELDGFEADDLIGTLSRIYEEEGFEPIIVTGDKDALQLSSSITKVIITKKGITDKEVYN EEKMIEVYGVTPTEFIDVKAIMGDKSDNIPGVSGIGEKGAISLIKEFKSIENLYENLECLKEGKIKKNLIEGMESAFLSK KLSKINRFVPIDFSLNDMKVYSELDHLRVYELYNKYELKSLLNKINSNNESYEILVNEISSTEDLTDLLNKIYNSNCNLY IYCDVLGNKVSEMHFGNMYINFNNENYILKENFICENFDDVSRIFSSKNDKICFDSKMIHKVMLINGKEVNNIIFDLVIG DYLLKPGRERTLISLCRDYVSVSLDEDDTCLAVSFFEDIYKTILNKIDKCNMRELYFEIEHLLSPILASIELEGFRVSVE MLGELKEKFDIKIKEHSEKIYSLSGEVFNINSPKQLGKILFEKLDLPVIRKTKTGYSTNAEVLEALMDKHEIIEEIVNYR QITKLQSTYILGLMDVIDYDFKVHTSFNQTLTATGRLSSVDPNLQNIPIKYPLGREIRKAFIAEKNSYILSADYSQIELR MLAHISEDDNIIKAFRENLDIHKMTASEIFSVDEDDVTSEMRNKCKAVNFGIIYGISDFALSNDLKISKKEAREYMDRYF NRYVGVKRYLDEIVVKAKKDGFVTTIFNRRRDIPEIKSSNKIIRSLGERLAMNTPIQGSAADIIKLAMIKVYNRLNEENL KSKIILQVHDELVLNVYEDEIDRVSLIVKEEMELCYDGILVPLSINLSYGKNWFEAK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 4e-141 | 41 |